具有 Ig 样结构域的粘附分子 3; AMIGO3

  • 两性蛋白诱导基因和开放解读码组 3; AMIGO3
  • ALIVIN 3; ALI3

HGNC 批准的基因符号:AMIGO3

细胞遗传学位置:3p21.31 基因组坐标(GRCh38):3:49,716,829-49,719,684(来自 NCBI)

▼ 说明

AMIGO3 属于相互相互作用的细胞表面跨膜蛋白家族。 这些蛋白质预计在细胞粘附中发挥作用(Kuja-Panula 等,2003)。

▼ 克隆与表达

通过在数据库中搜索与大鼠 Ali1(AMIGO2; 615690) 相似的序列,Ono 等人(2003) 鉴定出人类 AMIGO3,他们将其称为 ALI3。 推导的蛋白质包含一个 N 端信号序列,随后是一个富含半胱氨酸的结构域、7 个富含亮氨酸的重复序列(LRR)、第二个富含半胱氨酸的结构域、一个免疫球蛋白 C2 样环、一个跨膜区和一个 C 端胞内结构域。 人 ALI3 与人 ALI1 和 ALI2(AMIGO1;615689) 分别具有 32% 和 34% 的氨基酸同一性。

Kuja-Panula 等人通过在 EST 数据库中搜索与 AMIGO(AMIGO1; 615689) 相似的序列,然后搜索 HEK293 细胞的 5-prime RACE(2003) 克隆 AMIGO3。 推导的蛋白质含有504个氨基酸。 库贾-帕努拉等人(2003)报道AMIGO蛋白含有6个LRR。 AMIGO 蛋白家族与细胞外轴突引导蛋白 SLIT 家族(参见 603742)和 NOGO66 受体(RTN4R;605566)具有最高的相似性。 对 12 只小鼠组织的 RT-PCR 分析显示 Amigo3 普遍表达。

Nagase 等人通过对从按大小分级的成人脑 cDNA 文库获得的克隆进行测序,(2001) 获得了一个克隆,他们将其命名为 KIAA1851,其中包含 2 个相距 2.4 kb 的编码区。 他们将上游编码区鉴定为 GMPPB(615320),并表明 KIAA1851 可能代表 GMPPB 基因的通读转录本。 Hartz(2014)确定KIAA1851序列(GenBank AB058754)除了GMPPB序列之外还包括AMIGO3(GenBank AY237003)序列。

▼ 测绘

Hartz(2014) 根据 AMIGO3 序列(GenBank AY237003) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 AMIGO3 基因对应到染色体 3p21.31。