序列相似度8的家族,成员A1; FAM8A1

HGNC 批准的基因符号:FAM8A1

细胞遗传学定位:6p22.3 基因组坐标(GRCh38):6:17,600,302-17,611,715(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Jamain 等人通过 RACE-PCR 检测人类睾丸 RNA(2001)克隆了全长FAM8A1。 推导的蛋白质含有413个氨基酸,计算分子量为44 kD。 FAM8A1 存在于所有动物中,但不存在于植物或单细胞生物中。 人和小鼠 FAM8A1 包含一个不太保守的富含脯氨酸的 N 端结构域和一个高度保守的 C 端结构域,具有 4 个假定的内膜结构域。 Northern 印迹分析在所有检查的人体组织中检测到 5.5 kb 转录物,睾丸中也存在 1.6 kb 转录物。 在小鼠组织中观察到类似的表达模式。 序列分析表明,小鼠和人类中较小的 FAM8A1 转录物是由选择性多聚腺苷酸化造成的。 小鼠睾丸原位杂交显示圆形精子细胞中 Fam8a1 强表达。 作者确定至少有 5 个 FAM8A1 假基因,其中 1 个(FAM8A4P) 是人类和黑猩猩中雄性特有的。 每个 FAM8A1 假基因均插入人内源性逆转录病毒序列中,两侧有 2 个长末端重复序列。 所有FAM8A1假基因都缺乏完整的ORF,RT-PCR分析表明它们没有被转录。

▼ 基因结构

贾曼等人(2001) 确定 FAM8A1 基因跨度约为 12 kb,包含 5 个外显子。

▼ 测绘

通过辐射混合分析,Jamain 等人(2001) 将 FAM8A1 基因定位到染色体 6p23。 FAM8A1 假基因对应到染色体 2(FAM8A3P)、6p21(FAM8A5P)、6q23(FAM8A6P)、11(FAM8A2P) 和 Y(FAM8A4P)。 贾曼等人(2001) 将小鼠 Fam8a1 基因定位到 13 号染色体。

▼ 进化

通过系统发育和进化分析,Jamain 等人(2001) 确定 FAM8A1 假基因的遗传是由于大约 4486 万年前灵长类动物进化过程中逆转录病毒捕获 FAM8A1 以及随后的多次逆转录转座所致。