具有序列相似性的家庭13,成员A; FAM13A
- FAM13A1
- KIAA0914
HGNC 批准的基因符号:FAM13A
细胞遗传学位置:4q22.1 基因组坐标(GRCh38):4:88,725,960-89,057,185(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Nagase 等人通过对从大小分级的脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(1998) 克隆了 FAM13A,他们将其命名为 KIAA0914。 转录物在其 3-prime 末端含有一个重复元件,推导的蛋白质含有 683 个氨基酸。 RT-PCR ELISA 检测到 FAM13A 在脑和卵巢中表达最高,其次是肺和肾。 在所有其他检查的组织中均检测到可变表达。
通过 EST 数据库分析和人乳腺 cDNA 文库的 PCR,Cohen 等人(2004) 克隆了 FAM13A 的 2 个剪接变体。 Variant-1(V1) 对应于 KIAA0914,编码具有 2 个卷曲螺旋结构域和 3 个核定位信号的蛋白质。 V2 编码推导的 1,023 个氨基酸的蛋白质,该蛋白质的 N 端延伸包含 V1 中不存在的 RhoGAP(参见 602732)结构域。 Northern 印迹分析检测到 5-kb V1 转录物普遍表达,在骨骼肌、胸腺、脑和肺中表达最高。 6-kb V2 转录物含量较低,主要在肾脏、胰腺、肝脏、肺和胸腺中检测到。 其他较短的转录本的表达是可变的。 Fam13a在小鼠乳腺中检测到表达,且表达在乳腺发育和分化过程中没有变化。
▼ 基因结构
科恩等人(2004)确定FAM13A基因包含25个外显子。
▼ 测绘
通过辐射杂交分析,Nagase 等人(1998) 将 FAM13A 基因定位到 4 号染色体。
通过基因组序列分析,Cohen 等人(2004) 将 FAM13A 基因定位到染色体 4q22.1。 FAM13A 基因的最后一个外显子与相反链上 FAM13AOS 基因(613300) 的最后一个外显子重叠。
▼ 分子遗传学
有关 FAM13A 基因变异与慢性阻塞性肺疾病之间可能关联的讨论,请参见 COPD(606963)。