ATP 结合框,亚科 C,成员 12; ABCC12

  • 多药耐药相关蛋白 9; MRP9

HGNC 批准的基因符号:ABCC12

细胞遗传学位置:16q12.1 基因组坐标(GRCh38):16:48,080,882-48,155,993(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

塔穆尔等人(2001) 使用 ABC 转运蛋白序列作为查询,通过数据库分析鉴定了 ABCC12 和 ABCC11(607040)。 推导的 1,359 个氨基酸的 ABCC12 蛋白包含 2 个 ATP 结合域和 2 个跨膜区。 它与 ABCC5(605251) 具有 42% 的氨基酸序列同一性。 16 个组织组的 PCR 显示仅在睾丸、卵巢和前列腺中表达。

薮内等人(2001) 通过 BAC 克隆的数据库分析鉴定了假定的 ABC 转运蛋白后,从成人肝脏 cDNA 文库中克隆了 ABCC12。 推导的 1,359 个氨基酸蛋白与 ABCC11 具有约 47% 的同一性,并包含 12 个假定的跨膜结构域。 对多种人体组织的 PCR 分析显示其表达几乎无处不在。 作者在成人肝脏、胰腺、睾丸和胎儿胸腺的 cDNA 文库中鉴定出了 4 个 ABCC12 剪接变体。 他们将这些变体命名为 A、B、C 和 D,它们的 N 末端部分与全长蛋白质相同。 外显子 19 之后,外显子跳跃和选择性剪接导致变体后半部分的缺失并添加终止密码子。 变体 A、B 和 D 分别编码 1,009、935 和 1,009 个氨基酸的蛋白质。 它们仅包含 8 或 9 个跨膜结构域,并且缺少带有第二个 ATP 结合框的 C 端结构域。 变体C的cDNA包含2个开放解读码组,分别编码1,009和331个氨基酸的蛋白质。 通过对大量 ABCC12 cDNA 克隆进行序列分析,Yabuuchi 等人(2001)确定剪接变体的表达显着超过全长克隆的表达。

贝拉等人(2002) 从睾丸 cDNA 文库中克隆了 ABCC12 的一个变体,他们将其称为 MPR9。 序列分析表明MPR9由26个外显子组成,与Tammur等人报道的序列相比(2001),它缺少外显子 5、16 和 26,并在外显子 22 处显示选择性剪接,从而产生终止密码子。 推导的 930 个氨基酸的蛋白质包含 8 个跨膜结构域和一个核苷酸结合结构域。 他们还发现了一个编码推导的 233 个氨基酸蛋白质的小变体,该变体是由于使用了外显子 23 处的替代转录起始位点而产生的,其中包含较长序列中缺失的核苷酸结合域。 通过斑点印迹分析和 PCR,Bera 等人(2002)检测到睾丸、胰腺、卵巢、骨骼肌和各个脑区的表达。 使用变体特异性探针进行的 Northern 印迹和点印迹分析显示,在睾丸、正常乳腺癌和乳腺癌组织中表达了 4.5 kb 转录物,在大脑、骨骼肌和卵巢中表达了 1.3 kb 转录物。 正常和癌性乳腺组织的原位杂交显示肿瘤细胞的染色更强。

▼ 基因结构

塔穆尔等人(2001)确定ABCC12基因包含29个外显子。 他们发现ABCC11和ABCC12基因串联定位,相距约200 kb,5-prime末端面向着丝粒。

薮内等人(2001) 确定 ABCC12 基因跨度为 63 kb,ABCC11 和 ABCC12 之间的间隔约为 20 kb。

▼ 测绘

塔穆尔等人(2001) 通过辐射杂交分析和 BAC 克隆中 ABCC12 的存在,将 ABCC12 基因定位到染色体 16q12.1。 他们表示,ABCC11 和 ABCC12 基因的染色体定位、潜在功能和表达谱使它们成为阵发性运动源性舞蹈手足徐动症(PKC;128200)和伴有阵发性舞蹈手足徐动症的婴儿惊厥(ICCA;602066)的有希望的候选者。