PALS1 相关紧密连接蛋白; PATJ
- PATJ,碎屑细胞极性复合物
- IAD 样;INADL
- INAD,果蝇,同源物
HGNC 批准的基因符号:PATJ
细胞遗传学定位:1p31.3 基因组坐标(GRCh38):1:61,742,480-62,163,915(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
光转导是利用光能产生内部信使的过程,随后导致感光细胞膜电位的瞬时变化。Shieh 和 Niemeyer(1995) 发现果蝇 InaD(失活无后电位 D)蛋白在视觉级联的调节和失活中发挥着重要作用。InaD 包含 2 个 PDZ 结构域(参见 PDZK1;603831)。一个 PDZ 结构域与 TRP 钙通道相互作用,有助于钙电容进入果蝇感光细胞。通过搜索 EST 数据库,Philipp 和 Flockerzi(1997) 鉴定了编码 InaD 人类同源物的 cDNA。预测的 1,524 个氨基酸的人类蛋白质(作者将其称为 INADL)与 InaD 有 27% 的序列同一性。INADL 包含 5 个 PDZ 域。Philipp 和 Flockerzi(1997) 还分离了编码缺少 2 或 3 个 PDZ 结构域的 INADL 截短版本的 cDNA。Northern 印迹分析显示 INADL 在人脑中以 5.4 kb mRNA 的形式表达;另外,还检测到了不太丰富的转录本。
罗等人(2002)获得了编码 INADL 的全长 cDNA,他们将其命名为 PATJ。该蛋白包含 10 个 PDZ 结构域,并与 MPP5(606958) 和 CRB1(604210) 紧密连接。
通过数据库分析,Lemmers 等人(2002) 鉴定出至少 6 种具有选择性剪接或不同翻译起始位点的人类 INDAL cDNA。Northern 印迹分析在膀胱、睾丸、卵巢、小肠、结肠、心脏、骨骼肌和胰腺中检测到一个主要的 7-kb 转录物。在睾丸中也检测到了 4.1 kb 的转录本。Caco-2 人结肠癌细胞表达 7、4.1 和 3 kb 的转录物,RT-PCR 揭示了许多替代剪接形式。蛋白质印迹分析在人结肠和转染的 Caco-2 细胞的膜部分中检测到几种 135 至 230 kD 的 INDAL 蛋白。Caco-2 细胞的膜和胞浆部分均存在 75 kD 的蛋白质。免疫电子显微镜将 INDAL 定位在人结肠和 Caco-2 细胞的紧密连接附近,通常位于顶端侧,
▼ 基因功能
Vaccaro 等人(2001) 通过筛选 lambda 噬菌体上展示的随机肽库,确定了人 INDAL 的 7 个分离的 PDZ 结构域中每一个的共有配体。每个 PDZ 结构域都有独特的肽结合偏好。
莱默斯等人(2002) 发现犬肾细胞中人 INADL 的过度表达破坏了 ZO1(TJP1; 601009) 和 ZO3(TJP3; 612689) 紧密连接的定位。INADL 的 N 端结构域与 CRB3(609737)(一种假定的紧密连接蛋白)的 C 端区域相互作用。莱默斯等人(2002) 得出的结论是 INADL 可能参与调节紧密连接的完整性。
罗等人(2002) 确定 Tjp3 与 PATJ 相互作用,并且两种蛋白质在体内共定位于紧密连接。体外研究表明,PATJ 的第六个和第八个 PDZ 结构域分别介导与 Tjp3 C 末端结构域和 Cldn1(603718) 的相互作用。罗等人(2002) 表明 TJP3-PATJ 相互作用在将 PATJ 及其相关蛋白 CRB1(609737) 和 MPP5(606958) 招募到紧密连接中发挥作用。
Shin 等人利用 RNA 干扰(2005) 表明,犬肾细胞中的 Patj 敲除延迟了紧密连接的形成,并导致细胞极化缺陷。这些影响通过重新引入 Patj 而被逆转。
▼ 测绘
国际辐射混合定位联盟将 INADL 基因定位到 1 号染色体(RH94138)。