TBC1 域家族,成员 10A; TBC1D10A
- EPI64
HGNC 批准的基因符号:TBC1D10A
细胞遗传学位置:22q12.2 基因组坐标(GRCh38):22:30,291,990-30,326,941(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Reczek 和 Bretscher(2001) 使用亲和色谱法在人胎盘微绒毛中寻找与皮质支架蛋白 EBP50(SLC9A3R1; 604990) PDZ 结构域结合的蛋白质,鉴定出一种新蛋白质 EPI64(64 kD 的 EBP50-PDZ 相互作用蛋白)。 通过质谱测序分析和数据库搜索,他们确定 EPI64 基因编码一个以氨基酸 DTYL 结尾的推导的 508 个氨基酸的蛋白质(与 EBP50 第一个 PDZ 结构域的最佳肽结合共有序列匹配的基序)和 TBC/rabGAP 结构域。 对小鼠和人体组织的蛋白质印迹分析表明,EPI64 蛋白存在于除骨骼肌之外的大多数组织和人体细胞系中,并且在胎盘微绒毛中富集。 荧光显微镜表明EPI64在人胎盘的合体滋养层区域富集,该区域含有丰富的富含肌节蛋白的微绒毛。 在人 JEG-3 细胞中,EPI64 特异性定位于表面微绒毛,与 EBP50 共定位,并与埃兹蛋白(123900) 和皮质 F-肌节蛋白(参见 102610) 显着重叠。
▼ 基因功能
Reczek 和 Bretscher(2001) 使用 GST 融合实验表明,野生型 EPI64 与 EBP50 和 E3KARP(SLC9A3R2;606553) 的 PDZ 结构域结合,而在极端 C 末端(DTYLA) 具有额外丙氨酸的突变型 EPI64 则不然。 EPI64 与 EBP50 的关联似乎是 EPI64 在胎盘微绒毛中定位所必需的,因为 DTYLA 突变体构建体的引入扰乱了这种定位。 Reczek 和 Bretscher(2001) 使用 ezrin 和 EBP50 的不同结构域组装了人胎盘微绒毛蛋白复合物,并证明 EPI64 是这些复合物的组成部分。
通过筛选编码假定 RabGAP 的人类和小鼠 cDNA 是否具有催化 Rab 蛋白中 GTP 交换的能力,Itoh 和 Fukuda(2006) 发现 EP164 和 TBC1D10B(613620) 都充当小鼠 Rab27a(603868) 的 GAP,并在小鼠黑素细胞系中诱导黑素体聚集。 当与 Rab27a 共表达时,EP164 和 TBC1D10B 均增加 Rab27a 的 GTPase 活性并减少 GTP-Rab27a 的量。 EPI64 不能作为任何其他测试的 Rab 蛋白的 GAP。 EPI64 TBC 结构域中 asp157 或催化 arg160 的突变消除了 EPI64 诱导黑素体聚集的能力。
▼ 基因结构
Reczek 和 Bretscher(2001) 确定 EPI64 基因包含 9 个外显子。
▼ 测绘
通过序列分析,Reczek 和 Bretscher(2001) 将 EPI64 基因定位到染色体 22q12.1-qter。