网状噬菌调节蛋白 1; RETREG1
- 具有序列相似性的家族134,成员B;FAM134B
- JK1
HGNC 批准的基因符号:RETREG1
细胞遗传学定位:5p15.1 基因组坐标(GRCh38):5:16,473,053-16,616,997(来自 NCBI)
▼ 克隆和表达
通过搜索中国人群食管鳞状细胞癌(ESCC;参见 133239)中扩增的染色体 5p 区域,Tang 等人(2007) 鉴定了 FAM134B,他们将其称为 JK1。推导的 39.3-kD 蛋白具有 EGF(131530) 样结构域、3 个 N-糖基化位点、3 个 N-肉豆蔻酰化位点和许多可能的磷酸化位点。
库尔特等人(2009) 指出人类 FAM134B 蛋白含有 497 个氨基酸。结构分析表明,FAM134B 的 N 端一半有 2 个异常长的疏水片段,每个片段约 35 个氨基酸,由约 60 个氨基酸的亲水环分隔开。这种结构类似于形成内质网膜曲率的网状蛋白(参见 600865)。FAM134B 的 C 末端包含一个卷曲螺旋结构域。对成年小鼠组织的 Northern 印迹分析检测到至少 4 个 Fam134b 转录本。仅在睾丸中检测到约 1.5 kb 转录物的高表达。约 3.5 kb 的转录本在背根神经节、食道、骨骼肌和肾脏中表达较弱,而许多其他组织则显示出较弱的 Fam134b 表达。第14天的原位杂交。5 个小鼠胚胎显示出明显的感觉和自主神经节染色。在培养的小鼠背根神经节中,Fam134b 与顺式高尔基体标记共定位,并部分与反式高尔基体标记共定位。
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使用多重 RT-PCR 检测基因功能,Tang 等人(2007) 发现与正常食管细胞和组织相比,JK1 在大量 ESCC 细胞系和肿瘤中过度表达。JK1 在 NIH-3T3 小鼠成纤维细胞和 HEK293 细胞中的过度表达导致生长速率增加、软琼脂中的集落形成以及汇合培养物中的病灶形成。皮下注射 JK1 过表达的 NIH-3T3 细胞后,无胸腺裸鼠形成高级肉瘤。
哈米内茨等人(2015) 表明 FAM134 网状蛋白家族的成员是内质网(ER) 驻留受体,可与自噬调节剂 LC3(601242) 和 GABARAP(605125) 结合,并通过自噬促进 ER 降解(“ER-自噬”)。人类细胞中 FAM134B 蛋白的下调会导致 ER 扩张,而 FAM134B 过度表达会导致 ER 断裂和溶酶体降解。导致人类感觉神经病变的 FAM134B 突变蛋白(HSAN2B;613115) 无法充当 ER 吞噬受体。一致地,破坏小鼠中的 Fam134b 会导致 ER 扩张,抑制 ER 周转,使细胞对应激诱导的细胞凋亡敏感,并导致感觉神经元变性。因此,哈米内茨等人。
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通过基因组序列分析进行绘图,Tang 等人(2007) 将 FAM134B 基因定位到染色体 5p15.1,位于 δ-catenin 基因下游(CTNND2; 604275)。
▼ 分子遗传学
在 4 个不相关的家族成员中,患有 IIB 型遗传性感觉和自主神经病(HSAN2B; 613115),Kurth 等人(2009) 在 FAM134B 基因(613114.0001-613114.0004) 中鉴定出 4 个不同的纯合截断功能丧失突变。
2 名同胞,由土耳其近亲父母所生,HSAN2B、Ilgaz Aydinlar 等人(2014) 鉴定了 FAM134B 基因中的纯合截短突变(613114.0005)。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。
▼ 等位基因变异体(5 个选定示例):
.0001 神经病,遗传性感觉和自主神经病,IIB 型
RETREG1,SER309TER
沙特阿拉伯近亲家庭的 4 名受影响成员患有 IIB 型遗传性感觉和自主神经病(HSAN2B;613115),Kurth 等人(2009) 鉴定了 FAM134B 基因中的纯合 926C-G 颠换,导致 ser309 到 ter(S309X) 的取代。
.0002 神经病,遗传性感觉和自主神经病,IIB 型
RETREG1,2-BP DEL,17CT
在患有 IIB 型遗传性感觉和自主神经病(HSAN2B;613115) 的患者中,Kurth 等人(2009) 鉴定了 FAM134B 基因外显子 1 中的纯合 2-bp 缺失,导致移码和残基 133 处的过早终止(Pro7GlyfsTer133)。
.0003 神经病,遗传性感觉和自主神经病,IIB
型 RETREG1,GLN145TER
在 2 名患有遗传性感觉和自主神经病 IIB 型的同胞中(HSAN2B;613115),Kurth 等人(2009) 鉴定了 FAM134B 基因中的纯合突变,导致 gln145-to-ter(Q145X) 替换。
.0004 神经病,遗传性感觉和自主神经病,IIB 型
RETREG1,IVS7DS,TC,+
2 2 个同胞,由近亲父母出生,患有 IIB 型遗传性感觉和自主神经病(HSAN2B;613115),Kurth 等人(2009) 鉴定了 FAM134B 基因(873+2T-C) 内含子 7 中的纯合 T 到 C 转换。该突变导致在 4 个额外氨基酸后产生终止密码子。
.0005 神经病,遗传性感觉和自主神经病,IIB 型
RETREG1,1-BP DEL,826A
2 名同胞,由近亲土耳其父母出生,患有 IIB 型遗传性感觉和自主神经病(HSAN2B;613115),Ilgaz Aydinlar 等人(2014) 在 FAM134B 基因中发现了一个纯合 1-bp 缺失(c.826delA),预计会导致移码和提前终止(Ser176ValfsTer8)。在 dbSNP 或 1000 基因组计划数据库中未发现该突变。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。