影响 RWD 结构域蛋白; IMPACT

  • 印记和古老基因,小鼠,同源物
  • RWD 域包含蛋白 5; RWDD5

HGNC 批准的基因符号:IMPACT

细胞遗传学位置:18q11.2 基因组坐标(GRCh38):18:24,426,670-24,453,531(来自 NCBI)

▼ 说明

IMPACT 是印记小鼠基因的非印记人类同源物(Okamura 等,2000)。

▼ 克隆与表达

Okamura 等人通过在 EST 数据库中搜索与小鼠 Impact 相似的序列,然后对成人和胎儿大脑 RNA 进行 5-prime 和 3-prime RACE 以及 RT-PCR(2000) 克隆人影响。 推导的 320 个氨基酸蛋白质与小鼠蛋白质有 82.2% 的同一性。 作者还在爪蟾中发现了一个密切的直系同源物,在无脊椎动物、细菌和植物中的保守性较弱。 Northern印迹分析检测到在所检查的所有16个成人和4个胎儿人体组织中,约3.9kb的主要IMPACT转录物和约2.1kb的次要转录物的可变表达。 2 个转录本的 3-prime UTR 似乎有所不同。 与小鼠 Impact 不同,人类基因是双等位基因表达的。

Pereira 等人使用蛋白质印迹分析(2005)发现小鼠Impact主要在大脑中表达,在肺、肾和睾丸中表达较弱,在脾、心脏、肝脏和胰腺中很少或没有表达。 免疫组织化学分析显示下丘脑神经元中有丰富的 Impact 表达,而其他区域(包括海马和梨状皮层)有分散的神经元表达。

▼ 基因功能

冈村等人(2000)发现小鼠Impact仅由父系等位基因印记和表达。 他们在小鼠基因的内含子 1 内发现了一个 CpG 岛,该岛具有印记基因的串联重复结构特征,并且该 CpG 岛在母体等位基因上高度甲基化。 双等位基因表达的人类基因缺乏内含子 CpG 岛。

佩雷拉等人(2005) 发现在亮氨酸饥饿条件下,小鼠胚胎成纤维细胞中 Impact 的过表达抑制了 Eif2-α(EIF2S1;603907) 的 Gcn2(EIF2AK4;609280) 依赖性磷酸化。 Impact 的过度表达还消除了 Eif2-α 下游靶标 Atf4(604064) 和 Chop(DDIT3; 126337) 的表达。

罗夫等人(2013) 发现原代小鼠海马神经元和 N2a 神经母细胞瘤细胞分化后 Impact 的表达增加,同时 Gcn2 磷酸化减少。 分化后,Impact 与翻译核糖体、增强翻译起始和 Atf4 表达下调相关。 内源性影响促进神经突生长,而 Gcn2 抑制神经突生长。

▼ 基因结构

冈村等人(2000) 确定 IMPACT 基因包含 11 个外显子,跨度约为 30 kb。 最后一个外显子长度超过 2 kb。 上游区域包含 Alu 元件,启动子区域和第一个外显子包含 CpG 岛。 人类 IMPACT 基因缺乏小鼠基因内含子 1 中发现的差异甲基化 CpG 岛。

▼ 测绘

Okamura 等人使用 FISH(2000) 将 IMPACT 基因定位到染色体 18q11.2-q12.1。 他们将小鼠 Impact 基因定位到染色体 18A2-B1 的一个区域,该区域与人类染色体 18q11.2-q12.2 具有同源性。