脯氨酰3-羟化酶3; P3H3
- LEPRECAN-LIKE 2; LEPREL2
HGNC 批准的基因符号:P3H3
细胞遗传学位置:12p13.31 基因组坐标(GRCh38):12:6,828,407-6,839,847(来自 NCBI)
▼ 说明
LEPREL2 属于胶原蛋白脯氨酰羟化酶家族,是胶原蛋白正确生物合成、折叠和组装所需的(Vranka 等,2004)。
▼ 克隆与表达
Ansari-Lari 等人对 12 号染色体上富含基因的簇进行测序,然后进行 EST 数据库分析和 RT-PCR(1996) 克隆了 LEPREL2,他们将其命名为基因 B。Northern 印迹分析检测到 2.1-和 3.4-kb 转录物的组织特异性表达。
通过在数据库中搜索与鸡 P3h1(LEPRE1; 610339) 相似的序列,Vranka 等人(2004) 鉴定了 3 个相关的人类 P3H 基因,包括 LEPREL2,他们将其命名为 P3H3。 推导的蛋白质含有736个氨基酸。 所有 P3H 蛋白都具有高度保守的 C 端结构域,其中包含赖氨酰和脯氨酰 4-羟化酶中发现的关键催化残基,包括 2 个铁结合组氨酸和一个天冬氨酸,以及 C 端粗面内质网保留基序(KDEL)。 在其更加不同的 N 端半部分中,所有 P3H 蛋白都包含 4 个 CxxxC 重复序列。
▼ 基因结构
安萨里-拉里等人(1996) 确定 LEPREL2 基因包含 14 个外显子。 内含子 5 包含 2 个 Alu 重复序列,内含子 8 包含 3 个(2004)报道LEPREL2基因包含15个外显子。
▼ 测绘
通过序列分析,Ansari-Lari 等人(1996) 将 LEPREL2 基因定位到染色体 12p13。
▼ 动物模型
Hudson 等人使用同源重组技术(2017) 创建了 P3h3 或 Sc65 无效的突变小鼠品系(P3H4; 617419)。 P3h3 -/- 和 Sc65 -/- 小鼠在总体外观上与野生型同窝小鼠没有区别,但与野生型相比,这两种品系的突变体皮肤缺乏结构完整性并且脆弱。 对来自 Sc65 -/- 和 P3h3 -/- 组织的 I 型胶原蛋白(参见 COL1A1, 120150)的质谱分析显示,皮肤、骨、肌腱、角膜和主动脉中三螺旋结构域交联位点的赖氨酸残基存在严重的羟基化不足。 哈德森等人(2017) 观察到 P3h3 -/- 和 Sc65 -/- 小鼠中胶原蛋白赖氨酸羟基化和交联的缺陷与在 VI 型 Ehlers-Danlos 综合征患者组织中观察到的缺陷相似,这是由 PLOD1 基因突变引起的(153454)。 作者提出,P3H3 和 SC65 在与 PLOD1 的蛋白质复合物中发挥作用,催化内质网中胶原蛋白的赖氨酸羟基化。