KIRRE 样去氧肾上腺素家族粘附分子 2;KIRREL2
- KIN OF IRRE-LIKE 2
- 去氧肾上腺素样 3; NEPH3
- 去氧肾上腺素样基因 1; NLG1
- 过滤蛋白
HGNC 批准的基因符号:KIRREL2
细胞遗传学位置:19q13.12 基因组坐标(GRCh38):19:35,851,399-35,867,136(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
通过搜索 EST 数据库和 PCR,Sellin 等人(2003)获得了编码 KIRREL2 的全长 cDNA,他们将其称为 NEPH3。 NEPH3 蛋白由 708 个氨基酸组成,与 NEPH1(KIRREL; 607428) 和 NEPH2(607761) 一样,包含 5 个胞外 Ig 样重复序列、一个跨膜结构域和一个具有 9 个保守残基(KDPTNGYYxV) 的胞质结构域。 EST 数据库分析表明所有 3 种 NEPH 蛋白的组织分布相似。 免疫组织化学分析显示,podocin(NPHS2;604766) 和 NEPH1 共定位于肾小球和肾小球基底膜中。 RT-PCR 分析在足细胞细胞系和肾皮质中检测到 NEPH1、NEPH2 和 NEPH3。
通过搜索 EST 数据库,Ihalmo 等人(2003) 孤立鉴定了 KIRREL2,他们将其称为 NLG1。 NLG1 编码一种 I 型跨膜蛋白,作者将其称为 filtrin,它具有 3 个潜在的 N-糖基化位点和 4 个 O-糖基化位点。 178 个残基的胞质结构域包含几个潜在的磷酸化位点和一个富含脯氨酸的区域。 RNA点印迹分析表明表达主要在淋巴结和胰腺中,但RT-PCR分析检测到肾小球和足细胞细胞系中的表达。 免疫印迹和免疫荧光分析显示 107 kD 肾小球蛋白的表达。
Sun 等人使用 PCR 分析(2003) 在胰腺中检测到 KIRREL2 的表达,但在所检查的任何其他组织(包括肾脏)中未检测到 KIRREL2 的表达。 Northern 印迹分析显示仅在胰腺中存在 2.5 至 3.5 kb 的弥散信号。 孙等人(2003) 鉴定了 4 个 KIRREL2 剪接变体,其中 2 个是他们从胰腺 cDNA 文库中克隆的。 他们将另外 2 个鉴定为来自胎儿大脑和视网膜母细胞瘤 cDNA 文库的 EST。 最长的推导蛋白质由胎儿大脑 cDNA 编码,包含 708 个氨基酸。 视网膜母细胞瘤 cDNA 编码最短的推导蛋白,该蛋白缺乏所有 Ig 结构域,并且信号肽与细胞内结构域融合。 对几种人类、小鼠和猴子组织的免疫组织化学分析检测到所有测试物种的胰岛以及小鼠垂体前叶的染色。 在人类心脏、脑、肾、肝、肺、脾和肌肉组织中未检测到染色。 几种细胞系的 RT-PCR 证实了 β 细胞的表达。 来自脂肪/脂肪小鼠的β细胞表达选择性剪接产物以及野生型转录物。
▼ 基因功能
塞林等人(2003) 表明 NEPH1、NEPH2 和 NEPH3 的胞质结构域与 podocin 的 C 末端相互作用。 突变分析表明,NEPH 胞质结构域中保守基序 7 位的 tyr 磷酸化对于 podocin 结合至关重要。 免疫共沉淀分析证实,所有 3 种 NEPH 蛋白还共享一个保守的 C 端 GRB2(108355) SH2 结合位点和一个 PDZK1(603831) 结合位点。 塞林等人(2003) 证明,与 ITK(186973) 结合,NEPH1 会增加 AP1(165160) 的激活。
孙等人(2003)发现Kirrel2表达缺失与T细胞对胰岛的侵袭以及非肥胖糖尿病(NOD)小鼠中糖尿病的发展呈负相关。
▼ 基因结构
通过基因组序列分析,Ihalmo 等人(2003)确定NLG1基因包含15个外显子。 选择性剪接产生缺乏外显子 4 的 α 形式和仅由编码蛋白质 N 端和 C 端部分的 6 个外显子组成的可溶性 β 形式,删除了跨膜区域。 核心 NLG1 启动子不含 TATA 和 CAAT,位于 CpG 岛中。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Ihalmo 等人(2003) 将 NLG1 基因定位到染色体 19q13.1,与 NPHS1 基因(602716) 相邻,但转录方向相反。 2个基因的转录起始点之间的距离为5 kb,并且由共享的调控区域组成。