肌球蛋白IXB; MYO9B
- 肌球蛋白,大鼠,同源物;MYR5
HGNC 批准的基因符号:MYO9B
细胞遗传学位置:19p13.11 基因组坐标(GRCh38):19:17,075,777-17,213,286(来自 NCBI)
有关肌球蛋白的背景信息,请参见 MYO1A(601478)。
▼ 克隆与表达
沃斯等人(1996)从肝脏和小肠文库中分离出编码人肌球蛋白 IXB ( MYO9B )的 cDNA 。cDNA 编码 2,022 个氨基酸的蛋白质,预测质量为 229 kD。与其他肌球蛋白一样,MYO9B包含一个 N 端头部或运动结构域、一个包含 4 个串联重复 IQ 基序的颈部结构域和一个大的 C 端尾部。与传统的肌球蛋白相比,MYO9B头部区域包含几个不寻常的插入,尾部区域包含一个推定的 GTP 酶激活蛋白结构域以及推定的锌和二酰甘油结合结构域。MYO9B及其大鼠同源物 myr5 在 N 和 C 末端具有显着序列差异的区域。沃斯等人(1996)表明大鼠和人类 cDNA 可能代表替代剪接变体。Northern 印迹分析表明,该基因以 8 kb 转录本的形式表达,在外周血白细胞中观察到最高水平的表达,在胸腺和脾脏中观察到中等水平的表达。沃斯等人(1996)发现TPA 诱导 HL-60 骨髓细胞分化为巨噬细胞样细胞后, MYO9B蛋白的表达增加了 4.7 倍。沃斯等人(1996)表明MYO9B可能在骨髓细胞中基于肌动蛋白的过程中发挥作用。
波斯特等人(1998)鉴定了MYO9B的一个长变体,它取代了 Wirth 等人报道的序列的最后 99 个氨基酸(1996)具有不同的 228 个氨基酸 C 端结构域。免疫印迹分析显示 240-和 228-kD 蛋白质的表达。
▼ 测绘
巴勒等人(1997)使用荧光原位杂交将MYO9B基因定位到染色体 19p13.2-p13.1。粘粒作图进一步细化该定位至 19p13.1,距 MEL 基因 ( 165040 )近端约 800 kb ,距 ERBAL2 ( 132880 ) 基因远端约 100 kb。
▼ 基因功能
Post 等人的免疫印迹分析(1998)表明MYO9B通过位于其颈部区域的IQ基序结合钙调蛋白(CALM1;114180 )。功能分析表明,MYO9B是一种主动马达,与其他含有 CALM1 的肌球蛋白一样,在没有钙的情况下表现出肌动蛋白丝的最大速度。波斯特等人(1998)得出结论,MYO9B含有钙调蛋白轻链,是一种钙调节的机械化学活性马达,具有 RHOGAP(参见602732)活性。
井上等人(2002)确定MYO9B是一种单头肌球蛋白,作为负端定向马达在肌动蛋白丝上持续移动。因此,与 MYO6 ( 600970 ) 一样,MYO9B也向相反方向移动。波斯特等人(2002)还进行了功能分析并得出结论,MYO9B是单头的,并且与 MYO5A ( 160777 ) 一样,是一种基于肌动蛋白的加工运动。
Saeki 等人使用酵母 2-杂交分析、免疫共沉淀分析和体外 Pull-down 分析(2005)发现大鼠和人 BIG1 (ARFGEF1; 604141 ) 结合MYO9B的尾部结构域。BIG1 和MYO9B以 1 对 1 的化学计量结合,突变分析表明 BIG1 与MYO9B的锌指/GAP 结构域特异性结合。BIG1 与MYO9B的结合干扰 RhoA ( 165390 ) 与MYO9B的结合,并以剂量依赖性方式抑制MYO9B的 Rho-GAP 活性。同样,RhoA 抑制 BIG1 与MYO9B的结合。
▼ 分子遗传学
乳糜泻 ( 212750 ) 是最了解的免疫相关疾病之一,出现在小肠中,是由多个基因和麸质(触发环境因素)之间的相互作用引起的。蒙苏尔等人(2005)报道了乳糜泻与位于MYO9B基因 ( 602129.0001 ) 内含子 28 的常见变异之间的显着且可复制的关联。MYO9B编码的非常规肌球蛋白分子在上皮肠上皮细胞肌动蛋白重塑中发挥作用。风险等位基因纯合的个体患乳糜泻的风险高出 2.3 倍。结果表明,乳糜泻的病因主要是肠道屏障受损,这可能解释了为什么免疫原性麸质肽能够穿过上皮屏障。
▼ 等位基因变异体( 1 选定示例):
.0001 乳糜泻,易感性,4
MYO9B、IVS28、GA
蒙苏尔等人(2005)发现rs2305764的 A 等位基因的存在会导致乳糜泻的较高风险 (CELIAC4; 609753 ),与位于 19 kb 区域的其他 5 个 SNP 的变化无关。该 SNP 位于MYO9B基因的 3 部分。与其他肌球蛋白类别相比,IX 类肌球蛋白分子是独特的,因为它们的尾部含有 Rho-GTP 酶激活结构域。这种 GTPase 活性将活性 Rho-GTP 转化为非活性 Rho-GDP,从而下调 Rho 依赖性信号通路。Rho 家族 GTP 酶参与细胞骨架的重塑和紧密连接组装,这两者都会导致上皮细胞旁细胞通透性增强。蒙苏尔等人(2005)推测MYO9B 3-prime 部分的遗传变异导致与 RhoA ( 165390 )的相互作用受损,从而扰乱紧密连接步态和栅栏功能。因此,微妙的、潜在的肠道屏障异常可能涉及乳糜泻的病因学,这与组织学正常的乳糜泻个体的肠道通透性观察结果一致(例如,Smecuol等,2005)。