磷脂酰丝氨酸脱羧酶; PISD
- PSD
- PSSC
HGNC 批准的基因符号:PISD
细胞遗传学位置:22q12.2 基因组坐标(GRCh38):22:31,618,491-31,662,564(来自 NCBI)
▼ 说明
磷脂酰丝氨酸脱羧酶(PSD;EC 4.1.1.65)通过磷脂酰丝氨酸(PS) 脱羧来催化磷脂酰乙醇胺(PE) 的形成。I 型 PSD,例如 PISD,通过 N 端靶向序列靶向线粒体内膜。PISD 还包含一个保守的 LGST 基序,该基序充当自催化裂解位点,酶原在此裂解成成熟的 α 和 β 亚基(Schuiki 和 Daum,2009)。
▼ 克隆与表达
Kuge 等(1991) 从中国仓鼠卵巢细胞中克隆了 Pisd,他们将其称为 Pssc。推导的蛋白质至少含有370个氨基酸。Northern 印迹分析检测到约 2.4 kb 的转录本。
Steenbergen 等人使用实时 PCR(2005) 发现 Pisd 在所有检查的小鼠组织中都有表达,其中在睾丸和肝脏中表达最高。与成年小鼠相比,胚胎小鼠和幼年小鼠的表达较低。β-半乳糖苷酶(GLB1;611458)染色检测到胚胎心脏和成年睾丸支持细胞中高 Pisd 表达。
通过胎盘 cDNA 文库的 PCR,Forbes 等人(2007) 克隆人类 PISD。全长酶原含有409个氨基酸,可自行加工成活性异二聚体。
▼
通过基因组序列分析进行绘图,Dunham 等人(1999) 将 PISD 基因定位到染色体 22q12。
▼ 基因功能
通过分析转染的人胚胎肾细胞制备的膜,Forbes 等人(2007) 证实人类 PISD 具有催化活性,并且他们鉴定了几种 PISD 活性的化学抑制剂。
Schuiki 和 Daum(2009) 回顾了 PSD 及其在脂质代谢中的作用。
Keckesova 等人在小鼠和人类的体外和体内研究中(2017) 证明线粒体蛋白 LACTB(608440) 可有效抑制乳腺癌细胞的增殖。其作用机制涉及改变线粒体脂质代谢和乳腺癌细胞的分化。这至少部分是通过降低线粒体 PISD 的水平来实现的,线粒体 PISD 参与线粒体磷脂酰乙醇胺的合成。凯克索娃等人(2017) 得出的结论是,他们的观察发现了一种新型线粒体肿瘤抑制因子,并证明了线粒体脂质代谢与乳腺癌细胞分化程序之间的联系。
▼ 分子遗传学
Peter 等人在来自 2 个不相关的近亲家庭的 2 组兄弟中发现了 Liberfarb 综合征(LIBF; 618889)(2019) 鉴定了 PISD 基因(612770.0001) 中 10 bp 缺失的纯合性,该基因与两个家族的疾病分离。Liberfarb 等人最初报道的患者 DNA 的靶向桑格测序(1986)(患者 5,LIB-001)从石蜡包埋的食管手术活检中提取,证实存在相同的 10 bp 缺失。这 3 名患者来自葡萄牙、巴西和亚速尔群岛的家庭,在 PISD 基因周围有一个共同的单倍型,与大约 5 代之前的共同祖先一致。
Girisha 等人发现,一名来自无关印度家庭的女孩和男孩患有“无法分类”的脊椎骨干骺端发育不良(2019) 鉴定了 PISD 基因(C266Y; 612770.0002) 中错义突变的纯合性,该突变与疾病分离,并且在对照或 gnomAD 数据库中未发现。对纯合性区域的分析表明这两个家族之间存在远亲血缘关系。
在 2 名患有进行性身材矮小和骨骼发育不良的姐妹中,Zhao 等人(2019) 鉴定了 PISD 基因中错义突变(R277Q; 612770.0003) 和剪接突变(612770.0004) 的复合杂合性。
▼ 动物模型
斯滕贝根等人(2005)发现 Pisd -/- 小鼠在胚胎第 8 天到第 10 天之间死亡。在 8 日龄的 Pisd -/- 胚胎中,不存在胎盘或羊膜等胚胎外成分,胚胎直接处于与母体血液接触。Pisd -/- 胚胎中的大量线粒体形状异常,但内膜和外膜均存在,并且嵴清晰可见。胚胎成纤维细胞的线粒体呈碎片状、圆形,直径不规则,广泛分散在整个细胞内,而不是集中在细胞核附近。Pisd +/- 小鼠表现正常,表现出正常的活力,并且肝脏、睾丸和大脑的磷脂组成与野生型小鼠相同。然而,CTP-磷酸乙醇胺胞苷酰转移酶(PCYT2;602679)蛋白的量,
▼ 等位基因变异体(4 个选定示例):.
