聚(ADP-核糖)聚合酶家族,成员 9; PARP9
- 聚(ADP-核糖)聚合酶 9
- B-侵袭性淋巴瘤 1; BAL1
- BAL
HGNC 批准的基因符号:PARP9
细胞遗传学位置:3q21.1 基因组坐标(GRCh38):3:122,527,924-122,564,784(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Aguiar 等人通过对原发性弥漫性大 B 细胞淋巴瘤进行差异显示分析,然后筛选抗 Ig 激活的脾 B 细胞 cDNA 文库(2000)克隆了 PARP9,他们称之为 BAL。 他们鉴定了分别编码推导的 819 个氨基酸和 854 个氨基酸的蛋白质的主要和次要转录本。 N 末端有 2 个宏结构域,与组蛋白 MacroH2A 的非组蛋白区域同源(参见 H2AFY;610054),C 末端包含一个 α 解旋酶区域,具有 2 个预测的卷曲螺旋结构域和一个预测的 SH3 结合位点。 对 28 例原发性弥漫性大 B 细胞淋巴瘤的半定量 RT-PCR 检测到,与低风险淋巴瘤相比,高风险淋巴瘤中的 PARP9 表达显着较高。 人体组织的 Northern blot 分析检测到在骨骼肌、脾脏、结肠、外周血淋巴细胞、淋巴结和胎儿肝脏中强表达,在心脏、胎盘、肺、成人肝脏、肾脏、胰腺、胸腺、前列腺、睾丸、卵巢和小肠中表达较低。 免疫荧光和亚细胞分离研究将 PARP9 定位于转染的 NIH3T3 细胞和 B 淋巴细胞的细胞核。 蛋白质印迹分析检测到,与具有生发中心的细胞相比,具有激活 B 细胞表型的细胞系中 PARP9 表达更高。
▼ 基因功能
阿吉亚尔等人(2000)证明,与对照相比,PARP9转染的细胞系显示出4倍高的细胞迁移,并表明PARP9可能促进高危弥漫性B细胞淋巴瘤的迁移和遗传。 阿吉亚尔等人(2005) 表明 PARP9 介导转录抑制,并且抑制需要 2 个大结构域。 与 PARP15(612066) 和 PARP14(610028) 不同,PARP9 不表现出聚(ADP-核糖) 聚合酶催化活性。
尤什琴斯基等人(2006) 使用转录分析表明 PARP9 诱导 IRF7(605047) 和 STAT1(600555) 的转录。 他们报告说,PARP9 是 BBAP(DTX3L; 613143) 的相互作用伙伴,共享双向 IFN γ(IFNG; 147570) 响应启动子。 免疫组织化学研究发现,共表达的 PARP9 和 BBAP 主要定位于恶性 B 细胞的细胞质,核定位不太明显; 然而,在单独表达 PARP9 的细胞和 siRNA 敲低 BBAP 表达的细胞中检测到 PARP9 的核定位。
▼ 基因结构
尤什琴斯基等人(2006) 确定 PARP9 基因与 BBAP 基因(DTX3L) 以头对头的方向排列。
▼ 测绘
通过 FISH 和体细胞杂交分析,Aguiar 等人(2000) 将 PARP9 基因对应到染色体 3q21。 通过基因组序列分析,Aguiar 等人(2005) 表明 PARP9、PARP14(610028) 和 PARP15(612066) 串联定位在染色体 3q21 上的 200 kb 区域内。