外泌体成分 7; EXOSC7
- 核糖体 RNA 加工蛋白 42,酿酒酵母,同源物; RRP42
- KIAA0116
HGNC 批准的基因符号:EXOSC7
细胞遗传学位置:3p21.31 基因组坐标(GRCh38):3:44,976,244-45,012,668(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Nagase 等人通过对从人未成熟骨髓细胞系 KG-1 的 cDNA 文库中随机选择的 cDNA 进行测序(1995) 分离出编码 RRP42 的 cDNA,他们将其命名为 KIAA0116。 预测的 290 个氨基酸 KIAA0116 蛋白在 225 个氨基酸区域与 75 kD 自身抗原(PMSCL1;606180) 具有 26.7% 的一致性。 Northern 印迹分析检测到所有测试组织中 KIAA0116 的表达。
本质上不稳定的哺乳动物 mRNA 在其 3 素非翻译区内含有富含 AU 的元件(ARE)。 在酵母中,3-prime-to-5-prime mRNA 降解是由外泌体(一种多亚基颗粒)介导的。 陈等人(2001) 通过质谱纯化和表征了人类外泌体,发现其组成与其酵母对应物相似。 他们在人外泌体中鉴定出了以下蛋白质亚基:p7,与酵母 Rrp4 蛋白(602238) 同源; p8,与酵母Rrp42蛋白同源; p9,与酵母 Rrp43 蛋白同源(OIP2;606019); p10,与酵母 Rrp40 蛋白(606489) 同源; p11,与酵母 Mtr3 蛋白(606490) 同源; p12A,与酵母 Rrp41 蛋白(606491) 同源; p12B,与酵母 Rrp46 蛋白(606492) 同源; 和 p13,它与酵母 Csl4 蛋白(606493) 同源。 他们还鉴定了 2 个外泌体相关因子 p1(600478) 和 p14(MPP6; 605500),它们与任何酵母外泌体成分均不同源。
▼ 基因功能
Chen 等人使用无细胞 RNA 衰减系统(2001) 证明哺乳动物外泌体是含 ARE RNA 的快速降解所必需的,但 Poly(A) 缩短则不需要。 他们发现哺乳动物外泌体本身不能识别含有 ARE 的 RNA。 ARE 识别需要某些 ARE 结合蛋白,这些蛋白可以与外泌体相互作用并将其招募到不稳定的 RNA 上,从而促进它们的快速降解。
Raijmakers 等人使用哺乳动物 2-hybrid 和 GST Pull-down 分析(2002) 发现 CSL4 蛋白(而不是缺乏 N 端或 C 端残基的突变体形式)直接与 RRP42 和 RRP46 相互作用。 缺失突变体也无法与外泌体相互作用。 RRP42和RRP46不相互交互。
▼ 测绘
通过对一组人类/啮齿动物杂交细胞系的分析,Nagase 等人(1995) 将 KIAA0116 基因对应到 3 号染色体。
Gross(2014) 根据 EXOSC7 序列(GenBank BC012831) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 EXOSC7 基因对应到染色体 3p21.31。