锚蛋白重复序列和包含无菌α基序结构域的蛋白质 4B; ANKS4B
- 和谐蛋白相互作用、含有锚蛋白重复的蛋白质; HARP
- FLJ38819
HGNC 批准的基因符号:ANKS4B
细胞遗传学定位:16p12.2 基因组坐标(GRCh38):16:21,233,699-21,253,850(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
通过酵母 2-杂交分析和哺乳动物过度表达研究,Johnston 等人(2004) 鉴定了一种新的小鼠蛋白,他们将其命名为 Harp,其前 3 个 C 端氨基酸与 Harmonin 的第一个 PDZ 结构域相互作用(USH1C; 605242)。 通过数据库序列分析,他们鉴定出了含有人类 HARP 的 BAC 克隆。 推导的 417 个氨基酸的 HARP 蛋白包含 3 个锚蛋白重复序列和一个不育 α 基序(SAM)。 它与小鼠同源物和人 USH1G 蛋白(607696) 分别具有 81% 和 40% 的整体氨基酸序列同一性。 小鼠组织的 Northern 印迹分析检测到 3 种不同的 Harp 转录本,主要在肝脏和肾脏中表达; RT-PCR检测肝、肾、小肠、结肠、胰腺和纯化的胰腺细胞中的表达。 免疫组织化学将小鼠竖琴定位于发育中的肺、肾、唾液腺和耳蜗的上皮细胞。
▼ 基因功能
约翰斯顿等人使用共焦显微镜(2004) 将小鼠竖琴和 Harmonin 共定位于胰腺导管上皮细胞和胰腺 β 细胞系中。 约翰斯顿等人(2004) 表明 HARP 在促进上皮信号转导中发挥作用。
▼ 基因结构
约翰斯顿等人(2004) 确定 HARP 基因包含 2 个外显子。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,约翰斯顿等人(2004) 将 HARP 基因定位到染色体 16p,位于 D16S3045 和 D16S3201 之间; 通过辐射杂交分析,他们将小鼠同源物定位到 7 号染色体上的同线性同源区域。