BARH-LIKE 1; BARHL1

HGNC 批准的基因符号:BARHL1

细胞遗传学位置:9q34.13 基因组坐标(GRCh38):9:132,582,606-132,590,252(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

BarH1 和 BarH2(Bar) 果蝇基因是含有同源基因的基因,是果蝇外部感觉器官命运决定所必需的。 Bulfone 等人使用生物信息学方法(2000) 鉴定了与 Bar 果蝇基因高度相关的小鼠和人类同源基因基因,他们将其命名为 Barhl1 和 Barhl2(605212)。 布尔丰等人(2000) 筛选了人类 lambda 基因组文库,并鉴定了包含 BARHL1 基因最后 2 个外显子的克隆。 通过将这 2 个外显子连接在一起,他们获得了包含同源基因和终止密码子的部分 BARHL1 序列(GenBank AJ237816)。 该部分 BARHL1 序列与相应的小鼠序列具有 99% 的氨基酸同一性。 与小鼠 Barx1 基因(603260) 相比,小鼠 Barhl1 基因与果蝇 BARH1 的同源性更高。 对几个发育阶段的小鼠组织的原位杂交表明,Barhl1 只在发育中的中枢神经系统的限制域中表达,特别是间脑和菱脑,它在产生小脑外颗粒层和形成小脑外颗粒层的迁移细胞中表达。 脊髓背侧感觉中间神经元的特定群体。 作者假设 Barhl1 功能可能是神经元祖细胞这些特定亚型的产生所必需的。

Poschl 等人使用基因表达的系列分析(2011) 发现 BARHL1 在人类小脑中高度表达,而在皮质或任何检查的外周组织中表达很少。 RT-PCR 检测到发育中小脑中 BARHL1 的表达量比成人小脑高约 30 倍。 髓母细胞瘤的免疫组织化学分析显示核内 BARHL1 表达。 在出生后第 7 天的小鼠中,Barhl1 在小脑颗粒神经元中强烈表达。

▼ 基因功能

波什尔等人(2011) 发现与正常人小脑组织相比,髓母细胞瘤中 BARHL1 的表达升高。 Barhl1 表达的敲低会降低经过基因工程改造而产生突变型 Shh(600725) 依赖性髓母细胞瘤的小鼠的存活率。 人髓母细胞瘤中 BARHL1 表达的缺失或减少与肿瘤细胞分化减少和生存率低弱相关。

▼ 测绘

通过 GeneBridge4 辐射混合组的 PCR 分析,Bulfone 等人(2000) 将人类 BARHL1 基因分配到染色体 9q34。 小鼠 Barhl1 基因位于 2 号染色体的一个区域,与人类 9q34 具有同源性。

▼ 分子遗传学

布尔丰等人(2000) 指出,定位分配和表达模式使 BARHL1 成为一种 Joubert 综合征(213300) 的位置候选基因,Joubert 综合征是一种罕见的人类小脑发育异常。 布莱尔等人(2002) 似乎排除了 BARHL1 作为与 9q34 相关的 Joubert 综合征形式的突变位点。

Gould 和 Walter(2004) 证明 Joubert 综合征中的 BARHL1 基因或 BARX1 基因(603260) 没有异常。