与PMP22相关的p53效应子; PERP
- THW
- 角质细胞相关蛋白 1;KRTCAP1
- KCP1
HGNC 批准的基因符号:PERP
细胞遗传学位置:6q23.3 基因组坐标(GRCh38):6:138,088,505-138,107,419(来自 NCBI)
▼ 描述
PERP 基因编码 p53(191170)/p63(603273) 四跨膜蛋白,该蛋白是细胞凋亡介体,也是桥粒和其他细胞连接的组成部分(Duchatelet 等人总结,2019)。
▼ 克隆和表达
Hildebrandt 等人通过转移性和非转移性人类黑色素瘤细胞系之间的差异显示,然后进行 EST 数据库分析和 RT-PCR(2000) 克隆了 PERP,他们称之为 THW。PERP 在转移细胞系中下调。推导的PERP蛋白含有193个氨基酸,具有4个跨膜结构域、2个胞外结构域和3个胞质结构域。使用多组织阵列的 Northern 印迹分析检测到除外周血白细胞外的所有成人和胎儿组织中的 PERP 表达。最高表达是在食管和气管中。
▼
通过基因组序列分析进行绘图,Hildebrandt 等人(2000) 将 PERP 基因对应到染色体 6q。
Stumpf(2021) 根据 PERP 序列(GenBank BC010163) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 PERP 基因对应到染色体 6q23.3。
▼ 基因功能
Hildebrandt 等人(2000)表明PERP的下调与人黑色素瘤细胞系的转移能力相关。与非恶性乳腺上皮细胞系相比,在乳腺癌细胞系中,与原发性肿瘤细胞系相比,在源自转移的胰腺细胞系中,以及与正常组织相比,在一些肿瘤组织中,PERP被下调。希尔德布兰特等人(2000) 的结论是 PERP 是一种假定的肿瘤抑制因子。
▼ 分子遗传学
奥姆斯特德综合症 2
Duchatelet 等人在来自 3 个家庭的 4 名患有残损性掌跖角化症并伴有口周角化斑块的患者中(OLMS2; 619208)(2019) 鉴定了 PERP 基因突变的杂合性(609301.0001-609301.0003)。
Dai 等人在一名患有 OLMS2 的 7 岁汉族男孩中(2020) 鉴定了 PERP 基因中无义突变的杂合性(Y153X; 609301.0005)。
变异性及进行性红斑角化症 7
Duchatelet 等人在一名患有红斑角化症(EKVP7; 619209) 的 22 岁西班牙裔女性中(2019) 鉴定了 PERP 基因(609301.0004) 中 1 bp 缺失的纯合性。作者指出,4 名奥姆斯特德综合征患者中存在的 PERP 变异是杂合的 C 端截短突变,而这名红斑角化病患者的 N 端截短突变是纯合的。
Patel 等人在沙特阿拉伯的一个大家族中,有两个姐妹和一个表兄弟患有红斑角化症(2020) 鉴定了 PERP 基因(G156R; 609301.0006) 中错义突变的纯合性,该突变与疾病分离,并且在种族匹配的对照或 gnomAD 数据库中未发现。
▼ 动物模型
Ihrie 等人(2005) 发现小鼠 Perp 是 p53(TP53; 191170) 肿瘤抑制因子的凋亡相关靶标,在胚胎发生过程中以上皮模式表达,并且其表达依赖于 p63(TP63; 603273)。Perp -/- 小鼠出生后死亡,复层上皮出现剧烈水泡,这是粘附受损的症状。Perp 特异性定位于桥粒、对组织完整性很重要的粘附连接,并且在 Perp 缺陷的皮肤中观察到桥粒中的许多结构缺陷,表明 Perp 在促进桥粒粘附复合物的稳定组装中发挥作用。
▼ 等位基因变异体(6 个选定示例):
.0001 奥尔MSTED 综合征 2
PERP、TRP151TER、453G-A
父女(患者 3 和 4)患有伴有口周角化斑块的掌跖角化病(OLMS2;619208),Duchatelet 等人(2019) 鉴定了 PERP 基因外显子 3 中 c.453G-A 转换(c.453G-A, NM_022121) 的杂合性,导致 trp151 到 ter(W151X) 取代。
.0002 OLMSTED 综合征 2
PERP,TRP151TER,452G-A
在一名 3 岁墨西哥男孩(患者 2)中,他患有伴有口周角化斑块的残肢性掌跖角化病(OLMS2;619208),Duchatelet 等人(2019) 鉴定了 PERP 基因外显子 3 中 c.452G-A 转换(c.452G-A, NM_022121) 的杂合性,导致 trp151 到 ter(W151X) 取代。
.0003 OLMSTED 综合征 2
PERP,TYR153TER,459C-G
在一名西班牙血统的 7 岁男孩(患者 1)中,他患有伴有口周角化斑块的掌跖角化症(OLMS2;619208),Duchatelet 等人(2019) 鉴定了 PERP 基因外显子 3 中 c.459C-G 颠换(c.459C-G,NM_022121)的杂合性,导致 tyr153 至 ter(Y153X) 取代。来自患者角质形成细胞的 RNA 的定量 RT-PCR 显示 PERP 表达没有缺陷,角质形成细胞裂解物中 PERP 的免疫印迹显示出与截短形式表达一致的较低重量条带。桥粒成分的免疫染色显示 FLG(135940) 表达扩大,表明终末分化存在潜在缺陷。
.0004 变异性红角化症进展 7
PERP,1-BP DEL,112T
在一名患有红角化症(EKVP7;619209) 的 22 岁女性(患者 5)中,其出生于未受影响的西班牙裔近亲父母,Duchatelet 等人(2019) 鉴定了 PERP 基因外显子 1 中 1 bp 缺失(c.112delT, NM_022121) 的纯合性,导致移码,预计会导致提前终止密码子(Ser38LeufsTer52)。对患者角质形成细胞 RNA 进行的定量 RT-PCR 显示,与对照相比,PERP 表达显着降低,这与无义介导的衰退一致。桥粒成分的免疫染色显示 FLG(135940) 和 KRT14(148066) 的表达扩大,以及 LOR(152445) 的核定位增加,表明终末分化存在潜在缺陷。
.0005 OLMSTED 综合征 2
PERP,TYR153TER,459C-A
在一名 7 岁汉族男孩中,他患有伴有口周角化斑块的残肢性掌跖角化病(PPKM2;619208),Dai 等人(2020) 鉴定了 PERP 基因外显子 3 中 c.459C-A 颠换的杂合性,导致 tyr153 至 ter(Y153X) 取代。
.0006 变异性红斑角化症进展 7
PERP,GLY156ARG
来自沙特阿拉伯一个大型多近亲血缘家庭的 2 姐妹及其受影响的男性表兄弟患有红斑角化症(EKVP7;619209),Patel 等人(2020) 鉴定了 PERP 基因中 c.466G-A 转换(c.466G-A, NM_022121.4) 的纯合性,导致高度保守残基处的 gly156 到 arg(G156R) 取代。该突变与家族中的疾病完全分离,并且在 2,379 个种族匹配的外显子组或 gnomAD 数据库中未发现。患者来源的角质形成细胞的免疫荧光染色显示细胞质中存在弥漫性 PERP 信号;相反,对照细胞显示出与细胞膜中的细胞角蛋白-14(KRT14;148066)共定位的强PERP信号。