小伸长复合物 ELL 亚基 1 的相互作用子; ICE1

  • KIAA0947

HGNC 批准的基因符号:ICE1

细胞遗传学位置:5p15.32 基因组坐标(GRCh38):5:5,422,677-5,490,220(来自 NCBI)

▼ 说明

ICE1 是小延伸复合体(LEC) 的一个亚基,它调节 RNA 聚合酶(Pol) II(参见 180660)依赖性小核 RNA(snRNA) 基因的转录(Hu 等,2013)。 ICE1 还促进剪接和无义介导的 mRNA 衰减(NMD) 之间的联系(Baird et al., 2018)。

▼ 克隆与表达

胡等人(2013) 报道 ICE1 包含 N 端卷曲螺旋结构域。

贝尔德等人(2018) 报道,ICE1 是一种大约 250 kD 的核蛋白,包含假定的 C 端 MIF4G(eIF4G(600495) 的中间)结构域。

▼ 基因功能

Hu 等人使用质谱方法(2013) 发现人类 LEC 含有与果蝇 LEC 类似的 ELL(600284)、ICE1 和 ICE2,以及额外的蛋白质 ZC3H8。 通过 RNA 干扰敲低 HCT116 人结直肠癌细胞中的 ICE1,导致 snRNA 转录普遍减少,表明与 ELL 一样,ICE1 有助于 Pol II 的 snRNA 转录。 对 HeLa 细胞的进一步分析发现 ICE1 是一种支架蛋白,是 LEC 募集至亚核体所需的。 ICE1 的 N 端 500 个氨基酸(包括卷曲螺旋结构域)对于 ICE1 靶向亚核体是必要且充分的。 果蝇 S2 细胞中 Ice1 的敲低导致 Pol II 占用率降低,特别是在 snRNA 基因上,但在邻近的蛋白质编码基因上却没有。 在 ICE1 耗尽的 HCT116 细胞中,RPPH1(608513) 上的 Pol II 占据减少,但 RPPH1 上的 Pol III 占据不受影响。 胡等人(2013) 得出结论,ICE1 特异性调节 snRNA 基因上 Pol II 和 LEC 亚基的占据。

贝尔德等人(2018) 发现人类 ICE1 对于通过 NMD 途径细胞靶向和破坏含有提前终止密码子的 mRNA 至关重要。 在 HEK293 细胞中,ICE1 缺失会破坏 NMD,并由于 mRNA 稳定性的增加而增加具有 NMD 诱导特征的 mRNA 的丰度。 HEK293 细胞中 ICE1 的缺失引起 mRNA 和蛋白质表达的同时增加,表明 ICE1 缺失增加了 NMD 靶 mRNA 的稳定性,而不干扰这些靶 mRNA 的核输出和细胞质翻译。 当 ICE1 与 HEK293 细胞中的内源核心 EJC 蛋白共纯化时,ICE1 与完全组装的外显子连接复合物(EJC) 相互作用。 ICE1-EJC 相互作用是由 ICE1 假定的 C 端 MIF4G 结构域介导的。 ICE1 耗尽的 HEK293 细胞中的免疫纯化表明,核心 EJC 组装不需要 ICE1,但它调节 EJC 与外周 EJC 因子 UPF3B 的相互作用(300298)。 UPF3B 在 ICE1 耗尽的 HEK293 细胞中过度表达,从生化和功能上挽救了 ICE1 耗尽,表明在 ICE1 缺失的情况下 NMD 的丢失是由于 UPF3B-EJC 组装或稳定性失败所致。

▼ 测绘

Gross(2018) 根据 ICE1 序列(GenBank BC004902) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 ICE1 基因对应到染色体 5p15.32。