NLR 家族,含有 PYRIN 结构域 6; NLRP6
- NACHT 结构域、富含亮氨酸重复序列和含有 PYD 的蛋白质 6;NALP6
- PYRIN 结构域含有 APAF1 样蛋白 5;PYPAF5
HGNC 批准的基因符号:NLRP6
细胞遗传学位置:11p15.5 基因组坐标(GRCh38):11:278,407-285,388(来自 NCBI)
▼ 描述
NALP 是细胞质蛋白,形成较大的 CATERPILLER 蛋白家族中的一个亚家族。大多数短 NALP,例如 NALP6,具有 N 端吡啶(MEFV;608107) 结构域(PYD),随后是 NACHT 结构域、NACHT 相关结构域(NAD) 和 C 端富含亮氨酸重复序列(LRR) 区域。长 NALP NALP1(606636) 还具有 C 末端延伸,其中包含寻找结构域(FIIND) 和半胱天冬酶募集结构域(CARD) 的功能。NALP 通过参与称为炎症小体的多蛋白复合物而参与促炎性半胱天冬酶(例如 CASP1;147678)的激活(Tschopp 等人,2003)。
▼ 克隆和表达
Grenier 等人(2002) 指出预测的 892 个氨基酸的 NALP6 蛋白(他们称之为 PYPAF5)具有 N 端 PYD、中央 NACHT 型核苷酸结合位点结构域和包含至少 4 个 LRR 基序的 C 端结构域。外周血白细胞的实时 PCR 分析检测到 PYPAF5 主要在粒细胞中表达,也有一些 T 细胞表达。Northern印迹分析显示在其他组织和所检测的细胞系中几乎没有表达。
▼ 测绘
Tschopp 等人的地图(2003)报道NALP6基因定位于染色体11p15.5。
▼ 基因功能
Grenier 等人(2002) 指出 PYPAF1(CIAS1; 606416) 和 PYPAF7(NALP12; 609648) 与 ASC(PYCARD; 606838) 组装,通过 ASC C 端 CARD 结构域的介导来招募和激活 NFKB(参见 164011)和 pro半胱天冬酶-1。Grenier 等人使用免疫组织化学分析(2002)发现PYPAF5与ASC相关,而缺乏PYD的PYPAF2(NALP2; 609364)、PYPAF3、PYPAF4(NALP4; 609645)、PYPAF6和PYPAF5则不然。免疫印迹和荧光素酶报告基因分析表明,PYPAF5 和 ASC 协同参与 NFKB 和 pro半胱天冬酶-1 的激活。格雷尼尔等人(2002) 得出结论,PYPAF5 属于调节 NFκB 和细胞因子产生的 NALP 蛋白亚组。
Wang 等人使用小鼠和人类细胞(2015) 表明,NLRP6 通过 RNA 解旋酶 DHX15(603403) 结合病毒 RNA,并与线粒体抗病毒信号蛋白(MAVS;609676) 相互作用,诱导 I 型(例如 IFNB1;147640)和 III 型(例如 IFNL2;607401)干扰素和干扰素刺激基因(例如 ISG15;147571) 。基于对小鼠的其他研究(参见动物模型),Wang 等人(2015) 得出结论,NLRP6 与 DHX15 一起作为病毒 RNA 传感器来诱导 ISG。
▼ 动物模型
Elinav 等人使用结肠上皮细胞中缺乏 Asc 的小鼠或缺乏 Nlrp6 的小鼠(2011) 观察到 Il18(600953) 水平下降,并随着拟杆菌门的扩张而改变胎儿微生物群。突变小鼠的特征是自发性肠增生、炎症细胞募集以及右旋糖酐硫酸钠(DSS)诱导的化学性结肠炎恶化。当与突变小鼠共养时,改变的微生物群的致结肠炎活性可转移至成年或新生野生型小鼠。DSS 结肠炎的恶化是由 Ccl5(187011) 引起的。抗菌而非抗病毒、抗真菌或抗蠕虫治疗可将 Asc -/- 和 Nlrp6 -/- 小鼠的 DSS 结肠炎严重程度降低至野生型水平,并降低结肠炎向野生型小鼠的转移性和严重程度。埃利纳夫等人。
阿南德等人(2012) 证明 Nlrp6 缺陷小鼠对细菌病原体单核细胞增多性李斯特菌、鼠伤寒沙门氏菌和大肠杆菌的感染具有高度抵抗力。感染 Nlrp6 缺陷的小鼠循环中的单核细胞和中性粒细胞数量增加,造血细胞和抗辐射细胞中的 NLRP6 信号传导导致易感性增加。在体外,Nlrp6 缺陷增强了 Toll 样受体(见 601194)连接后丝裂原激活蛋白激酶(MAPK;见 601335)和经典 NF-kappa-B 通路的激活,但不增强胞质 NOD1/2(605980, 605956) 连接。因此,受感染的 Nlrp6 缺陷细胞产生的 NF-κ-B 和 MAPK 依赖性细胞因子和趋化因子水平升高。阿南德等人。
沃达斯卡等人(2014) 发现缺乏 Nlrp6 的小鼠以及缺乏 Asc 或 Casp1(Nlrp6 炎症小体信号通路的关键组成部分)的小鼠无法清除结肠中的啮齿类柠檬酸杆菌(附着/消除病原体)。缺乏 Asc、Casp1 或 Nlrp6 的小鼠缺乏厚厚的连续覆盖的内粘液层,并表现出明显的杯状细胞增生。细菌在突变小鼠中也更具侵袭性,可深入隐窝,并且更频繁地与杯状细胞相关。Nlrp6 炎性体缺陷小鼠的杯状细胞缺陷与 Il1(147720) 和 Il18 机制无关。免疫印迹分析、免疫荧光分析和电子显微镜表明,Nlrp6 炎性体对于肠上皮细胞的自噬至关重要。沃达斯卡等人。
王等人(2015) 用脑心肌炎病毒(EMCV) 攻击 Nlrp6 -/- 小鼠,观察到与对照小鼠相似的存活率。然而,Nlrp6 -/- 小鼠的胃肠道表现出病毒载量增加。EMCV 或诺如病毒的口腔感染导致 Nlrp6 -/- 小鼠死亡率和病毒血症增加。王等人(2015) 得出结论,NLRP6 作为病毒 RNA 传感器诱导 ISG 的能力在肠道中尤其重要。