补充素A; RFLNA
- 序列相似度101的家庭,成员A;FAM101A
- CFM2
HGNC 批准的基因符号:RFLNA
细胞遗传学位置:12q24.31 基因组坐标(GRCh38):12:124,289,164-124,316,024(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Mizuhashi 等人(2014) 克隆了小鼠 Fam101a,他们将其称为 Cfm2。推导的 204 个氨基酸蛋白与 Cfm1(FAM101B;615928) 共享 2 个保守结构域。定量PCR分析检测到Cfm2在所有检查的10个小鼠组织中表达,其中在肺中表达最高,其次是脾脏和卵巢。发育小鼠的原位杂交检测到软骨和椎间盘中 Cfm1 和 Cfm2 的表达。数据库分析在人类、鸡、爪蟾和斑马鱼中检测到 Cfm1 和 Cfm2 的直系同源物。
▼ Mapping
Hartz(2014) 根据 FAM101A 序列(GenBank AK074545) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 FAM101A 基因对应到染色体 12q24.31。
▼ 基因功能
通过微阵列筛选,Mizuhashi 等人(2014) 发现 ATDC5 小鼠软骨细胞分化过程中 Cfm2 的表达上调。Cfm1 和 Cfm2 均与细丝蛋白 A(FLNA; 300017) 沿着 ATDC5 细胞中的肌节蛋白束状结构共定位。免疫沉淀分析检测到 Cfm1 或 Cfm2 与 Flna 或 Flnb 之间的相互作用(603381)。
▼ 分子遗传学
有关脊椎腕跗骨融合综合征(SCT;参见 272460)与 RFLNA 基因变异之间可能关联的讨论,请参见 615927.0001。
▼ 动物模型
Mizuhashi 等人(2014) 发现 Cfm2 -/- 小鼠表现正常。Cfm2 和 Cfm1 双敲除(DKO) 小鼠表现出严重的脊柱骨骼畸形,包括脊柱弯曲、椎体融合和骨骼生长受损。所有其他器官系统均表现正常。DKO 软骨显示加速成熟、减少增殖和增加细胞凋亡。来自 DKO 小鼠的原代肋骨软骨细胞表现出比野生型软骨细胞更少的肌节蛋白束。DKO 软骨细胞还含有比野生型更少的 Flnb-Smad3(603109) 复合物。
▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):
.0001 意义不明的变异体
RFLNA、1-BP DEL、241C
该变异体被归类为意义不明的变异体,因为其对脊椎骨跗骨骨联结综合征(SCT; 272460) 的贡献尚未得到证实。
Shimizu 等人在一名 2 岁的日本男孩中发现了脊柱腕跗骨连接综合征(2019) 鉴定出 RFLNA 基因外显子 3 中 1 bp 缺失(c.241delC, NM_181709) 的纯合性,导致移码,预计会导致提前终止密码子(Leu81CysfsTer111)。他未受影响的父母是该变异的杂合子,在 1000 个基因组计划、ExAC 或综合日本基因组变异(3.5KJPN) 数据库中未发现该变异。此外,先证者及其未受影响的母亲在 FLNB 基因(603381) 中鉴定出 I1606M 错义变异(rs774972522) 的杂合性。该变体存在于 3.5KJPN 数据库中,次要等位基因频率为 0.0027。先证者表现出 FLNB 的双等位基因表达,没有异常剪接变异或外显子缺失,作者认为 I1606M 变体不太可能在 SCT 的发展中发挥病理作用。先证者因严重身材矮小(-3.7 SD) 于 1 岁时首次就诊。他表现出轻度畸形的面部特征,额部隆起,鼻孔前倾。骨骼检查显示脊柱融合主要涉及后神经弓,较小程度涉及椎体,伴有轻度脊柱侧凸和腕跗骨连接(头状骨和钩骨的融合,以及可能的骰骨和外侧楔骨的融合)。当他 2 岁时,他的身材已经变得矮小(-4.3 SD)。运动和智力发育正常。