微RNA 93; MIR93
miRNA93
MIRN93
HGNC 批准的基因符号:MIR93
细胞遗传学位置:7q22.1 基因组坐标(GRCh38):7:100,093,768-100,093,847(来自 NCBI)
▼ 说明
MicroRNA(miRNA),例如 MIR93,是短非编码 RNA,通过结合靶 mRNA 3 素 UTR 中的互补序列并抑制其翻译或诱导其降解来调节基因表达(Petrocca 等,2008)。
▼ 克隆与表达
通过序列分析,Ivanovska 等人(2008) 鉴定了 18 个 miRNA 为 MIR106B(612983) miRNA 家族的成员,其中包括 MIR93。 MIR93 的种子区域(核苷酸 1 至 7)与 MIR106B 的种子区域(核苷酸 2 至 8)相同。
▼ 基因功能
彼得罗卡等人(2008) 发现 MCM7(600592) 以及 miRNA 的前体 MIR106B、MIR93 和 MIR25(612150),所有这些都源自 MCM7 基因的内含子 13,在 10 个人类胃肿瘤中的 5 个中过度表达,且几乎完全相关。 在同步人胃癌细胞系进入 G1 期后,会诱导含有 MCM7、MIR106B、MIR93 和 MIR25 的前体 RNA 积累,并且与主细胞周期调节因子 E2F1 的表达相关(189971)。 E2F1 转录物的 3-prime UTR 包含 MIR106B 和 MIR93 结合位点,表明 E2F1 在负反馈环中受到这些 miRNA 的调节。 过表达、敲低和突变研究证实 E2F1 是 MIR106B 和 MIR93 的靶标。 此外,胃癌细胞中 MIR106B、MIR93 和 MIR25 的过表达通过干扰 p21(CDKN1A;116899) 和 BIM(BCL2L11;603827)(两个最下游的蛋白)的合成来降低细胞对 TGF-β(TGFB1;190180) 的反应。 分别是TGF-β依赖性细胞周期停滞和细胞凋亡的效应器。 彼得罗卡等人(2008) 得出结论,MIR106B-MIR93-MIR25 簇由 E2F1 激活并在人类腺癌中上调,改变胃癌细胞对 TGF-β 的反应,影响细胞周期停滞和细胞凋亡。
伊万诺夫斯卡等人(2008) 发现,与邻近的正常组织相比,几种 MIR106B 家族成员(包括 MIR93)的表达在多种人类肿瘤中上调。 微阵列分析表明,MIR93 表达与 DNA 复制调节因子相关,而 MIR106B 表达与 DNA 复制和有丝分裂调节因子相关。 用合成 RNA 双链体转染人类细胞来模拟 miRNA,结果显示 MIR106B(而非 MIR93)增加了 S 期细胞的数量。
人类 T 细胞淋巴病毒 1(HTLV-1) 是一种逆转录病毒,可转化人类 T 细胞,并在 30 至 60 年的潜伏期后引起成人 T 细胞白血病(ATL)。 杨等人(2008) 发现 MIR130B(613682)、MIR93 和 MIR18A(609417) 在 ATL 细胞系、ATL 患者的急性白血病外周血单核细胞(PBMC) 以及佛波酯激活的 PBMC 中普遍上调。 TP53INP1(606185) 是 MIR93 和 MIR130B 的 5 个假定目标之一。 将针对 MIR93 和 MIR130B 的 antagomir 转染至 HTLV-1 转化的 T 细胞系中,可增加 TP53INP1 的表达并增强细胞活力。 相反,引入MIR93和MIR130B的siRNA代表减少了基于TP53INP1 3-prime UTR的报告基因的表达。
▼ 测绘
彼得罗卡等人(2008) 报道,MIR106B、MIR93 和 MIR25 基因对应到染色体 7q22,并以 5 素数到 3 素数方向聚集在 MCM7 基因的内含子 13 内。
▼ 动物模型
DICER1(606241) 被认为介导哺乳动物中所有 miRNA 的加工。 大冢等人使用基因陷阱方法(2007) 获得了 Dicer1 功能缺陷的小鼠,但由于 Dicer1 表达低效,它们没有经历胚胎致死。 对这些小鼠腹膜巨噬细胞中病毒生长的分析表明,它们对水泡性口炎病毒(VSV) 和单纯疱疹 1 病毒易感,但对其他测试的病毒不敏感。 对 VSV 的易感性既不是由于 VSV 细胞进入增加,也不是由于 I 型干扰素(例如 IFNA;147660)产生或 IFN 反应的缺陷。 对转染含有 VSV 序列的质粒的小鼠巨噬细胞系进行报告基因分析表明,在细胞系和腹膜巨噬细胞中表达的 miR24(参见 609705)和 miR93 靶向编码病毒 RNA 依赖性聚合酶的 VSV 基因,并且 分别是聚合酶辅因子。 进一步分析表明,miR24 和 miR93 抑制小鼠巨噬细胞中的 VSV 增殖。 缺乏 miR24 和 miR93 靶位点的 VSV 在野生型小鼠中比野生型 VSV 更具致病性。 大冢等人(2007) 得出结论,由于 Dicer1 缺陷导致 miR24 和 miR93 产生受损,导致对 VSV 的易感性增加。