ATP 合成酶 F1,亚基 δ; ATP5F1D
- ATP 合酶、H+ 转移、线粒体 F1 复合体、δ 亚基
- ATP5D
- 线粒体 ATP 合酶、δ 亚基
HGNC 批准的基因符号:ATP5F1D
细胞遗传学位置:19p13.3 基因组坐标(GRCh38):19:1,241,751-1,244,825(来自 NCBI)
▼ 描述
ATP5F1D 基因编码线粒体 ATP 合酶 F1 复合体的 δ 亚基(Jordan 和 Breen,1992)。线粒体 F1Fo-ATP 合酶复合物(EC 3.6.1.34) 使用质子梯度产生的能量来合成 ATP。该复合物的结构被称为“棒棒糖”,因为可溶性 F1 催化单元通过 Fo 单元附着在线粒体内膜上。F1 单元由 5 个亚基类型组成,化学计量为 3 α(ATP5F1A; 164360)、3 β(ATP5F1B; 102910)、1 γ(ATP5F1C; 108729)、1 δ(ATP5F1D) 和 1 ε(ATP5F1E; 606153) )(沃克总结,1995)。
▼ 克隆和表达
Jordan 和 Breen(1992) 克隆了编码人类 δ 亚基的 cDNA。该基因编码168个氨基酸的前体,其中包括22个氨基酸的前序列;切割应产生 146 个氨基酸的成熟蛋白质。HeLa 细胞 RNA 的 Northern 印迹分析显示有 2 个 δ 亚基转录物,其中一个有 1,000 个碱基,另一个有 700 个碱基。较长转录本的稳态水平比较短转录本高约 8 倍。
▼ Mapping
Gross(2014) 根据 ATP5D 序列(GenBank BC002389) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 ATP5D 基因对应到染色体 19p13.3。
▼ 分子遗传学
Olahova 等人在 2 个无血缘关系的儿童中,均为近亲父母所生,患有线粒体复合物 V(ATP 合酶)缺陷核型 5(MC5DN5;618120)(2018) 鉴定了 ATP5F1D 基因中的纯合错义突变(P82L,603150.0001 和 V106G,603150.0002)。这些突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。患者成纤维细胞的突变 ATP5F1D 蛋白含量正常,但其他复合物 V 亚基的水平显着降低,表明线粒体复合物 V 的组装减少。与对照组相比,患者细胞中复合物 V 活性也显着降低。通过 RNAi 介导的 ATP5F1D 同源物敲低,果蝇中每种突变的表达无法完全挽救异常表型(参见动物模型),
▼ 动物模型
Olahova 等人(2018) 发现果蝇中 RNAi 介导的同源 ATP5F1D 基因敲低导致蛹死亡。有针对性地敲除眼睛、触角和大脑中的基因也导致蛹死亡和头部几乎完全丧失。野生型人类 ATP5F1D 的表达可以挽救死亡以及眼睛、触角和大脑的发育。人类突变体 P82L(603150.0001) 和 V106G(603150.0002) 的表达挽救了致命性,但突变动物仍然存在眼睛和触角异常,其中 V106G 突变的影响更为严重。眼睛缺陷的特征为玻璃眼、小眼和横眼。
▼ 等位基因变体(2 个选定示例):.
0001 线粒体复合物 V(ATP 合酶)缺陷,核 5 型
ATP5F1D、PRO82LEU
Olahova 等人发现,一名女孩的父母为墨西哥裔美国人,患有线粒体复合物 V(ATP 合酶)缺陷核型 5(MC5DN5;618120)(2018) 在 ATP5F1D 基因中鉴定出纯合 c.245C-T 转换(c.245C-T, NM_001687.4),导致高度保守残基处的 pro82 到 leu(P82L) 取代。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。它在 gnomAD 数据库中以较低频率被发现(拉丁裔种族的 23,192 个等位基因中的 1 个),但在其他公共数据库中未发现。患者成纤维细胞具有正常量的突变 ATP5F1D 蛋白,但其他复合物 V 亚基的水平显着降低,表明线粒体复合物 V 的组装减少。
.0002 线粒体复合物 V(ATP 合酶)缺乏,核 5 型
ATP5F1D、VAL106GLY
Olahova 等人发现,一名男孩的父母均为亚洲血统,患有线粒体复合物 V(ATP 合酶)缺陷核型 5(MC5DN5;618120)(2018) 在 ATP5F1D 基因的外显子 3 中鉴定出纯合 c.317T-G 颠换(c.317T-G, NM_001687.4),导致高度保守残基处的 val106 至甘氨酸(V106G) 取代。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。在 gnomAD 数据库中找不到它。患者成纤维细胞的突变 ATP5F1D 蛋白含量正常,但其他复合物 V 亚基的水平显着降低,表明线粒体复合物 V 的组装减少。患者细胞中复合物 V 活性也显着降低(对照的 16%)。