成牙细胞相关蛋白; ODAM
- APIN
HGNC 批准的基因符号:ODAM
细胞遗传学位置:4q13.3 基因组坐标(GRCh38):4:70,195,725-70,204,576(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
钙化性上皮性牙源性肿瘤(CEOT)的特征是鳞状细胞增殖、钙化和淀粉样蛋白沉积。 Solomon 等人对从 3 名患者的 CEOT 中分离出的肽进行测序,然后对 CEOT 样本进行数据库分析和 RT-PCR(2003) 鉴定了 FLJ20513,它最初是由 Ota 等人克隆的(2004)。 Solomon 等人推导出 153 个氨基酸的蛋白质(2003) 称为 APIN,以表彰 Jens J. Pindborg 博士关于 CEOT 相关淀粉样沉积物的初步报告,该沉积物的谷氨酰胺、脯氨酸和蛋氨酸残留量相对较高。
帕克等人(2007) 表征了大鼠 Apin,它编码 278 个氨基酸的蛋白质。 原位杂交显示,在成熟阶段的成釉细胞和萌出的下颌磨牙的交界上皮中,Apin mRNA 表达强烈。 在前成釉细胞或乳头层细胞中没有表达 Apin。 免疫组织化学和蛋白质印迹分析揭示了成釉细胞分化过程中类似的 Apin 蛋白表达谱,在高尔基体区域和活性成釉细胞的卷边末端有明显的染色,在 Tomes 突附近沉积的牙釉质基质中有强烈的染色。 在培养和分化的大鼠成釉细胞谱系细胞中,Apin 被分泌为大约 30 kD 的蛋白质。
通过对人 Kato III 胃癌细胞系进行 RT-PCR,Kestler 等人(2008) 克隆全长 ODAM。 他们发现全长 ODAM 包含全部 10 个编码外显子,而 FLJ20513 转录本仅包含编码外显子 5 到 10。推导的全长 256 个氨基酸 ODAM 蛋白具有 N 末端信号肽。 对 70 种人体组织的 mRNA 进行斑点印迹分析,结果显示 ODAM 在气管和唾液腺中表达,在胃和胎儿肺中表达较弱。 对 35 种正常组织的免疫组织化学分析显示,在支气管中表达,并在较小程度上在卵巢、膀胱、输尿管、子宫内膜和皮肤中表达。 ODAM 也在多种肿瘤组织中表达。 免疫组织化学分析在未萌出的人类牙囊和 10 天大的小鼠牙齿中的成釉细胞中检测到了 ODAM。
Moffatt 等人使用 RT-PCR(2008) 克隆了全长小鼠、猪和人类 ODAM cDNA。 数据库分析在其他几种哺乳动物中检测到了 Apin 直向同源物,但在鱼、鸡和青蛙中没有检测到。 所有哺乳动物 Apin 蛋白都含有可裂解的 N 端信号序列、几个假定的磷酸化和 O-糖基化位点以及大量的谷氨酰胺、脯氨酸和亮氨酸残基,但它们缺乏半胱氨酸。 Northern blot分析检测到大鼠和猪牙釉质器官中Apin的表达。 Apin 在大鼠和小鼠下颌骨和大鼠鼻腺中也高表达,在大鼠唾液腺和附睾中表达较低。 在转染的 HeLa 细胞中,Rat Apin 在外周细胞膜和细胞间连接处以点状表达。
▼ 基因功能
所罗门等人(2003) 发现 CEOT 相关淀粉样沉积物的蛋白质成分仅由 44 至 46 个氨基酸的 APIN N 端片段组成。
帕克等人(2007) 发现大鼠成釉细胞谱系细胞中 Apin 的过度表达导致 Tuft1(600087) 和 Mmp20(604629) 的表达上调,而 Apin 的敲低则具有相反的效果。 其他牙釉质基质蛋白的表达基本保持不变。
Kestler 等人利用基因表达的系列分析(2008)发现ODAM在人类原发性胃癌中表达。 ELISA 显示,乳腺癌、肺癌和胃癌患者的大部分血清中可检测到抗 ODAM 抗体滴度。
▼ 基因结构
凯斯特勒等人(2008)确定ODAM基因包含10个编码外显子。 莫法特等人(2008) 报道 ODAM 基因包含 11 个外显子,其中包括一个非编码外显子 1。
▼ 测绘
凯斯特勒等人(2008) 指出 ODAM 基因对应到染色体 4q13。