钙结合蛋白 2; CABP2
HGNC 批准的基因符号:CABP2
细胞遗传学位置:11q13.2 基因组坐标(GRCh38):11:67,518,912-67,523,446(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Haeseleer 等人使用根据牛 Cbp2 序列设计的引物(2000) 使用视网膜 cDNA 文库通过 PCR 克隆了人类 CABP2。 推导的 221 个氨基酸蛋白的计算分子量为 24.8 kD,包含 N 端肉豆蔻酰化信号和 3 个 EF 手,对应于钙调蛋白的 EF 手 1、3 和 4(参见 114180); EF-hand 2 在 CABP2 中被部分删除。 他们还克隆了小鼠 Cbp2,并鉴定了一种较短的变体,该变体编码 160 个氨基酸的蛋白质,计算出的分子量约为 18 kD。 CABP2 与 CABP1(605563) 相似性为 72%,与钙调蛋白相似性为 56%。 人类 CABP2 与牛和小鼠同源物也有 91% 至 98% 的相似性。 Northern 印迹分析仅在视网膜中检测到 1.5-和 1.3-kb 转录本的弱表达。 几种小鼠组织的 RT-PCR 仅在视网膜中检测到表达。 索卡尔等人(2000) 证实了 CABP2 表达的这些结果。
▼ 基因结构
海瑟勒等人(2000) 确定 CABP2 基因包含 6 个外显子,跨度约为 5 kb。
▼ 测绘
通过 FISH,Haeseleer 等人(2000) 将 CABP2 基因定位到染色体 11q13.1。 索卡尔等人(2000) 指出 CABP4 基因(608965) 也对应到 11 号染色体,但距 CABP2 基因至少有 40 kb。
▼ 基因功能
海瑟勒等人(2000) 确定 CABP2 在体外被肉豆蔻酰化。 他们还发现,从牛视网膜中纯化出来的短形式 CABP2 在存在 Ca(2+) 的情况下会刺激 CAMK2(参见 114078)。 CABP2 还抑制 G 蛋白偶联受体激酶 5(GRK5;600870) 介导的视紫红质(180380) 磷酸化,尽管其对 GRK5 的亲和力低于 CABP1 所示的亲和力。
▼ 分子遗传学
Schrauwen 等人在 3 个不相关的伊朗近亲家庭中分离出常染色体隐性遗传性耳聋(DFNB93; 614899)(2012) 鉴定了 CABP2 基因(607314.0001) 中剪接位点突变的纯合性,该突变在每个家族中与疾病分离,并且在对照中未发现。 突变蛋白在等温滴定量热法中显示出改变了 Ca(2+) 结合,并且对 Ca(v)1.3 Ca(2+) 通道的调节作用较弱。
▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):
.0001 耳聋,常染色体隐性遗传 93
CABP2、IVS6DS、G-T、+1
Schrauwen 等人在 3 个无关的近亲伊朗家庭的受影响成员中分离出常染色体隐性耳聋(DFNB93; 614899)(2012) 鉴定了 CABP2 基因内含子 6 的 5 素供体位点处的 637+1G-T 颠换纯合性。 这种突变在每个家庭中随疾病而分离,并且在 100 个伊朗对照组中未发现。 单倍型分析表明,这很可能是从古代共同祖先遗传而来的创始人突变。 共享区域的小尺寸表明该突变可能已有数百年甚至数千年的历史。 对转染的 COS-7 细胞制备的 cDNA 进行分析,结果显示仅 177 bp PCR 产物,与外显子 6 的完全跳过一致,预计这会导致密码子 F164(Phe164Serfs*4) 处的移码和提前终止。 野生型和 F164X 截短的 CABP2 的等温滴定量热法表明,野生型 CABP2 存在吸热 Ca(2+) 结合反应,该反应与截短的蛋白相比较弱,表明 Ca(2+) 结合发生改变,可能会干扰其作为 Ca(2) 的作用。 +) 传感器。 HEK293T细胞转染研究表明,突变型CABP2对Ca(v)1.3 Ca(2+)通道负反馈调节的抑制作用较野生型弱。 此外,野生型CABP2显着抑制电流密度,而突变体则没有影响。