MYB相关转录因子,Profilin的伙伴; MYPOP

  • PROFILIN 的合作伙伴,42-KD
  • p42(POP)

HGNC 批准的基因符号:MYPOP

细胞遗传学位置:19q13.32 基因组坐标(GRCh38):19:45,890,023-45,902,613(来自 NCBI)

▼ 说明

MYPOP 是一种转录因子,与 profilin-1(PFN1; 176610) 结合并受其调节(Lederer et al., 2005)。

▼ 克隆与表达

莱德勒等人(2005) 克隆了小鼠 Mypop,他们将其称为 p42(Pop)。 推导的 393 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 41.9 kD。 它具有 N 端色氨酸簇基序、酸性区域、核输出信号(NES)、3 个富含脯氨酸的区域、推定的 SH3 结合模块、C 端亮氨酸拉链基序和核定位信号(NLS) 在每个终点站。 Mypop 的色氨酸簇基序与真核生物中 Myb(189990) 蛋白的 DNA 结合结构域高度相似,尽管 Mypop 只有 1 个基序拷贝(而其他哺乳动物有 3 个拷贝),并且包含 3 个未发现的插入 存在于其他 Myb 蛋白中,但果蝇蛋白 zeste 除外。 定量 PCR 和 Southern blot 分析检测到小鼠胚胎和所有测试的成体组织中 Mypop 的表达。 荧光显微镜显示,Mypop 定位于转染的 PtK2 大鼠袋鼠肾上皮细胞的细胞核。

▼ 基因功能

Lederer 等人使用酵母 2-杂交分析和蛋白质下拉分析(2005) 表明小鼠 Mypop 中富含脯氨酸的区域与小鼠 profilin-1 相互作用。 Mypop 的亮氨酸拉链基序使其能够二聚化,但交联和免疫印迹分析表明,只有 Mypop 单体可以结合 profilin。 PtK2 细胞中的免疫染色显示,Mypop 的过度表达导致核 profilin 增加,而将 Mypop 锚定到线粒体膜上,而不是将 profilin 募集到线粒体,这表明蛋白质在内源环境中相互作用。 对 Mypop 截短突变体的分析表明,其 NES 和 NLS 结构域具有功能。 EMSA 显示 Mypop 的色氨酸簇基序起到 DNA 结合结构域的作用。 HeLa 细胞中的荧光素酶测定表明,Mypop 充当转录抑制因子,与 Myb 诱导的转录上调相反。 缺乏 C 端半部的 Mypop 截短突变体增加了荧光素酶表达,表明 C 端半部在 Mypop 活性的调节中很重要。 profilin-1 的存在也减少了 Mypop 的转录抑制,表明 profilin 调节 Mypop。

▼ 测绘

Gross(2018) 根据 MYPOP 序列(GenBank BC044311) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 MYPOP 基因对应到染色体 19q13.32。