SAM 域、SH3 域和核定位信号 1; SAMSN1
- 含有SH3和SAM结构域1的造血转换因子; HACS1
HGNC 批准的基因符号:SAMSN1
细胞遗传学位置:21q11.2 基因组坐标(GRCh38):21:14,485,228-14,659,417(来自 NCBI)
▼ 说明
SAMSN1 是推定接头和支架蛋白的新基因家族的成员,其中包含 SH3 和 SAM(无菌 α 基序)结构域(Claudio 等,2001)。
▼ 克隆与表达
在多发性骨髓瘤中表达的基因的转录研究中,Claudio 等人(2001) 鉴定了一个在造血细胞中表达受限的克隆。 通过对来自浆细胞白血病和造血祖细胞文库的 cDNA 克隆进行文库筛选和全长测序,他们发现这些克隆对应于一种新基因 SAMSN1,他们将其命名为 HACS1。 SAMSN1 编码推导的 441 个氨基酸的蛋白质,其中包含 2 个经常与信号分子相关的结构域:一个 SH3 基序,与 CRK 蛋白(164762) 的 SH3 结构域具有 39% 的同源性,位于蛋白质的中半部分,以及一个朝向 C 末端的 SAM 结构域。 它还包含几个预测的共有核定位信号和酪氨酸激酶磷酸化基序。 Northern 印迹分析揭示了 2.2 kb SAMSN1 转录物在人类免疫组织和造血细胞类型(包括正常骨髓、急性髓性白血病和多发性骨髓瘤)中的表达; 在心脏、脑、胎盘和肺等其他组织中也观察到低水平表达。 针对 SAMSN1 的多克隆抗体可识别 49.5 kD 的蛋白质。 免疫染色和细胞分级分离研究将该蛋白质主要定位于细胞质。
▼ 基因功能
基于 SAMSN1 中 SH3 和 SAM 结构域的存在及其主要细胞质定位,Claudio 等人(2001) 表明 SAMSN1 与 CRKL(602007) 一样,可以作为细胞质接头来介导信号传导途径。
Zhu 等人通过微阵列和 RT-PCR 分析(2004) 在小鼠和人类活化的 B 淋巴细胞中检测到 HACS1 表达上调,但在记忆和初始 B 淋巴细胞中没有上调。 IL4(147780) 导致的 HACS1 上调依赖于 STAT6(601512),并涉及 NFKB(164011) 通路。 与 HACS1 相比,HACS2(SLY;300441) 的表达在 IL4 存在的情况下没有改变。 使用人 HACS1 作为诱饵对小鼠脾 cDNA 文库进行酵母 2 杂交分析,确定 Pirb 是潜在的结合伴侣。 朱等人(2004) 得出结论,HACS1 被 B 细胞激活信号上调,并参与 B 细胞激活和分化。
▼ 基因结构
克劳迪奥等人(2001) 确定 SAMSN1 基因跨度约为 50 kb,并且包含至少 9 个外显子。
▼ 测绘
通过序列分析,Claudio 等人(2001) 将 SAMSN1 基因定位到染色体 21q11.2 的一个区域,该区域经常被造血系统恶性肿瘤中的易位事件破坏(Mitelman 等,1997)。