血小板-白细胞C 激酶底物 同源结构域蛋白,B 族,成员 1; PLEKHB1

  • 血小板-白细胞C 激酶底物 同源域含有蛋白,视网膜,1;PHR1
  • KPL1
  • 大黄素 1;EVT1

HGNC 批准的基因符号:PLEKHB1

细胞遗传学位置:11q13.4 基因组坐标(GRCh38):11:73,646,581-73,662,819(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Xu等人通过差异显示来识别在视网膜中优先表达的基因(1999)克隆了PLEKHB1,并将其命名为PHR1,并通过脑RNA的5-prime RACE获得了全长cDNA。他们还从全眼 cDNA 文库中克隆了小鼠 Phr1。全长人和小鼠 PHR1 蛋白含有 243 个氨基酸,氨基酸一致性达 94%。PHR1 在其 N 末端包含一个 血小板-白细胞C 激酶底物(PLEK; 173570) 同源结构域(PHD),在其 C 末端包含一个 27 个氨基酸的跨膜片段。它还具有多个酪蛋白激酶 II(参见 115440)磷酸化位点和一个潜在的蛋白激酶 C(PKC;参见 176960)磷酸化位点。徐等人(1999) 确定使用 2 个转录起始位点和外显子 7 的选择性剪接会在人和小鼠中产生 4 个 PHR1 转录本。对人体组织组的 Northern 印迹分析显示,一个主要的 2.0-kb 转录物在视网膜和大脑中高水平表达,而在其他几种组织中表达量低得多。在淋巴母细胞或成纤维细胞中未检测到表达。RT-PCR 在视网膜中检测到所有 4 个 PHR1 转录本,其中 2 个转录本占主导地位。另外 2 个转录本在大脑中显着表达。对几种哺乳动物的视网膜进行免疫组织化学定位和原位杂交,将 PHR1 定位于视杆细胞和视锥细胞的外节以及视网膜神经节细胞的质膜。以 2 个转录本为主。另外 2 个转录本在大脑中显着表达。对几种哺乳动物的视网膜进行免疫组织化学定位和原位杂交,将 PHR1 定位于视杆细胞和视锥细胞的外节以及视网膜神经节细胞的质膜。以 2 个转录本为主。另外 2 个转录本在大脑中显着表达。对几种哺乳动物的视网膜进行免疫组织化学定位和原位杂交,将 PHR1 定位于视杆细胞和视锥细胞的外节以及视网膜神经节细胞的质膜。

通过数据库分析,Krappa 等人(1999) 鉴定了小鼠、大鼠和人类 PLEKHB1,他们将其称为 EVT1。EVT1 蛋白与 EVT2(PLEKHB2;618452) 具有约 40% 的氨基酸同一性。EVT1 包含一个 N 端 PHD,预计会折叠成一个 7-β 链夹心结构,C 端由保守的 α 螺旋封闭。PHD 的下游是一个 35 个氨基酸的选择性剪接结构域,可能充当蛋白质-蛋白质相互作用模块,后面是潜在的磷酸化位点和 C 端膜锚定点。Northern blot分析表明Evt1 mRNA在大鼠神经系统中特异性表达。

使用差分显示,安德鲁斯等人(2000) 鉴定出 Plekhb1(他们将其命名为 Kpl1)作为大鼠气管上皮细胞培养物分化诱导的转录物。使用该序列作为查询,他们鉴定了 KPL1 的人类 EST,并从 21 天的人类气管上皮细胞培养物 RNA 中扩增了 KPL1。安德鲁斯等人(2000) 鉴定了大鼠和人类 KPL1 的剪接变体。大鼠和人类蛋白质具有 94% 的序列同一性,包括可变剪接区域的相似性。

在小鼠中,Xu 等人(2004)发现Phr1在几种类型的感觉神经元中表达,包括光感受器、周围视网膜神经节细胞、嗅觉受体神经元、前庭和耳蜗毛细胞、耳蜗齿间细胞和心室周围器官的神经元,表明该蛋白质在感觉方式中具有强大的作用。缺乏 Phr1 的小鼠没有明显的感觉异常。

▼ 基因功能

Xu 等(1999) 确定 Phr1 的表达在小鼠视网膜中显示出适度的昼夜变化,在黑暗中增加了 2 倍。脑内Phr1表达无周期性变化。体外结合测定表明,人类 PHR1 变体均未结合任何测试的肌醇磷酸盐,但它们确实与转导蛋白 β-γ 亚基结合(参见 189970)。转导蛋白的结合依赖于全长 PHR1 的 N 端 137 个残基,表明存在于所有 PHR1 同工型中的 PH 结构域(氨基酸 21 至 128)介导结合。

安德鲁斯等人(2000) 发现,在视黄酸的作用下经历粘膜纤毛分化的大鼠气管上皮细胞中 Kpl1 表达增加。在缺乏视黄酸的情况下,培养物主要变成鳞状细胞并且 Kpl1 表达下调。

▼ 基因结构

Xu 等(1999) 确定小鼠和人类 PLEKHB1 基因包含 9 个外显子,跨度约为 18 kb。在这两个物种中,第一个外显子都是未翻译的。5-prime 非翻译区的选择性剪接产生 2 个不同的启动子。5 素数较多的启动子似乎仅在视网膜中发挥作用,并且包含至少 3 个光感受器特异性 CRX(602225) 元件的拷贝。位于内含子 2 中的内部启动子在大脑中发挥着重要作用,显示出更一般功能的特征。

通过 FISH 和辐射混合分析进行绘图,Xu 等人(1999) 将 PLEKHB1 基因定位到染色体 11q13-q14.1。通过回交分析,他们将小鼠 Plekhb1 基因定位到 7 号染色体、Tyr 基因(606933) 的端粒以及与人类染色体 11q13.5-q14.1 显示同线性的区域。

通过数据库分析,Krappa 等人(1999) 将 PLEKHB1 基因定位到染色体 11q13。