细胞粘附分子3; CADM3
- 免疫球蛋白超家族,成员 4B;IGSF4B
- TSLC1 样基因 1;TSLL1
- 连接蛋白样蛋白 1;NECL1
- 突触细胞粘附分子 3;SYNCAM3
HGNC 批准的基因符号:CADM3
细胞遗传学位置:1q23.2 基因组坐标(GRCh38):1:159,171,615-159,203,313(来自 NCBI)
▼ 描述
CADM3 基因编码细胞间粘附分子 CADM 家族的成员。CADM3 在轴突中表达,主要与 CADM4(609744) 相互作用,并在轴突引导、髓鞘形成和轴突结构的维护中发挥重要作用(Rebelo 等人总结,2021)。
IGSF4B 是一种脑特异性蛋白,与称为 nectins 的钙孤立细胞间粘附分子相关(参见 PVRL3;607147)(Kakunaga 等,2005)。
▼ 克隆和表达
Fukuhara等人通过在数据库中搜索编码与TSLC1(IGSF4;605686)肿瘤抑制因子同源的蛋白质的基因,然后筛选成人大脑cDNA文库(2001) 克隆了 IGSF4B 和 IGSF4C(CADM4; 609744),他们分别将其称为 TSLL1 和 TSLL2。预测的 398 个氨基酸的 TSLL1 蛋白具有一个胞外结构域、一个跨膜结构域和一个短胞质结构域。胞外结构域包含 3 个 Ig 样 C2 型环,具有多个潜在的 N-糖基化位点。Northern 印迹分析检测到仅限于成人和胎儿大脑的 2.6-和 3.8-kb 转录本的表达。神经胶质瘤细胞系中的表达减少或缺失,表明 TSLL1 可能是一种肿瘤抑制因子。
深见等人(2003) 克隆并表征了小鼠 Tsll1。小鼠 Tsll1 蛋白与人类蛋白有 95% 的一致性。
通过数据库分析,Biederer(2006) 鉴定了一种 SYNCAM3 剪接变体,其中外显子 2 的跳过导致紧随信号肽之后的蛋白质缺乏序列。
▼ 基因功能
Kakunaga 等人使用免疫荧光和电子显微镜(2005) 发现 IGSF4B(他们将其称为 NECL1)定位于轴突、轴突末端和神经胶质细胞突起之间的接触位点,这些突起共同形成突触、轴突束和有髓轴突。NECL1 显示出不依赖于钙的同种细胞间粘附活性。此外,它与 NECL2(IGSF4)、nectin-1(PVRL1; 600644) 或 nectin-3(PVRL3) 表现出不依赖于钙的异嗜性细胞间粘附活性,但与 NECL5(PVR; 173850) 或 nectin-2 无关。 PVRL2;600798)。酵母 2 杂交分析表明 NECL1 的 PDZ 结构域结合基序与包含 L27 结构域的蛋白质 DLG3(300189)、PALS2(MPP6; 606959) 和 CASK(300172) 结合,但与大多数其他 nectin 不同,它没有结合与 afadin 结合(MLLT4;159559)。卡库纳加等人。
▼ 基因结构
Fukuhara 等人(2001) 确定 IGSF4B 基因包含 9 个外显子,跨度 30 kb。上游区域符合CpG岛的标准。
Biederer(2006) 确定 SYNCAM3 基因包含 10 个外显子,跨度为 29 kb。
▼
使用 FISH 进行绘图,Fukuhara 等人(2001) 将 IGSF4B 基因定位到染色体 1q21.2-q22。深见等人(2003) 将小鼠 Igsf4b 基因定位到染色体 1H2-H4,这显示出与人类染色体 1q 的同源性。
▼ 分子遗传学
Rebelo 等人在 3 名患有 2FF 型腓骨肌萎缩症(CMT2FF; 619519) 的无关先证者中进行了研究(2021) 在 CADM3 基因中发现了相同的杂合错义变体(Y172C; 609743.0001)。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,在一个家族中与该疾病分离,而在另一个家族中从头发生。体外细胞表达研究表明,该突变导致异常的轴突-神经胶质细胞相互作用。
▼ 动物模型
Rebelo 等人(2021) 发现,Cadm3 基因中携带杂合 Y170C 突变(对应于人类 Y172C 突变;609743.0001)的敲入小鼠并未表现出明显的神经表型,尽管与对照组相比,坐骨神经中突变型 Cadm3 的表达有所减少。控制。神经传导速度与野生型相似。对突变小鼠坐骨神经的详细研究表明,尽管有一些纤维的髓磷脂增厚,但与野生型小鼠没有重大差异。K(v)1.2(KCNA2; 176262) 通道在旁节周围和沿节间的斑块中也存在异常积累和分布。这些发现与异常的轴突-神经胶质相互作用一致。
▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):.
0001 CHARCOT-MARIE-TOOTH 病,轴突,2FF
CADM3 型,TYR172CYS
Rebelo 等人在 3 名患有 2FF 型腓骨肌萎缩症(CMT2FF; 619519) 的无关先证者中(2021) 鉴定了 CADM3 基因外显子 5 中的杂合 c.515A-G 转换(c.515A-G,NM_021189.4),导致在高度保守的残基处发生 tyr172 至 cys(Y172C) 取代。与第二个 Ig 环相邻的胞外结构域,这对于细胞粘附至关重要。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,遗传自家庭 3 中受影响的母亲,并在家庭 1 的先证者中从头发生。来自家庭 2 的先证者的父母 DNA 无法用于分离学习。gnomAD 数据库中不存在该突变。突变在 HEK293 细胞中的表达表明它产生了异常的二硫键,表明结构蛋白重排预计会影响分子的折叠。在雪旺细胞中,突变蛋白保留在内质网中并触发未折叠蛋白反应(UPR)。对转染细胞的进一步详细研究表明,尽管少量蛋白质到达细胞膜并与其神经胶质配体 CADM4 共定位,但这种相互作用不如野生型 CADM3 观察到的那么强大。雷贝洛等人(2021) 认为轴突-神经胶质细胞界面的紊乱是该疾病的病理机制。对转染细胞的进一步详细研究表明,尽管少量蛋白质到达细胞膜并与其神经胶质配体 CADM4 共定位,但这种相互作用不如野生型 CADM3 观察到的那么强大。雷贝洛等人(2021) 认为轴突-神经胶质细胞界面的紊乱是该疾病的病理机制。对转染细胞的进一步详细研究表明,尽管少量蛋白质到达细胞膜并与其神经胶质配体 CADM4 共定位,但这种相互作用不如野生型 CADM3 观察到的那么强大。雷贝洛等人(2021) 认为轴突-神经胶质细胞界面的紊乱是该疾病的病理机制。