OS9 内质网凝集素; OS9
- 骨肉瘤扩增基因 9
- 在骨肉瘤 9 中扩增
- 内质网凝集素 OS9
HGNC 批准的基因符号:OS9
细胞遗传学位置:12q13.3-q14.1 基因组坐标(GRCh38):12:57,694,132-57,721,557(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Su 等人通过寻找 12 号染色体区域内经常在人类癌症中扩增的基因,(1996) 克隆 OS9。 推导的 667 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 75.6 kD。 OS9 包含一个 N 末端前导肽、一个包含 8 个半胱氨酸的 211 个氨基酸的亲水区域,以及一个具有多个预测的亲水螺旋的酸性区域。 它还具有假定的核目标信号。 OS9的亲水区在人类、酿酒酵母和线虫中高度保守,其中8个半胱氨酸完全保守。 Northern 印迹分析在所有 16 个人体组织中检测到 2.8 kb OS9 转录物。 心脏和胰腺中的表达量高出 2 至 3 倍,脾脏和胸腺中的表达量低 2 倍。 OS9 在 5 个肉瘤组织中的 3 个中通过 CDK4(123829) 扩增得到扩增。
木村等人(1998) 鉴定了 OS9 的 3 个框内剪接变体。 Variant-1 编码全长 667 个氨基酸的蛋白质,Variant-2 缺少外显子 13,编码 612 个氨基酸的蛋白质,Variant-3 缺少外显子 13 和外显子 11 3-prime 末端的 45 bp,编码 597 个氨基酸的蛋白质。 RT-PCR 显示,variant-2 是所有检查的细胞系中的主要亚型。
▼ 基因功能
弗里德曼等人(2002) 发现酵母 Os9,他们称之为 Yos9,是一种膜相关糖蛋白,定位于内质网(ER),并与参与 ER 到高尔基体转运的蛋白质相互作用。 Yos9似乎在糖基磷脂酰肌醇(GPI)锚定蛋白向高尔基体的转运中发挥直接作用,并且对非GPI锚定蛋白的转运和加工没有影响。
巴米迪帕蒂等人(2005),金等人(2005)和 Szathmary 等人(2005) 提出的证据表明 Yos9 在错误折叠糖蛋白的 ER 相关降解中发挥作用。
贝克等人(2005) 发现 OS9 与人类 293 细胞中的 HIF1A(603348) 和 HIF-脯氨酰羟化酶(PHD;参见 606424) 相互作用。 这种三元复合物的形成促进了 PHD 介导的 HIF1A 羟基化、HIF1A 与 VHL(608537) 的结合以及 HIF1A 的蛋白酶体降解。 在非缺氧条件下,通过 RNA 干扰敲低 OS9 会增加 HIF1A 蛋白水平、HIF1A 转录活性和 VEGF(192240) mRNA 水平。 贝克等人(2005) 得出结论,OS9 是多蛋白复合物的重要组成部分,以氧依赖性方式调节 HIF1A 水平。
Mueller 等人使用人类细胞系(2008) 鉴定了错误折叠蛋白质从内质网腔到胞质溶胶进行蛋白酶体依赖性降解的逆转位或错位所需的蛋白质复合物的几种成分。 这些包括 SEL1L(602329)、HRD1(SYVN1; 608046)、derlin-2(DERL2; 610304)、ATPase p97(VCP; 601023)、PDI(P4HB; 176790)、BIP(HSPA5; 138120)、calnexin(CANX; 114217)、AUP1(602434)、UBXD8(FAF2)、UBC6E(UBE2J1;616175) 和 OS9。
Jansen 等人使用 DCSTAMP(TM7SF4; 605933) 的 C 末端作为诱饵,通过酵母 2 杂交筛选人未成熟和成熟树突状细胞(DC) cDNA 文库(2009) 发现 OS9 和 OS9 剪接变体与 DCSTAMP 相互作用。 蛋白质印迹分析和共聚焦显微镜显示 DCSTAMP 和 OS9 在各种细胞系(包括未成熟 DC)的 ER 中共定位。 TLR2(603028) 或 TLR4(603030) 诱导的 DC 成熟导致 DCSTAMP 以依赖于与 OS9 相互作用的方式从 ER 易位至高尔基体; 但是,OS9 本地化不受影响。 詹森等人(2009) 得出结论,OS9 关键参与调节 DCSTAMP 响应 TLR 触发的 ER 至高尔基体转运。
▼ 基因结构
木村等人(1997) 确定 OS9 基因包含 15 个外显子,跨度为 30.4 kb。 直接上游区域包含典型的 TATA 和 CCAAT 框,SP1(189906)、AP2(107580)、GATA(参见 305371)和 NFKB(参见 164011)的几个结合位点位于更上游。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Su 等人(1996) 将 OS9 基因定位到染色体 12q13-q15。 Kimura 等人使用 FISH(1997) 将 OS9 基因定位到染色体 12q13。 Southern blot分析表明OS9是一个单拷贝基因。