0001 LIBERFARB 综合征
PISD、10-BP DEL、IVS8、NT904-12
Peter 等人在来自 2 个患有 Liberfarb 综合征(LIBF; 618889) 的无关近亲家庭的 2 组兄弟中,来自葡萄牙大陆(家庭 1;患者 PMO1432 和 PMO1433)和巴西(家庭 2;患者 PMO3433 和 PMO3434),(603213)(2019) 鉴定了 PISD 基因内含子 8 中 10 bp 缺失(c.904-12_904-3delCTATCACCAC, NM_014338.3) 的纯合性,该基因与两个家族的疾病完全分离。使用从 Liberfarb 等人最初报道的患者手术标本中提取的 DNA。Peter 等人(1986)(患者 5,LIB-001),其父母来自亚速尔群岛(2019) 证实存在相同的 10 bp 缺失。家族 1 和家族 2 具有共同的单倍型,其大小相当于大约 9.92 个减数分裂,这表明葡萄牙和巴西患者在大约 5 代之前有一个共同的祖先。HEK293T 细胞中基于小基因的剪接实验表明,缺失阻止了对天然受体剪接位点的正确识别,同时产生了正确剪接的 mRNA 和保留所有内含子 8 的转录物;后一个事件在内含子内产生提前终止密码子。定量PCR分析表明,与携带野生型小基因的质粒相比,来自带有缺失的质粒的正确剪接的mRNA转录本的比例仅为5.7%。产生正确剪接的 mRNA 和保留所有内含子 8 的转录本;后一个事件在内含子内产生提前终止密码子。定量PCR分析表明,与携带野生型小基因的质粒相比,来自带有缺失的质粒的正确剪接的mRNA转录本的比例仅为5.7%。产生正确剪接的 mRNA 和保留所有内含子 8 的转录本;后一个事件在内含子内产生提前终止密码子。定量PCR分析表明,与携带野生型小基因的质粒相比,来自带有缺失的质粒的正确剪接的mRNA转录本的比例仅为5.7%。
.0002 LIBERFARB 综合征
PISD,CYS266TYR
Girisha 等人在来自无关印度家庭的患有 Liberfarb 综合征(LIBF; 618889) 的 3 岁女孩(P1) 和 9 岁男孩(P2) 中进行了研究(2019) 鉴定了 PISD 基因中 c.797G-A 转换(c.797G-A, NM_178022.1) 的纯合性,导致高度保守残基处的 cys266 到 tyr(C266Y) 取代。未受影响的父母的突变是杂合的,在来自患有罕见孟德尔疾病的印度家庭的 475 个对照外显子组的内部数据库或 gnomAD 数据库中都没有发现这种突变。外显子组数据和纯合性区域的分析表明,两个先证者在 PISD 基因周围有一个共同的单倍型,表明远亲关系。与对照组相比,患者来源的成纤维细胞在细胞核周围显示出碎片化的线粒体形态。用 MG-132 或 staurosporine 处理患者细胞以诱导内在凋亡途径的激活,结果显示细胞活力显着降低,同时 半胱天冬酶-3(CASP3; 600636) 和 半胱天冬酶-7(CASP7; 601761) 激活增加。补充乙醇胺在很大程度上恢复了 MG-132 应激患者细胞的细胞活力并减少了 CASP3/7 的激活。
在瞬时转染的 HEK 细胞中,Zhao 等人(2019) 观察到 C266Y 变体显着减少了 PISD 蛋白的自催化加工,这是其活性所必需的。
.0003 利伯法布综合征
PISD, ARG277GLN
在 2 名患有 Liberfarb 综合征(LIBF; 618889) 的姐妹中,Zhao 等人(2019) 鉴定了 PISD 基因外显子 6 中 c.830G-A 转换(c.830G-A, NM_001326411.1) 的复合杂合性,导致高度保守残基处的 arg277 至 gln(R277Q) 取代,以及内含子 5(612770.0004) 中的剪接突变(c.697+5G-A)。他们未受影响的母亲的剪接变异是杂合的,在 gnomAD、ESP 或 1000 基因组计划数据库中未发现这种变异。没有报道他们父亲的 DNA 分析。错义突变在gnomAD数据库(0.01923%)、ESP数据库(0.03%)和千人基因组计划数据库(0.02%)中的欧美人群中出现频率较低。对患者成纤维细胞的功能分析显示,与野生型细胞相比,磷脂酰丝氨酸向磷脂酰乙醇胺(PE) 的转化减少了约 50%。此外,与野生型细胞相比,患者成纤维细胞显示出线粒体功能障碍的证据,线粒体网络更加破碎,溶酶体增大,最大耗氧率降低,并且对 2-脱氧葡萄糖的敏感性增加。用溶血PE补充PE线粒体库以及用野生型PISD转染,恢复了患者成纤维细胞的线粒体和溶酶体形态。对患者成纤维细胞的 cDNA 分析显示出一条较小的 PCR 条带,而对照条带中不存在这种条带;放线菌酮处理后选择性剪接产物更加丰富,表明它受到了无意义的腐烂。在从母亲外周血 RNA 生成的 cDNA 中观察到类似的错误剪接模式,证实 c.697+5G-A 变体改变了剪接。对酵母和转染 HEK 细胞中 R277Q 变体的功能分析表明,PISD 蛋白的自催化加工严重受损,而 PISD 蛋白是其活性所必需的。
.0004 LIBERFARB 综合征
PISD, IVS5, GA, +5
用于讨论 PISD 基因内含子 5 中的剪接突变(c.697+5G-A, NM_001326411.1),该突变在 Liberfarb 的 2 个姐妹中以复合杂合状态被发现综合征(LIBF;618889),作者:Zhao 等人(2019),参见 612770.0003。