神经母细胞瘤,易感性,4; NBLST4
细胞遗传学定位:6p22 基因组坐标(GRCh38):6:15,200,001-30,500,000
有关神经母细胞瘤的一般表型描述和遗传异质性的讨论,请参阅 NBLST1(256700)。
▼ 测绘
马里斯等人(2008) 提供了 6p22 染色体上 1 个或多个候选神经母细胞瘤易感基因的证据。 在 1,032 名神经母细胞瘤患者和 2,043 名欧洲血统对照者中,作者观察到疾病与 6p22 染色体上的 3 个 SNP 之间存在关联:rs6939340、rs4712653 和 rs9295536,产生的 p 值为 1.71 x 10(-9) 至 7.01 x 10(-10)(等位基因优势比为 1.39 至1.40)。 研究结果表明,常见的遗传变异可能会增加神经母细胞恶性转化的风险。
在对 397 名高危侵袭性神经母细胞瘤患者进行的全基因组分析中,这些患者来自 Maris 等人研究中的 1,032 名患者(2008) 和 2,043 个对照,Capasso 等人(2009) 证实了 Maris 等人确定的 6p22 处 3 个 SNP 的关联(2008) 认为与神经母细胞瘤的高风险亚型相关性更显着。
▼ 分子遗传学
潘迪等人(2014) 指出 rs6939340 位于 NBAT1 基因(616206) 的内含子 2 中,该基因产生长非编码 RNA。 细胞培养和小鼠异种移植模型证明 NBAT1 具有肿瘤抑制特性,例如抗细胞增殖和抗细胞侵袭。 在 93 名神经母细胞瘤患者中,与 NBAT1 低表达相比,NBAT1 高表达与更好的预后和更长的生存期相关。 这些结果在 498 例神经母细胞瘤的孤立队列中得到验证,表明 NBAT1 可能作为预测无事件生存的孤立预后标志物。 对高危肿瘤中 rs6939340 A-to-G 的基因组 DNA 进行测序表明,具有 A/A 或 A/G 基因型的肿瘤比 G/G 肿瘤具有更高的 NBAT1 表达。 与 G/G 基因型相比,携带 A/A 基因型的片段在启动子载体中产生更多的荧光素酶活性,这表明跨越 SNP 的区域可能含有推定的增强子元件。 高风险患者在 NBAT1 启动子侧翼的 5 个 CpG 位点表现出高甲基化,而低风险患者在这些位点表现出低甲基化和较高的 NBAT1 表达。 研究结果表明,遗传和表观遗传变化是 NBAT1 差异表达的基础,并表明这些变化可能与不同亚型的神经母细胞瘤有关。