DEAH框解旋酶15; DHX15
- DEAH框 多肽 15
- 死亡/H框 15; DDX15
- DEAH框 蛋白 1; DBP1
- PRP43,酿酒酵母,同源物
- RNA解旋酶2; HRH2
HGNC 批准的基因符号:DHX15
细胞遗传学位置:4p15.2 基因组坐标(GRCh38):4:24,527,475-24,584,554(来自 NCBI)
▼ 说明
DHX15 是一种假定的核 ATP 依赖性解旋酶(Imamura 等,1997)。
▼ 克隆与表达
Ono 等人使用基于 DEAH 框蛋白保守区域的简并引物对 HeLa 细胞 mRNA 进行 RT-PCR(1994) 分离出编码人类 DEAH 框家族 5 个成员的部分 cDNA,包括 HRH1 和 HRH2。 他们确定 HRH2 与酿酒酵母 Ja1 具有 61% 的氨基酸序列同一性。 今村等人(1997) 分离出对应于 HRH2 整个编码区的 cDNA,他们将其称为 DBP1。 预测的 813 个氨基酸蛋白包含 7 个 ATP 依赖性 RNA 解旋酶特征的连续基序,以及带有 DEAH 框的 DNA/RNA 解旋酶结构基序的共有序列。 Northern 印迹分析显示,DBP1 在所有测试组织中均以 3.4 kb mRNA 的形式表达。 在许多组织中观察到额外的较大转录本。
吉等人(1997) 分离编码小鼠 HRH2 同源物 Deah9 的 cDNA。 Deah9 和 Prp43 在跨越中央解旋酶结构域和 C 末端区域的 500 个氨基酸区域上具有 65% 的同一性,Deah9 和 HRH2 在解旋酶结构域中具有 98% 的同一性。 免疫荧光实验表明,Deah9 与剪接因子 SC35(600813) 共定位于哺乳动物细胞的点状核斑点中,这与其作为前 mRNA 剪接因子的预测作用一致。
▼ 测绘
通过荧光原位杂交,Imamura 等人(1997) 将 DHX15 基因定位到染色体 4p15.3。
▼ 基因功能
吉等人(1997) 发现小鼠 Deah9 在酵母中的表达特异性地补充了 Prp43 突变,尽管效率低于天然酵母蛋白。 他们认为 Deah9 代表 Prp43 的哺乳动物同源物。
Lin 等人使用免疫沉淀实验(2009) 表明,在转染的 HEK293T 细胞中,GPATCH2(616836) 与内源性 PRP43(一种 RNA 依赖性 ATP 酶)相互作用。 GPATCH2 和 PRP43 共定位于转染 HEK293T 细胞的核斑点和核仁中,半定量 RT-PCR 显示乳腺癌细胞中 GPATCH2 和 PRP43 共同上调。 通过小干扰RNA抑制PRP43或GPATCH2可抑制MCF-7和T47D人乳腺癌细胞的生长。 GPATCH2 的表达增强了 PRP43 的体外 ATP 酶活性,GPATCH2 和 PRP43 的共表达增强了血清饥饿条件下 COS-7 细胞的生长。
Wang 等人使用小鼠和人类细胞(2015) 表明 NLRP6(609650) 通过 DHX15 结合病毒 RNA,并与线粒体抗病毒信号蛋白(MAVS;609676) 相互作用,诱导 I 型(例如 IFNB1;147640)和 III 型(例如 IFNL2;607401)干扰素和干扰素- 刺激基因(例如 ISG15;147571)。 基于 Nlrp6 -/- 小鼠的其他研究,Wang 等人(2015) 得出结论,NLRP6 与 DHX15 一起作为病毒 RNA 传感器来诱导 ISG。