GTPase，IMAP 家族，成员 6； GIMAP6

• GTPase，免疫相关蛋白家族，成员 6

HGNC 批准的基因符号：GIMAP6

细胞遗传学位置：7q36.1 基因组坐标（GRCh38）：7:150,625,375-150,632,385（来自 NCBI）

▼ 说明

免疫相关蛋白（GIMAP） 家族的 GTP 酶成员，例如 GIMAP6，是淋巴细胞存活和稳态的调节因子（Schwefel et al., 2013）。

▼ 克隆与表达

通过数据库分析和 Jurkat 细胞 RNA 的 RT-PCR，Krucken 等人（2004） 鉴定了 3 个 GIMAP6 变体，编码 292、314 和 212 个氨基酸的蛋白质，计算分子量分别为 32.9、35.4 和 24.1 kD。 314 个氨基酸同工型包含 5 个 GTPases 特有的基序和一个在拟南芥 Aig1 和所有 GIMAP 中发现的保守框，以及其 C 端半部的卷曲螺旋基序和其 N 端和 N 端的内质网（ER） 定位信号。 C 末端。 292 和 212 氨基酸同工型缺乏 N 端 ER 信号，212 氨基酸同工型还缺乏 5 个 GTP 酶基序中的 2 个。 Northern 和斑点印迹分析显示 3.5 kb GIMAP6 转录物在人脾、淋巴结、肺和胎盘中高表达。 GIMAP6 在胸腺、肾、心脏和消化道中表达中等，在癌细胞系中不表达。

▼ 基因结构

克鲁肯等人（2004） 确定 GIMAP6 基因至少包含 2 个编码外显子。

▼ 测绘

通过基因组序列分析，Krucken 等人（2004） 将 GIMAP6 基因对应到染色体 7q36.1，它与 GIMAP4（608087） 处于头对头方向，与 GIMAP2（608085） 处于尾对尾方向。 GIMAP基因簇位于小鼠的6B染色体上。

▼ 基因功能

通过共纯化分析，Pascall 等人（2013） 表明人类 GIMAP6 与人类 GABARAPL2（607452） 特异性且直接地相互作用。 突变分析表明，GIMAP6 C 端 10 个氨基酸和 GABARAPL2 N 端 10 个氨基酸是相互作用所必需的。 HeLa 细胞中 GIMAP6 的过度表达导致 GABARAPL2 表达的诱导。 过表达的 GIMAP6 在诱导自噬后被招募到自噬体，并且 GIMAP6 的 C 端 10 个氨基酸是其招募到自噬体所必需的。 一致地，响应 Jurkat T 细胞和原代人血管内皮细胞的饥饿，内源 GIMAP6 重新定位到点状结构，导致 GIMAP6 在饥饿诱导的自噬过程中降解。

▼ 分子遗传学

关联待确认

有关 GIMAP6 基因变异与原发性免疫缺陷之间可能关联的讨论，请参阅 616960.0001。

▼ 等位基因变异体（1 个选定示例）：

.0001 意义不明的变体
GIMAP6、TRP86TER
该变异被归类为意义不明的变异，因为其对原发性免疫缺陷的贡献尚未得到证实。

Shadur 等人对一名来自加沙的 8 岁女孩进行了研究，她是近亲结婚生的，患有原发性免疫缺陷（2021） 鉴定了 GIMAP6 基因中的纯合 c.257G-A 转变，导致 trp86 到 ter（W86X） 的取代。 该变异是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的，在患者的哥哥身上也发现了纯合状态。 未受影响的家庭成员是该变异的杂合子。 先证者及其兄弟的外周血细胞均未显示 GIMAP6 蛋白表达。 与对照组相比，通过 半胱天冬酶-3（CASP3; 600636） 活性增加来测量，CD4 和 CD8 T 细胞显示细胞凋亡加速。 尽管淋巴细胞功能似乎正常，但淋巴细胞亚群存在一些偏差，表明存在自身免疫性疾病。 先证者一直健康到5，当时她出现了复发性化脓性中耳炎和慢性湿咳。 她还患有轻度肝脾肿大、淋巴细胞减少和 NK 细胞水平低且淋巴细胞增殖受损。 用 GSK3B（605004） 抑制剂对患者的细胞进行体外处理，在体外挽救了该表型。 她的兄弟没有临床症状。