核孔蛋白,160-KD; NUP160

  • NUP120
  • KIAA0197

HGNC 批准的基因符号:NUP160

细胞遗传学位置:11p11.2 基因组坐标(GRCh38):11:47,778,118-47,848,544(来自 NCBI)

▼ 描述

NUP160 是构成 120-MD 核孔复合体(NPC) 的多达 60 种蛋白质之一,介导核质转移(Vasu 等人,2001)。NUP160 在 NPC 的 Y 复合体中编码 NUP85(170285) 的直接相互作用伙伴,该复合体是外环支架的一部分(Braun 等人总结,2018)。

▼ 克隆和表达

通过对从尺寸分级的骨髓细胞系 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,Nagase 等人(1996) 克隆了 NUP160,他们将其命名为 KIAA0197。推导的 1,314 个氨基酸蛋白质包含组氨酸酸性磷酸酶基序。Northern印迹分析显示在所有检查的组织中都有中等表达。

瓦苏等人(2001) 鉴定出 Nup160 是非洲爪蟾卵提取物中的一种蛋白质,可与核孔篮蛋白 Nup98(601021) 和 Nup153(603948) 相互作用。肽分析显示与 KIAA0197 有同源性。针对推定的人类蛋白产生的抗体在 HeLa 细胞核边缘的斑点中检测到内源性 NUP160,HeLa 细胞的差异透化表明 NUP160 位于孔的篮侧,面向核质。

▼ 基因功能

Vasu 等人(2001) 提供的证据表明脊椎动物 Nup160 和 Nup133(607613) 与 Nup98 和 Nup153 相互作用并介导 RNA 从细胞核输出。

Mitchell 等人使用蛋白质结合测定和结构域分析(2010) 发现人类 NUP155(606694) 和 NUP160 的 N 端 β 螺旋桨区域单独但不同时地与 NPC 孔膜蛋白 POM121(615753) 的 N 端结构域相互作用,该结构域靠近核膜。米切尔等人(2010) 假设 POM121 通过将 NUP155 和 NUP160 及其结合伙伴定位在靠近核膜的位置来锚定 NPC 核心。

祖科洛等人(2007) 指出 NUP107(607617)-NUP160 核孔蛋白亚复合物包含 NUP133、NUP96(601021)、NUP85(170285)、NUP43(608141)、NUP37(609264)、SEC13(SEC13L1;600152) 和 SEH1(SEH) 1升;609263 )。NUP107-NUP160 子复合体在间期期间稳定地结合在 NPC 的两面上,并且整个子复合体在有丝分裂期间被招募到染色质。在前期,甚至在核膜破裂之前,部分子复合物就定位于着丝粒。祖科洛等人(2007) 发现 NUP107-NUP160 复合物向着丝粒的募集主要取决于 NDC80 复合物(参见 607272)和 CENPF(600236)。NUP107-NUP160 复合物的 SEH1 亚基对于将该复合物靶向着丝粒至关重要。几个 NUP107-NUP160 亚基或单独 SEH1 的共同缺失导致动粒无法建立适当的微管附着,从而诱导检查点依赖性有丝分裂延迟。有丝分裂 Ran-GTP 效应子 CRM1(XPO1; 602559) 及其结合伴侣 RANGAP1(602362)-RANBP2(601181) 复合物在着丝粒中耗尽 NUP107-NUP160 复合物后发生错误定位。

王等人(2018) 发现在条件永生化小鼠足细胞中通过短发夹 RNA 敲低 Nup160 可抑制增殖并促进细胞凋亡、自噬和细胞迁移。定量 RT-PCR、蛋白质印迹和免疫荧光分析表明,Nup160 的敲除改变了足细胞相关分子的表达和亚细胞定位,包括去氧肾上腺素(NPHS1; 602716)、podocin(NPHS2; 604766)、Cd2ap(604241) 和 α-肌节蛋白-4(ACTN4;604638)。

▼ 测绘

通过对一组人类-啮齿动物杂交细胞系的分析,Nagase 等人(1996) 将 NUP160 基因定位到 11 号染色体。

Hartz(2014) 根据 NUP160 序列(GenBank D83781) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 NUP160 基因对应到染色体 11p11.2。

▼ 分子遗传学

在 2 名患有 19 型肾病综合征(NPHS19; 618178) 的中国同胞(家族 17F00494)中,Braun 等人(2018) 鉴定了 NUP160 基因中的复合杂合突变(E803K, 607614.0001 和 R910X, 607614.0002)。这些突变是通过候选基因的靶向外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究,但预计这两种变体都会导致功能丧失。

▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):.

0001 肾病综合征,19 型(1 个家族)
NUP160、GLU803LYS
Braun 等人在 2 名患有 19 型肾病综合征的中国同胞(家族 17F00494)中(NPHS19;618178)(2018) 鉴定了 NUP160 基因中的复合杂合突变:外显子 19 中的 c.2407G-A 转换(c.2407G-A,NM_015231.1),导致保守残基处的 glu803 到 lys(E803K) 取代,以及外显子 22 中的 c.2728C-T 转换,导致 arg910 至 ter(R910X;607614.0002) 取代。这些突变是通过候选基因的靶向外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。在 gnomAD 数据库中,两种变体均以低频率被发现处于杂合状态(E803K 的 246,020 个等位基因中的 4 个,R910X 的 245,806 个等位基因中的 2 个)。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究,

.0002 肾病综合征,19 型(1 家族)
NUP160,ARG910TER
用于讨论 NUP160 基因外显子 22 中的 c.2728C-T 转变(c.2728C-T,NM_015231.1),导致 arg910 到 - Braun 等人在 2 名患有 19 型肾病综合征(NPHS19; 618178) 的同胞中以复合杂合状态发现了 ter(R910X) 取代(2018),参见 607614.0001。