TATA 框结合蛋白相关因子 1B; TAF1B

  • TBP 相关因子,RNA 聚合酶 I,63-KD; TAFI63
  • SL1,63-KD 亚基

HGNC 批准的基因符号:TAF1B

细胞遗传学位置:2p25.1 基因组坐标(GRCh38):2:9,843,442-9,934,416(来自 NCBI)

▼ 正文

在缺乏称为通用转录因子(GTF) 的额外蛋白质的情况下,真核 RNA 聚合酶无法启动 RNA 合成。 GTF 在 DNA 启动子上组装成复合物并招募 RNA 聚合酶。 RNA 聚合酶 I 合成核糖体 RNA 需要多亚基复合物 SL1。 SL1 由 TATA 框结合蛋白(TBP;600075) 和 3 个 TBP 相关因子(TAF) 组成,TATA 框结合蛋白是所有 3 种 RNA 聚合酶的通用 GTF。

▼ 克隆与表达

Comai 等人使用抗 TBP 免疫亲和层析,然后进行 SDS-PAGE 分析(1994) 分离出纯化的 SL1 63-kD 亚基。 通过使用与 SL1 63-kD 亚基肽序列相对应的简并 PCR 引物筛选畸胎癌 cDNA 文库,他们获得了编码 TAF1B 的近全长 cDNA,他们将其称为 TAFI63。 科迈等人(1994) 还获得了编码 TAF1A(604903) 和 TAF1C(604905) 的 cDNA。 TAF1B cDNA 编码推导的 556 个氨基酸的蛋白质,作者认为该蛋白质在 N 末端缺失了几个氨基酸。 Western blot 分析证实 TAF1B 表达为 63 kD 蛋白。 SL1 亚基相互作用分析表明,所有 3 个 TAF1 蛋白均与 TBP 结合并相互结合。 然而,SL1 复合物与 TBP 的结合排除了 RNA 聚合酶 II 转录因子 TFIID(参见 TAF2A;313650)与 TBP 的结合。 科迈等人(1994) 得出结论,这种相互排斥的结合指导启动子和 RNA 聚合酶选择性 TBP-TAF 复合物的形成。

▼ 基因功能

Knutson 和 Hahn(2011) 表明,Rrn7(酵母 Pol I 核心因子的一个亚基)及其人类直系同源物 TAF1B 是 TFIIB(参见 189963)样因子。 尽管关系较远,但 Rrn7 具有许多与 TFIIB 样因子相关的活性。 TFIIB 相关因子之间的结构域交换表明,Rrn7 与 Pol III 一般因子 Brf1(604902) 关系最密切。 Knutson 和 Hahn(2011) 得出结论,他们的结果表明多亚基 Pols 之间起始机制的保守性,并揭示了酵母核心因子/人 SL1 在 Pol I 转录中的关键功能。

奈杜等人(2011) 表明,TAF1B(人 Pol I 基础转录因子 SL1 的一个亚基)通过预测的 N 末端锌带和细胞周期蛋白样折叠域在结构上与 TFIIB/TFIIB 样蛋白相关。 SL1 对于 Pol I 募集到核糖体 RNA 基因启动子至关重要,也具有重要的聚合酶募集作用,通过 TAF1B 进行操作。 因此,奈杜等人(2011) 得出结论,TAFIIB 相关蛋白与 Pol I 转录中的起始复合物组装和聚合酶后招募事件有关,强调了真核 Pol I、II 和 III 与古细菌转录机制之间的相似之处。

▼ 测绘

国际辐射混合测绘联盟将 TAF1B 基因测绘到 2p(stSG39145)。 迪·彼得罗等人(2000)通过荧光原位杂交将 TAF1B 基因定位到染色体 2p25。