含钾通道四聚化结构域的蛋白质 6; KCTD6
- 包含 KCTD、CUL3 转换因子、Hedgehog 3 抑制器; KCASH3
HGNC 批准的基因符号:KCTD6
细胞遗传学定位:3p14.3 基因组坐标(GRCh38):3:58,492,096-58,502,360(来自 NCBI)
▼ 说明
KCTD6 属于包含 BTB/POZ 结构域的蛋白质家族,通过促进 HDAC1(601241) 降解来抑制刺猬(参见 SHH, 600725) 信号传导(De Smaele et al., 2011)。 KCTD6 还在调节锚蛋白-1(ANK1; 612641) 异构体的周转中发挥作用(Lange et al., 2012)。
▼ 克隆与表达
通过在数据库中搜索与 KCTD11(609848) 相似的序列,De Smaele 等人(2011) 鉴定了人类 KCTD21(618790) 和 KCTD6。 推导的KCTD6蛋白含有237个氨基酸。 KCTD21和KCTD6都具有BTB结构域,并且它们与KCTD11分别具有42%和32%的总体氨基酸同源性。 小鼠组织的定量RT-PCR分析表明Kctd21和Kctd6在小脑和大脑中高表达。 与胎儿小脑相比,成人分化小脑中 KCTD21 和 KCTD6 的表达增加。 KCTD21 和 KCTD6 在大多数脊椎动物中都是保守的,并且与基底脊索动物中编码含有 KCTD 的蛋白质的基因相似。
▼ 基因结构
通过数据库分析,De Smaele 等人(2011)确定KCTD6基因含有2个外显子。 第一个外显子是非编码的。
▼ 测绘
通过数据库分析,De Smaele 等人(2011) 将 KCTD6 基因定位到染色体 3p14.3。
▼ 基因功能
De Smaele 等人使用免疫沉淀分析(2011) 发现 KCTD21 和 KCTD6 通过其 BTB 基序形成同源寡聚物。 它们还与 KCTD11 形成杂低聚物,但彼此之间不形成杂低聚物。 KCTD21 和 KCTD6 与 KCTD11 共享许多功能特性。 两种蛋白通过其 BTB 结构域与 滞蛋白-3(CUL3; 603136) 相互作用,形成活性 E3 连接酶复合物。 KCTD21 的 C 端区域结合 HDAC1 形成 KCTD-CUL3-HDAC1 三聚体复合物,导致 HDAC1 泛素化和降解。 相比之下,KCTD6 仅在 KCTD11 存在的情况下结合 HDAC1,从而导致 HDAC1 降解。 KCTD21 和 KCTD6 通过以乙酰化依赖性方式下调其效应子 GLI(GLI1;165220)的转录功能来抑制刺猬信号传导。 KCTD21 和 KCTD6 的表达在人原代髓母细胞瘤细胞中下调,而它们的过度表达则降低了髓母细胞瘤细胞的生长。
Lange 等人使用酵母 2 杂交筛选(2012) 发现人锚蛋白 1 的暗蛋白(OBSCN; 608616) 相互作用亚型 sANK1.5 也与横纹肌中的人 KCTD6 相互作用。 sANK1.5 的 Obscurin 结合域 2 与 KCTD6 的 N 端 BTB/POZ 域相互作用。 sANK1.5 C 端赖氨酸的乙酰化促进了相互作用,随后的 sANK1.5 蛋白周转取决于 KCTD6 相关的 neddylation 和泛素化,以及蛋白的寡聚化状态。 KCTD6 在肌肉发育过程中上调,并介导 sANK1.5 与 CUL3 的关联,从而调节 sANK1.5 的周转。 KCTD6 结合的表征表明 KCTD6 形成平行的同源四聚体。 KCTD6 的 N 端 BTB/POZ 结构域对于初始二聚化很重要,而其 C 端对于完全四聚化以及调节其与 CUL3 底物蛋白的相互作用很重要。 滞蛋白 依赖性 sANK1.5 周转的调节取决于 obscurin 的存在,因为 obscurin 敲除小鼠肌肉表现出 sAnk1.5 水平降低以及 sAnk1.5/Kctd6 复合物的错误定位。