KIAA0825 基因; KIAA0825

HGNC 批准基因符号:KIAA0825

细胞遗传学位置:5q15 基因组坐标(GRCh38):5:94,150,851-94,618,604(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Nagase 等人通过对从大小分级的人脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(1998)克隆了KIAA0825。 转录本的 3 引物末端有重复元件,推导的蛋白质有 553 个氨基酸。 RT-PCR ELISA 检测到卵巢和大脑中 KIAA0825 表达较低,而在其他检查组织中几乎没有表达。 在特定的成人大脑区域内,仅在小脑和丘脑底核中检测到 KIAA0825 表达。

乌拉等人(2019) 指出,RNA-seq 数据显示,KIAA0825 最接近的小鼠直系同源物 221048IRik 在胚胎(E) 11.5 至 E15.5 的发育中小鼠肢体中表达。

▼ 测绘

通过辐射杂交分析,Nagase 等人(1998) 将 KIAA0825 基因定位到 5 号染色体。

希利特等人(2016) 通过基因组序列分析将 KIAA0825 基因定位到染色体 5q15。

▼ 分子遗传学

在来自 2 个不相关的近亲巴基斯坦家庭的受累个体中,患有非综合征性轴后多指 A 型(PAPA10;618498),Ullah 等人(2019) 鉴定了 KIAA0825 基因中与疾病分离的截短突变的纯合性:分别是 1 bp 重复(c.591dupA; 617266.0001) 和无义突变(K725X; 617266.0002)。

Hayat 等人的 2 名 PAPA10 兄弟是巴基斯坦血统的近亲父母所生(2020) 在 KIAA0825 基因(L17S; 617266.0003) 中发现了纯合错义突变。 通过连锁分析和桑格测序发现的突变在未受影响的父母中以杂合状态存在。 该变体在包括 gnomAD 在内的多个公共数据库中并不以纯合状态存在。

▼ 等位基因变异体(3 个选定示例):

.0001 多趾,后轴,A10 型
KIAA0825,1-BP DUP,591A
Ullah 等人在患有 A 型轴后多指畸形(PAPA10; 618498) 的 2 个兄弟(BD204 家族)中(2019) 鉴定了 KIAA0825 基因中 1 bp 重复(c.591dupA, NM_001145678.1) 的纯合性,导致预计会导致提前终止密码子(Gln198ThrfsTer21) 的移码。 他们未受影响的母亲的突变是杂合的,在gnomAD数据库中没有发现这种突变; 无法从他们已故的父亲身上获取 DNA。

.0002 多趾,后轴,A10 型
KIAA0825、LYS725TER
Ullah 等人在 2 名兄弟及其舅舅(PD-23 家族)中发现了 A 型轴后多指畸形(PAPA10;618498)(2019) 鉴定了 KIAA0825 基因中 c.2173A-T 颠换(c.2173A-T, NM_001145678.1) 的纯合性,导致 lys725 至 ter(K725X) 取代。 该突变与家族中的疾病完全分离,并且在 gnomAD 数据库中发现频率较低(1 个杂合等位基因;次要等位基因频率,6.75 x 10(-6))。 据报道,兄弟俩已故的外祖父也受到了影响,但没有可用于分析的 DNA。

.0003 多趾,后轴,A10 型
KIAA0825,LEU17SER

Hayat 等人的 2 名兄弟患有 A10 型轴后多指畸形(PAPA10;618498),他们的父母都是巴基斯坦血统的近亲(2020) 在 KIAA0825 基因的外显子 3 中鉴定出纯合 c.50T-C 转换(c.50T-C,NM_001145678.2),导致高度保守残基处的 leu17 到 Ser(L17S)取代。 通过连锁分析和桑格测序发现的突变在未受影响的父母中以杂合状态存在。 该变体在包括 gnomAD 在内的多个公共数据库中并不以纯合状态存在。