线粒体核糖体蛋白 L58; MRPL58
- 未成熟结肠癌转录本 1; ICT1
- DS1
HGNC 批准的基因符号:MRPL58
细胞遗传学位置:17q25.1 基因组坐标(GRCh38):17:75,012,670-75,021,261(来自 NCBI)
▼ 说明
ICT1 编码肽基-tRNA 水解酶(PTH)(EC 3.1.1.29),它是翻译 13 种线粒体编码多肽的大(39S) 线粒体核糖体的重要亚基。 通过其 PTH 活性,ICT1 起到核糖体释放因子的作用(Richter 等人总结,2010)。
▼ 克隆与表达
Van Belzen 等人通过消减杂交筛选分化和未分化 HT29-D4 结肠癌细胞的 cDNA 文库(1995) 鉴定出部分 ICT1 cDNA(他们称之为 DS1)在 HT29-D4 细胞分化过程中下调。 通过筛选未分化的 HT29-D4 细胞的 cDNA 文库,他们鉴定了全长 ICT1,它编码由 206 个氨基酸组成的推定蛋白质,预测分子量为 24 kD。 使用针对 ICT1 C 末端合成肽的多克隆抗血清对 HT29-D4 蛋白提取物进行蛋白质印迹分析,结果显示 2 个 25 和 20 kD 的特异性条带。 范贝尔森等人(1995) 指出较小尺寸的主带可能代表蛋白质的加工形式。 Southern印迹分析表明ICT1在人类基因组中作为单拷贝基因存在。
▼ 基因功能
成人结肠上皮含有 3 种由多能干细胞产生的分化细胞类型。 肿瘤转化偏离正常成熟途径被认为始于干细胞或其早期后代。 由于相对未分化的肿瘤可能具有更高的增殖潜力,因此通常比分化良好的肿瘤更具侵袭性,van Belzen 等人(1995)试图鉴定标记物以更好地表征正常和肿瘤性结肠上皮的分化途径。 van Belzen等利用可诱导快速分化的HT29-D4未分化结肠癌细胞系,以及差示杂交和差减杂交技术(1995) 鉴定了一些在实验过程中上调的 mRNA,例如 HLA-B(142830) 和线粒体 ATPase-6(MTATP6; 516060),或下调的 mRNA,例如 ICT1、核磷蛋白(164040) 和腺苷酸琥珀酸裂合酶(ADSL; 608222)。 差异化。 与 mRNA 一样,ICT1 蛋白在未分化的 HT29-D4 细胞中的表达水平高于分化的 HT29-D4 细胞。
Richter 等人使用小干扰 RNA(2010) 表明,HEK293 和 HeLa 细胞中 ICT1 的耗竭会导致形态变化、细胞数量减少,并降低 NDUFB8(602140) 和 COX2(PTGS2; 600262) 的蛋白水平,它们是线粒体呼吸链复合物 I 和 IV 的标记物, 分别。 代谢标记研究表明 ICT1 的敲低会损害线粒体蛋白质合成的速率。 蛋白质印迹分析显示 ICT1 与 39S 线粒体核糖体成分 MRPL3(607118) 和 MRPL12(602375) 共沉淀。 里克特等人(2010)指出ICT1蛋白具有线粒体核糖体释放因子的一些特征,但它缺乏2个参与终止密码子识别的结构域。 因此,ICT1 在体外表现出核糖体依赖性但终止密码子孤立的 PTH 和翻译释放活性。 PTH 催化结构域内 GGQ 基序中任一甘氨酸的突变都会消除 ICT1 的体外活性。 里克特等人(2010) 假设停止 ICT1 的密码子孤立活性可能使其能够在停滞的核糖体处解离线粒体核糖体亚基并有助于其回收。
▼ 测绘
Hartz(2010) 根据 ICT1 序列(GenBank BC015335) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 ICT1 基因对应到染色体 17q25.1。