含有三联基序的蛋白质 39; TRIM39

睾丸丰富的手指蛋白； TFP
TRIM39、B30.2 包含域； TRIM39B
环指蛋白 23，以前； RNF23，以前

此条目中代表的其他实体：

TRIM39/RPP21 拼接通读转录，包括在内
TRIM39、RPP21 包含域；包含； TRIM39R，包括

HGNC 批准的基因符号：TRIM39

细胞遗传学定位：6p22.1 基因组坐标（GRCh38）：6:30,326,469-30,343,729（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

RING指蛋白在分化、发育、肿瘤发生和细胞凋亡中发挥着至关重要的作用。尽管环指结构域参与蛋白质-蛋白质相互作用并且通常结合锌，但它们在序列和结构方面与锌指结构域不同。 Orimo 等人使用带有简并引物的 PCR 来生成新型环指蛋白探针，然后筛选睾丸 cDNA 文库（2000）分离出编码 RNF23 的 cDNA，他们将其命名为 TFP。推导的 519 个氨基酸的蛋白质与 489 个氨基酸的小鼠序列有 98% 的同一性，包含一个环指 B 框卷曲螺旋（RBCC）结构域和一个 C 端 B30.2 结构域。 Northern 印迹分析显示 3.4 kb 转录物几乎无处不在的表达，其中在睾丸中表达最强。

Roberts 等人通过筛选人脾 cDNA 文库（2007）克隆了全长 TRIM39 以及缺少外显子 7 的剪接变体。他们将这些转录本称为 TRIM39B，因为它们编码具有完整 C 端 B30.2 结构域的蛋白质，以将它们与 TRIM39/RPP21 通读转录本（指定为 TRIM39R）区分开来，TRIM39R 编码具有不完整 B30.2 结构域和 C 端 RPP21 结构域的蛋白质（有关通读转录本的更多信息，请参见下文。）使用检测 TRIM39B 和 TRIM39R 的探针进行的 Northern 印迹分析显示，在许多人体组织中都有表达，其中在睾丸和脾脏中表达水平最高。免疫组织化学分析显示，2 种人类细胞系中存在细小和粗大的核内斑点中的 TRIM39B/TRIM39R。有丝分裂细胞中未检测到 TRIM39 表达。

TRIM39/RPP21 拼接通读转录本

Roberts 等人使用 PKGI（PRKG1; 176894）的催化区域作为肺 cDNA 文库的酵母 2-杂交筛选中的诱饵，然后使用 5-prime RACE（2007）获得了一个剪接的通读转录本，其中包含 TRIM39 的几个外显子，这些外显子与下游 RPP21 基因的外显子剪接（612524）。该转录本被作者称为 TRIM39R，缺乏全长 TRIM39 的外显子 7，并且在 TRIM39 外显子 10 中具有独特的剪接位点，该剪接位点与 RPP21 的外显子 2 至 5 融合。推导的蛋白质包含 TRIM39 的 N 端 RING 指、B 框和 RBBC 结构域，但它具有与 RPP21 的 135 个 C 端氨基酸融合的不完整 TRIM39 B30.2 结构域。使用检测 TRIM39B 和 TRIM39R 的探针进行的 Northern 印迹分析显示，在许多人体组织中都有表达，其中在睾丸和脾脏中表达水平最高。使用 TRIM39R 特异性引物的 RT-PCR 检测人胎肺和大鼠肺平滑肌细胞 RNA 中的转录本。免疫组织化学分析显示，2 种人类细胞系中存在细小和粗大的核内斑点中的 TRIM39B/TRIM39R。有丝分裂细胞中未检测到 TRIM39 表达。

▼ 基因功能

罗伯茨等人（2007）表明 TRIM39B 和 TRIM39R 被 cGMP 刺激的重组 PKGI 磷酸化。

使用酵母 2-杂交以及体内和体外结合测定，Suzuki 等人（2016）发现人类 TRIM39 直接结合 CACTIN（618536），且 TRIM39 的 B框结构域是相互作用所需的。 HEK293T 细胞的分级分析表明 TRIM39 定位于细胞核，而 CACTIN 定位于细胞核和细胞质。 TRIM39 与细胞核中的 CACTIN 相互作用，并以不依赖泛素化的方式稳定它。 TRIM39 过表达显着抑制 NFKB（参见 164011）信号传导，而 TRIM39 敲低则促进该信号传导，表明 TRIM39 可能通过稳定 CACTIN 负向调节 NFKB 信号传导途径。 TRIM39 抑制 NFKB 信号通路会负向调节 NFKB 介导的转录活性，导致 NFKB 靶基因下调。

▼ 基因结构

Orimo 等人通过基因组序列分析（2000）确定RNF23基因至少含有8个外显子。罗伯茨等人（2007）表明TRIM39基因包含10个外显子。

▼ 测绘

使用 FISH，Orimo 等人（2000）将 RNF23 基因对应到 6p22.1-p21.3，表明至少 5 个 RBCC-B30.2 基因聚集在 I 类主要组织相容性（MHC）复合体区域内。