MYOD 家族抑制剂域包含蛋白; MDFIC
- IMFA 域包含蛋白质;HIC
HGNC 批准的基因符号:MDFIC
细胞遗传学位置:7q31.1-q31.2 基因组坐标(GRCh38):7:114,922,094-115,019,917(来自 NCBI)
▼ 描述
MDFIC 蛋白被认为将转录因子束缚在其主要存在的细胞质中,从而限制其进入核和转录活性(Byrne 等人的总结,2022)。
▼ 克隆与表达
使用 CD4(186940) 的细胞质尾作为诱饵,对人 T 细胞白血病病毒(HTLV)-1 感染的 T 细胞系 cDNA 文库进行酵母 2 杂交筛选,然后筛选脾 cDNA 文库,Thebault 等等人(2000) 克隆了 MDFIC,他们称之为 HIC。Northern 印迹分析在脾脏、胸腺、外周血白细胞、前列腺、子宫和小肠中检测到 4.4 kb 的转录物,而在睾丸或结肠中几乎没有表达。SDS-PAGE 检测到表观分子量为 40 和 32 kD 的 HIC 蛋白。泰博等人(2000) 确定全长 355 个氨基酸的 HIC 蛋白(p40) 的翻译是在 GTG 密码子处起始的,而框内 N 末端截短的蛋白(p32) 的翻译是从下游 ATG 密码子起始的。两种蛋白均含有 C 端富含半胱氨酸的 IMFA(MDFI; 604971) 样结构域。
Byrne 等人在小鼠胚胎中使用 RNA 原位杂交分析(2022) 在胚胎(E) 16.5 和 E18.5 天发育中的肺、肾和唾液腺中观察到 Mdfic 的强烈表达。在心血管系统中,Mdfic 在淋巴管和心脏瓣膜中检测到,并通过免疫染色证实,并且定位于细胞质和细胞外基质中。原代成人真皮淋巴内皮细胞(hLEC) 的免疫印迹分析揭示了 MDFIC 的存在,亚分级显示细胞的细胞质和膜区室富集。
▼ 测绘
Cigognini 等人的地图(2007) 在骨髓疾病中经常缺失的染色体 7q31.1 区域中发现了 MDFIC 基因。
Stumpf(2022) 根据 MDFIC 序列(GenBank BC156446) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 MDFIC 基因对应到染色体 7q31.1-q31.2。
▼ 基因功能
使用报告基因分析,Thebault 等人(2000) 发现 HIC p32 和 p40 蛋白增强了 Tax 介导的 HTLV-1 长末端重复序列(LTR) 的激活,但它们下调了 Tat 介导的人类免疫缺陷病毒(HIV)-1 LTR 的激活。p32 和 p40 蛋白对单纯疱疹病毒反式激活蛋白 Vp16 的活性没有影响。
▼ 分子遗传学
Byrne 等人在 3 例因淋巴管畸形(LMPHM12;620014)而出现淋巴水肿并反复出现胸腔和心包积液的患者中(2022) 鉴定了 MDFIC 基因(c.391dupA; 614511.0001) 中 1 bp 重复的纯合性。此外,2名受影响的兄弟在MDFIC中存在重复和错义突变的复合杂合子(F244L;614511.0002)。另外 2 名患者的 MDFIC、S124X(614511.0004) 和 G63X(614511.0004) 中的无义突变为纯合子。这些变异在各自的家族中随疾病而分离,并且在 gnomAD 数据库中要么未发现,要么以较低的次要等位基因频率存在。功能分析表明,MDFIC 减少可能会损害淋巴管内皮细胞的集体细胞迁移,这是淋巴管瓣膜发育过程中支撑小叶形成的重要事件。
▼ 等位基因变异体(4 个选定示例):.
0001 淋巴畸形 12
MDFIC、1-BP DUP、391A
一名 20 岁伊朗妇女(家族 LE-410)和 4 个月大的欧洲男孩(CHOP-1)因淋巴管畸形而出现淋巴水肿和反复性胸膜和心包积液(LMPHM12;620014),以及受感染的中东裔男孩(家族 LE-590)7 岁时死于感染性休克,Byrne 等人(2022) 鉴定了 MDFIC 基因外显子 4 中 1 bp 重复的纯合性(c.391dupA, NM_001166345.1),导致预计会导致过早终止密码子(Met131AsnfsTer3, M131NfsX3) 的移码。在 2 名患有淋巴管畸形的中国兄弟(LE-452) 中,其中 1 名在出生时死亡,1 名在 6 岁时死亡,作者在 MDFIC 外显子 5 中鉴定出相同重复的复合杂合性和 c.732T-G 颠换,从而导致phe244 替换为 leu(F244L;614511.0002)。两种变体在各自家族中随疾病分离,并且在 gnomAD 数据库中以较低的次要等位基因频率存在。HEK293 细胞中的实验证明野生型 MDFIC 与 GATA2(137295) 发生选择性共免疫沉淀,表明 MDFIC 和 GATA2 之间的物理相互作用可能有助于 MDFIC 在 GATA2 水平较高的淋巴管和心脏瓣膜中选择性定位。尽管与人类 F244L 突变类似的 F245L 小鼠突变体保留了与 GATA2 相互作用的能力,但在类似的小鼠 M131Nfs 突变体和 GATA2 之间没有检测到相互作用。
.0002 淋巴畸形 12
MDFIC,PHE244LEU
讨论 MDFIC 基因外显子 5 中的 c.732T-G 颠换(c.732T-G,NM_001166345.1),导致 phe244 至 leu(F244L) 取代, Byrne 等人在患有淋巴管畸形 12(LMPHM12; 620014) 的 2 个中国兄弟(家族 LE-452)中发现了复合杂合状态(2022),参见 614511.0001。
.0003 淋巴畸形 12
MDFIC,SER124TER
一名 10 岁中东裔男孩(家族 LE-230)因淋巴畸形(LMPHM12;620014) 而出现淋巴水肿和胸腔积液,Byrne 等人(2022) 鉴定了 MDFIC 基因外显子 4 中 1 bp 缺失(c.371del, NM_001166345.1) 的纯合性,导致 ser124 到 ter(S124X) 替换。他未受影响的父母是杂合突变,在 gnomAD 数据库中未发现这种突变。
.0004 淋巴管畸形 12
MDFIC,G63X
一名 11 岁库尔德女孩(G764 家族)因淋巴管畸形(LMPHM12;620014)而出现淋巴水肿和复发性胸腔积液,Byrne 等人(2022) 鉴定了 MDFIC 基因外显子 3 中 c.187G-T 颠换(c.187G-T, NM_001166345.1) 的纯合性,导致 gly63 至 ter(G63X) 取代。她未受影响的父母是该突变的杂合子,在 gnomAD 数据库中未发现该突变。