短链脱氢酶/还原酶家族,成员 4; DHRS4
- SDR 家族,成员 4
- NADPH 依赖性视黄醇脱氢酶/还原酶;NRDR
HGNC 批准的基因符号:DHRS4
细胞遗传学位置:14q11.2 基因组坐标(GRCh38):14:23,953,770-23,969,279(来自 NCBI)
▼ 描述
短链脱氢酶/还原酶,如 DHRS4,是 NAD/NADP 依赖性氧化还原酶,可分解类固醇、类维生素A、前列腺素和异生素。DHRS2 在细胞周期和细胞凋亡的调节中也具有非催化作用(Gabrielli 和 Tofanelli 总结,2012)。
▼ 克隆和表达
通过在数据库中搜索大鼠 Dhrs4 的同源物,Fransen 等人(1999) 鉴定了人类 DHRS4 的 3 个变体,他们将其称为 SDR-SRL,因为该蛋白属于短链脱氢酶/还原酶(SDR) 家族,并且具有 C 端 SRL 过氧化物酶体靶向序列。荧光标记的大鼠 Dhrs4 定位于转染的中国仓鼠卵巢细胞中的过氧化物酶体。
Du 等人通过 RT-PCR 和 RACE 检测人肝脏 cDNA 文库(2004) 克隆了全长 DHRS4,他们将其称为 NRDR,以及缺少外显子 4、5 和 6 的较短变体。两种推导的蛋白质都包含经典的乙醇脱氢酶(ADH) 短结构域,即短链 ADH(SCAD)基序、磷酸化和脂肪酰化位点以及过氧化物酶体靶向信号。RT-PCR 在大多数检查组织中检测到两种转录物的可变表达。
Song 等人通过 HeLa 细胞 cDNA 文库的 RT-PCR 和 RACE 进行了研究(2007) 克隆了全长 NRDR 和缺乏外显子 3 的变体,他们将其称为 NDRRB1。推导的 NRDR 和 NRDRB1 蛋白的计算分子量分别为 29 和 27 kD。宋等人(2007)在26例宫颈癌组织中检测到NRDRB1 mRNA表达,其中14例(53.9%),而在12例正常宫颈组织中未检测到表达。免疫组织化学分析仅在肿瘤组织中检测到NRDRB1蛋白。在正常和肿瘤性宫颈组织中均观察到全长 NRDR mRNA,但 NRDR 蛋白仅在正常宫颈上皮中表达,且定位于过氧化物酶体中。
Gabrielli 和 Tofanelli(2012) 报道,全长 DHRS4 蛋白含有 278 个氨基酸。
▼ 基因结构
Du 等人(2004)确定DHRS4基因含有8个外显子。
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通过基因组序列分析进行绘图,Du 等人(2004) 将 DHRS4 基因定位到染色体 14q11.2。
▼ 基因功能
Gabrielli 和 Tofanelli(2012) 指出 DHRS2(615194) 和 DHRS4 底物结合位点的差异与不同的底物特异性相关。一般来说,DHRS4 比 DHRS2 接受更广泛的底物。
长非编码 RNA AS1DHRS4(DHRS4AS1; 616925) 的基因位于 DHRS4 的相反链上,并且这些基因的 5 引物末端重叠。Li 等人使用定量 RT-PCR(2012) 发现 DHRS4 和 AS1DHRS4 在所有检查的人类正常细胞系和癌细胞系中反向表达。通过小干扰 RNA 沉默 AS1DHRS4 会增加 DHRS4 的 mRNA 和蛋白质表达,并增加 DHRS4L1(615195) 和 DHRS4L2(615196) 的 mRNA 表达。染色质免疫沉淀(ChIP) 分析显示,AS1DHRS4 的敲除使 DHRS4 基因簇的染色质状态从封闭、非活性状态变为开放、活性状态。RNA 免疫沉淀分析和 ChIP 显示 AS1DHRS4 与组蛋白甲基转移酶 G9A(EHMT2; 604599) 和 EZH2(601573) 以及组蛋白 H3(参见 602810)二甲基 lys9(H3K9me2) 和三甲基 lys27(H3K27me3) 相互作用。RNA ChIP 分析显示 DHRS4 基因簇抑制涉及 AS1DHRS4 外显子 2 和 DHRS4 簇前 mRNA 外显子 1 之间的 RNA-RNA 相互作用。李等人(2012) 得出结论,AS1DHRS4 抑制 DHRS4 的顺式表达,因为这两个基因位于同一等位基因上,但 AS1DHRS4 必须易位到 DHRS4L1 和 DHRS4L2 基因才能抑制其表达。
▼ 进化
Gabrielli 和 Tofanelli(2012) 发现 DHRS2 和 DHRS4 位于 14 号染色体上,彼此相距 315 kb 以内,起源于 DHRS4 基因的复制,该复制发生在哺乳动物进化枝形成之前。DHRS2 比 DHRS4 基因进化得更快,并且在更多位点上经历了正选择。正选择的DHRS2位点主要位于酶活性位点。另外两个重复的 DHRS4 基因 DHRS4L2 和 DHRS4L1 分别位于 DHRS4 下游 20 kb 和 47 kb 处。