TAPERIN; TPRN
- 9 号染色体开放解读码组 75;C9ORF75
HGNC 批准的基因符号:TPRN
细胞遗传学定位:9q34.3 基因组坐标(GRCh38):9:137,191,619-137,200,741(来自 NCBI)
▼ 克隆和表达
Rehman 等人使用靶向基因组捕获和序列分析(2010) 确定 TPRN 是 DFNB79(613307) 中突变的基因,DFNB79 是一种与染色体 9q34.3 相关的常染色体隐性遗传非综合征性耳聋。全长 TPRN 编码推导的 711 个氨基酸的蛋白质。RT-PCR 检测到所有检查的小鼠组织中 Tprn 的表达。免疫组织化学分析在小鼠 Corti 器官和前庭终末器官的感觉上皮细胞中检测到 Tprn,在赖斯纳膜和螺旋韧带中也检测到了较小程度的 Tprn。在柯蒂氏器中,Tprn 定位于支持细胞和内耳毛细胞静纤毛内,并定位于每个静纤毛的锥形区域。
李等人孤立地(2010) 确定 TPRN 是 DFNB79 中突变的基因。RT-PCR 检测到人胎儿耳蜗和所有检查的小鼠组织中 TPRN 的表达。李等人(2010) 鉴定了 TPRN 3-prime 剪接变体。
▼ 基因结构
Rehman 等人(2010)和李等人(2010) 确定 TPRN 基因包含 4 个编码外显子。
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通过基因组序列分析进行绘图,Rehman 等人(2010)和李等人(2010) 将 TPRN 基因定位到染色体 9q34.3。雷曼等人(2010) 将小鼠 Tprn 基因定位到染色体 2A3 的一个区域,该区域与人类染色体 9q34.3 具有同源性。
▼ 分子遗传学
在 4 个巴基斯坦近亲家庭的 DFNB79 受影响成员中,包括 Khan 等人之前报道的 3 个家庭(2010),雷曼等人(2010) 在 TPRN 基因(613354.0001-613354.0004) 中鉴定出 4 个不同的纯合截短突变。
李等人(2010) 还在一个患有 DFNB79 的摩洛哥近亲大家庭和荷兰家庭的受影响成员中发现了 TPRN 基因(613354.0004 和 613354.0005)的纯合功能丧失突变。
▼ 等位基因变异(5 个选定示例):
.0001 耳聋,常染色体隐性遗传 79
TPRN、TRP352TER
在患有常染色体隐性遗传非综合征性耳聋 79(DFNB79; 613307) 的巴基斯坦近亲家庭的受影响成员中,Rehman 等人(2010) 鉴定了 TPRN 基因外显子 1 中的纯合 1056G-A 转换,导致 trp352 至 ter(W352X) 取代。预计该突变会导致蛋白质截短,并使转录物容易受到无义介导的 mRNA 衰减的影响。在 500 条巴基斯坦对照染色体中未发现该突变。
.0002 耳聋,常染色体隐性遗传 79
TPRN,1-BP DEL,1244C
在患有 DFNB79(613307) 的巴基斯坦近亲家庭的受影响成员中,Rehman 等人(2010) 在 TPRN 基因的外显子 1 中发现了纯合 1-bp 缺失(1244delC),导致移码和过早终止。在 500 条巴基斯坦对照染色体中未发现该突变。
.0003 耳聋,常染色体隐性遗传 79
TPRN,11-BP DUP,NT44
在患有 DFNB79(613307) 的巴基斯坦近亲家庭受影响成员中,Rehman 等人(2010) 在 TPRN 基因的外显子 1 中发现了纯合的 11 bp 重复,导致移码和提前终止。该缺失发生在富含 GC 的重复区域,已知该区域在交叉形成过程中容易出现结构畸变,可能与开放染色质结构有关(Li et al., 2010)。488 条巴基斯坦对照染色体中未发现该突变。
.0004 耳聋,常染色体隐性遗传 79
TPRN,11-BP DEL,NT42
在患有 DFNB79(613307) 的巴基斯坦近亲家庭受影响成员中,Rehman 等人(2010) 在 TPRN 基因的外显子 1 中发现了一个纯合的 11-bp 缺失,导致移码和提前终止。488 条巴基斯坦对照染色体中未发现该突变。
李等人(2010) 在一个与 DFNB79 无关的摩洛哥近亲家族的受影响成员中发现了相同的纯合 11-bp 缺失。该缺失发生在富含 GC 的重复区域,已知该区域在交叉形成过程中容易出现结构畸变,可能与开放染色质结构有关。在 140 名摩洛哥对照个体中未发现该突变。
.0005 耳聋,常染色体隐性 79
TPRN,1-BP DEL,1347G
在 2 名患有非综合征 DFNB79(613307) 的荷兰同胞中,Li 等人(2010) 在 TPRN 基因的外显子 1 中发现了一个纯合 1-bp 缺失(1347delG),预计会导致移码和过早终止。在 160 名荷兰对照者中未发现该突变。听力损失是进行性的,到成年后变得严重。