多囊素1-样2; PKD1L2
- PC1L2
- KIAA1879
HGNC 批准的基因符号:PKD1L2
细胞遗传学位置:16q23.2 基因组坐标(GRCh38):16:81,100,875-81,220,394(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Nagase 等人通过对从成人杏仁核 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(2001)克隆了编码 PKD1L2 的部分 cDNA,他们将其命名为 KIAA1879。 RT-PCR ELISA检测PKD1L2在心脏中中表达,在卵巢中低表达。 在检查的所有其他组织中几乎没有检测到表达。
通过数据库分析,Li 等人(2003) 鉴定了 16 号染色体上的 2 个基因,其预测的翻译序列与多囊蛋白-1(601313) 相似,由 PKD1 基因编码。 他们将基因命名为 PKD1L2 和 PKD1L3(607895),并以睾丸 cDNA 为模板,通过 RT-PCR 获得全长 cDNA。 推导的 2,459 个氨基酸的 PKD1L2 蛋白包含一个 N 端 C 型凝集素结构域,随后是一对 PKD 结构域、一个受体蛋冻结构域、一个中央 GPCR 蛋白水解位点和 PLAT 结构域以及一个 C 端假定通道孔 地区。 它还具有 11 个跨膜结构域。 RT-PCR 检测到几种由外显子跳跃产生的替代剪接形式。 Northern 印迹分析显示 9.8 kb 转录物仅在骨骼肌中表达。 Li 等人使用各种基于 PCR 的检测方法(2003) 发现 PKD1L2 普遍表达,在心脏、肝脏和睾丸中至少有 1 个变异体高表达。 李等人(2003) 还克隆了小鼠 Pkd1l2,它编码 2,461 个氨基酸的蛋白质,与人类 PKD1L2 具有 73% 的同一性。
Yuasa 等人通过在数据库中搜索与 PKD2(173910) 相似的序列,然后搜索睾丸 cDNA 文库的 5-prime 和 3-prime RACE(2004) 克隆全长 PKD1L2。 他们还鉴定了 PKD1L2 的缩写形式,它是从外显子 12 内的起始密码子翻译而来,并编码推导的 1,175 个氨基酸的蛋白质。 PKD1L2 表达低于 Northern 印迹分析检测的水平。 RNA点印迹分析检测到成人和胎儿心脏、乳腺和脑中中等表达,而睾丸中表达较低。 Yuasa 等人使用针对长型和短型 PKD1L2 特异的 PCR 引物(2004)确定长形式在脑和睾丸中表达,短形式在心脏、脑、肾和睾丸中表达。
▼ 基因功能
汤浅等人(2004) 发现 PC1L2 优先与 GNAS(139320) 和 GNAI1(139310) 相互作用。 相反,PKD1L1 和 PKD1 与 GNA12(604394)、GNAS 和 GNAI2(139360) 相互作用。
▼ 基因结构
李等人(2003) 确定 PKD1L2 基因包含 43 个外显子,跨度约为 115 kb。
▼ 测绘
长濑等人(2001) 通过基因组序列分析将 PKD1L2 基因定位到 16 号染色体。 李等人(2003) 使用基因组序列分析将 PKD1L2 基因定位到染色体 16q23,即 PKD1L3 基因的 10 Mb 端粒。 他们将小鼠 Pkd1l2 基因定位到染色体 8C5-D2,距离小鼠 Pkd1l3 基因约 8 Mb。
▼ 动物模型
麦肯齐等人(2009) 鉴定出 Ostes,一种新型 N-乙基 N-亚硝基脲(ENU) 诱导的小鼠肌肉萎缩突变体。 遗传和生化证据表明 Pkd1l2 的上调是该表型的病因。 Ostes 小鼠患有慢性神经肌肉损伤,包括神经肌肉接头变性、多神经元神经支配和肌病。 转基因Tg(Pkd1l2)小鼠中Pkd1l2的异位过度表达再现了Ostes肌病改变并导致严重的肌肉萎缩。 双杂合小鼠(Ostes +/- 和 Tg(Pkd1l2) +/-)比单杂合小鼠遭受更严重的肌病变化,表明 Pkd1l2 水平与疾病严重程度之间呈正相关。 在体内,Pkd1l2 主要与正常骨骼肌中的内源性脂肪酸合酶相关,并且这些蛋白质共定位于肌纤维的肋节区域。 在患病的Ostes纯合小鼠肌肉中,两种蛋白质均上调,并且Ostes纯合小鼠表现出脂质代谢异常的迹象。