NADH 脱氢酶(辅酶q10)复合物 I,组装因子 8; NDUFAF8

  • NADH-辅酶q10氧化还原酶复合物组装因子 8
  • 染色体 17 开放解读码组 89;C17ORF89

HGNC 批准的基因符号:NDUFAF8

细胞遗传学位置:17q25.3 基因组坐标(GRCh38):17:81,239,311-81,241,310(来自 NCBI)

▼ 描述

NDUFAF8 是一种呼吸复合物 I 组装因子(Floyd et al., 2016)。

▼在 HEK293 和 HepG2 细胞系中使用亲和富集质谱法进行 克隆和表达,Floyd 等人(2016) 将 7-kD 线粒体蛋白 NDUFAF8 鉴定为 NDUFAF5(612360) 的相互作用伴侣,NDUFAF5(612360) 是一种推定的甲基转移酶,对于复合物 I 组装的早期阶段至关重要。NDUFAF8 包含双 Cx(9)C 结构域,表明它属于卷曲螺旋-卷曲螺旋-螺旋(CHCH) 结构域蛋白家族。

▼ 基因功能

在 HEK293 细胞中使用免疫沉淀分析,Floyd 等人(2016) 证实 NDUFAF8 与内源性 NDUFAF5 相互作用。HEK293 细胞中 NDUFAF8 的敲除降低了复合物 I 的活性并使 NDUFAF5 不稳定。对来自呼吸链功能障碍患者的 96 个细胞系的 RNA 测序分析显示,1 名复合物 I 缺陷患者的 NDUFAF8 减少了 80%(参见 MC1DN34;618776)。

▼ 基因结构

Alston 等人(2020) 指出 NDUFAF8 基因包含 3 个外显子,跨度约为 3 kb。

▼ Mapping

Gross(2019) 根据 NDUFAF8 序列(GenBank BC127837) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 NDUFAF8 基因对应到染色体 17q25.3。

▼ 分子遗传学

Alston 等人在 3 名患有与 Leigh 综合征相关的线粒体复合物 I 核型 34 缺陷(MC1DN34; 618776) 的无关男孩中(2020) 鉴定了 NDUFAF8 基因(618461.0001-618461.0004) 中的纯合或复合杂合突变。这些突变是通过靶向测序和全外显子组测序相结合发现的;没有关于家庭隔离的报道。患者 1 的骨骼肌和皮肤成纤维细胞的复合物 I 活性分别降低了对照的 33% 和 47%,并且完全组装的复合物 I 水平降低,氧化能力降低。患者成纤维细胞显示出异常剪接的证据,功能性同工型 2 转录物丢失,仅表达非功能性同工型 3 转录物。其他 OXPHOS 复合物不受影响,尽管相关亚基 NDUFAF5(612360) 有所减少。将野生型 NDUFAF8 引入患者细胞可以修复缺陷。

▼ 等位基因变异体(4 个选定示例):.

0001 线粒体复合物 I 缺陷,核型 34
NDUFAF8、IVS2、CT、+271
Alston 等人在 2 名患有线粒体复合物 I 缺陷核型 34(MC1DN34; 618776) 的无关患者(患者 1 和 2)中(2020) 鉴定了 NDUFAF8 基因中的复合杂合突变。两名患者在内含子 1 深处均携带 C 到 T 的转变(c.195+271C-T,NM_001086521.1);患者1在外显子1中还携带8-bp重复(c.45_52dup;618461.0002),预计会导致移码和提前终止(Phe18SerfsTer32),患者2还携带c.1A到G的转变(618461.0003),预计会破坏翻译起始密码子。这些突变是通过靶向测序和全外显子组测序相结合发现的;注意到了专性携带者,但没有报告家庭成员的序列分析。患者 1 的骨骼肌和皮肤成纤维细胞的复合物 I 活性分别降低了对照的 33% 和 47%,并且完全组装的复合物 I 水平降低,氧化能力降低。患者成纤维细胞显示出异常剪接的证据,功能性同工型 2 转录物丢失,仅表达非功能性同工型 3 转录物。其他 OXPHOS 复合物未受影响,但相关亚基 NDUFAF5(612360) 有所减少。将野生型 NDUFAF8 引入患者细胞可以修复缺陷。无法获得患者 2 的组织样本。功能性异构体 2 转录物丢失,仅表达非功能性异构体 3 转录物。其他 OXPHOS 复合物未受影响,但相关亚基 NDUFAF5(612360) 有所减少。将野生型 NDUFAF8 引入患者细胞可以修复缺陷。无法获得患者 2 的组织样本。功能性异构体 2 转录物丢失,仅表达非功能性异构体 3 转录物。其他 OXPHOS 复合物未受影响,但相关亚基 NDUFAF5(612360) 有所减少。将野生型 NDUFAF8 引入患者细胞可以修复缺陷。无法获得患者 2 的组织样本。

.0002 线粒体复合物 I 缺陷,核类型 34
NDUFAF8,8-BP DUP,NT45
为了讨论 NDUFAF8 基因外显子 1 中的 8-bp 重复(c.45_52dup,NM_001086521.1),预计会导致移码和过早终止(Phe18SerfsTer32), Alston 等人在患有线粒体复合物 I 缺陷核型 34(MC1DN34; 618776) 的患者中发现复合杂合状态(2020),参见 618461.0001。

.0003 线粒体复合物 I 缺陷,核型 34
NDUFAF8,NT1A-G
用于讨论 NDUFAF8 基因外显子 1 中的 c.1A-G 转变(c.1A-G,NM_001086521.1),预计会破坏翻译起始密码子,该密码子在线粒体复合物 I 缺陷核型 34 患者的复合杂合状态下发现(MC1DN34;618776),作者:Alston 等人(2020),参见 618461.0001。

.0004 线粒体复合物 I 缺陷,核型 34
NDUFAF8,PHE55LEU
一名 18 个月大的德国男孩(患者 3),其父母无关,患有致命性线粒体复合物 I 缺陷,核型 34(MC1DN34; 618776),Alston 等人(2020) 在 NDUFAF8 基因的外显子 2 中鉴定出纯合 c.165C-G 颠换(c.165C-G,NM_001086521.1),导致高度保守残基处的 phe55 至 leu(F55L) 取代。该突变是通过全外显子组测序发现的,但在 gnomAD 数据库中并未发现。尽管患者的骨骼肌活检显示存在孤立的复合物 I 缺陷,约为正常活动的 3%,但尚未对该变体进行家族分离研究和功能研究。