含有三联基序的蛋白质 29; TRIM29

共济失调-毛细血管扩张 D 组相关蛋白；ATDC

HGNC 批准的基因符号：TRIM29

细胞遗传学位置：11q23.3 基因组坐标（GRCh38）：11:120,111,286-120,138,113（来自 NCBI）

▼ 克隆和表达

Kapp 等人（1992）克隆了 ATDC，这是共济失调毛细血管扩张症的候选基因（AT; 208900），对应到包含 AT 基因座的染色体 11q23 区域。他们拯救了互补组D的AT细胞系中部分恢复电离辐射抗性的整合粘粒序列，并通过筛选HeLa细胞cDNA文库获得了ATDC cDNA。RNA印迹分析检测到1.8、2.6、3.0、4.7和5.7 kb的ATDC转录物，它们在不同细胞系中表达不同。3.0-kb 转录本对应于从 HeLa 细胞中分离出的 cDNA，是 HeLa 细胞中最丰富的转录本。Southern印迹分析表明ATDC是人类基因组中的单拷贝基因。

莱昂哈特等人（1994）表征了从 HeLa 细胞中分离出的 3.0-kb ATDC cDNA（Kapp 等人，1992）。推导的 588 个氨基酸蛋白质包含 2 个保守的锌指基序和一个相邻的亮氨酸拉链基序。具有不同外显子 3 剪接位点的罕见 2.9 kb cDNA 编码亮氨酸拉链区域末端缺少 34 个氨基酸的蛋白质。

Reymond 等人使用 B框结构域共有序列筛选 EST 数据库中的新 TRIM 家族成员（2001）鉴定并克隆了小鼠和人类 TRIM29。推导的蛋白质包含 1 型和 2 型 B框结构域以及卷曲螺旋区域。Northern 印迹分析在胎盘、前列腺和胸腺中检测到 3 kb 转录物。在人畸胎癌细胞系中，TRIM29 定位于丝状细胞质结构。

▼ 基因功能

布尔佐斯卡等人（1995）发现 ATDC 蛋白与中间丝蛋白波形蛋白（193060）、蛋白激酶 C（176960）底物和共定位蛋白以及蛋白激酶 C 抑制剂 PKCI1（601314）发生物理相互作用。对用编码表位标记的 ATDC 的质粒转染的培养细胞进行间接免疫荧光分析，将蛋白质定位于波形蛋白丝。布尔佐斯卡等人（1995）表明 ATDC 和 PKCI1 蛋白可能是由电离辐射诱导并由蛋白激酶 C 介导的单一转导途径的组成部分。ATM 基因（607585）编码具有假定的磷脂酰肌醇 3-激酶结构域的蛋白质并作为脂质介导的信号分子发挥作用，这一事实与 ATDC 和 PKC 在该途径中 ATM 下游发挥作用的模型一致。

Reymond 等人使用酵母 2-杂交测定和免疫共沉淀实验（2001）表明TRIM29可以形成更高级的同聚复合物。TRIM29 的卷曲螺旋区域对于高分子复合物的形成和 TRIM29 的特异性细胞内定位是必不可少的。

Hosoi 等人使用 Northern blot 分析（2006）在 11 个肿瘤细胞系中的 4 个中检测到没有 ATDC 转录物，并且使用蛋白质印迹分析，他们在其中 8 个细胞系中没有检测到 ATDC 蛋白。将 ATDC 转染到缺乏 ATDC mRNA 和蛋白表达的 2 个肿瘤细胞系中，抑制了软琼脂中的集落形成，表明抑制的 ATDC 表达与恶性表型相关。

Dou 等人使用定量 RT-PCR 和免疫印迹分析（2019）表明，小鼠 NK 细胞响应 Il12（参见 161560）和 Il18（600953）的刺激而诱导 Trim29 表达。小鼠 NK 细胞中条件性删除 Trim29 可促进活化 NK 细胞中 Ifn-γ（147570）的产生，并增强宿主对病毒感染的防御，表明 Trim29 负向调节 Ifn-γ 的表达并抑制 NK 功能。NK 细胞中 Ifn-γ 的产生是动态的，并且与 Tab2（605101）表达相关。Trim29 的缺失还刺激了小鼠活化 NK 细胞中 Tab2 的表达，因为 Trim29 和 Tab2 通过各自的 C 末端和 N 末端相互作用，并且 Trim29 通过 K48 连接泛素化诱导 Tab2 降解。

▼ 基因结构

Leonhardt 等人（1994）确定ATDC基因的编码区包含至少9个外显子。

▼ 测绘

通过对与 ATDC 相关的粘粒克隆进行测序，Kapp 等人（1992）将 ATDC 基因定位到染色体 11q23 上 THY1（188230）和 D11S83 之间的区域。Reymond 等人使用辐射混合分析（2001）将 TRIM29 基因定位到染色体 11q22-q23。

▼ 动物模型

Wang 等人在表达 Kras（190070） G12D 突变的小鼠中，已知该突变会导致胰腺肿瘤发生（2019）有条件地消除胰腺特异性 Atdc 表达，并将这些小鼠命名为 KPCYA -/-。Atdc 的消融不影响胰腺发育和形态，KPCYA -/- 小鼠以预期的孟德尔比率出生，并且出生时表型正常。与对照组相比，KPCYA -/- 小鼠没有发生胰腺腺癌（PDA），并且存活时间更长。在表达 Kras（G12D） Atdc 的小鼠中，在 Kras G12D 诱导的腺泡导管化生（ADM）形成过程中，腺泡细胞中 Atdc 上调，并且 Atdc 是 ADM 进展为胰腺上皮内瘤变所必需的。Atdc 通过激活 β-catenin（116806）信号传导上调 Sox9（608160）表达来促进 Kras G12D 诱导的 ADM。因此，Atdc 的敲除导致 Sox9 下调并抑制 Kras G12D 诱导的 ADM。王等人（2019）发现，人类患者胰腺组织中的 ADM 病变和 PDA 中 ATDC、β-catenin 和 SOX9 的表达增加，支持了这些结果。