生长/分化因子 3; GDF3
HGNC 批准的基因符号:GDF3
细胞遗传学位置:12p13.31 基因组坐标(GRCh38):12:7,689,784-7,695,775(来自 NCBI)
▼ 说明
GDF3 是骨形态发生蛋白(BMP) 家族的成员。有关 BMP 的背景信息,请参阅 GDF2(605120) 以及 Ducy 和 Karsenty(2000)。
▼ 克隆与表达
Caricasole 等人通过 PCR 对视黄酸(RA) 和/或激活素 A 处理的胚胎癌(EC) 细胞和未处理细胞的 cDNA 进行差异筛选,然后进行 5-prime 和 3-prime RACE(1998)分离出编码GDF3的cDNA。序列分析预测该313个氨基酸的蛋白质与成熟小鼠蛋白质高度保守。GDF3 含有信号肽,但缺乏被认为对小鼠蛋白二聚化至关重要的半胱氨酸。Southern印迹分析证实了与小鼠基因的同源性。Northern 印迹和 RNase 保护分析揭示了各种 EC 系中 1.1-kb 转录物的丰富表达,并受到 RA 处理的差异调节。在多种胎儿和成人组织以及 K562 细胞中表达较弱或检测不到。卡里卡索等人。
Clark 等人通过胎儿组织的 RT-PCR 进行了研究(2004) 检测到 GDF3 在卵巢中高表达,而在肾、肺、骨骼肌和胸腺中表达较低。GDF3 也在成人睾丸和卵巢中表达,但在患有纯支持细胞综合征的男性睾丸中不表达(参见 400042)。实时 PCR 检测到精原细胞瘤中 GDF3 的表达量远高于正常睾丸。GDF3由未分化培养的人胚胎干细胞表达,并且表达随着分化的进行而降低。
▼ 基因结构
叶等人(2010) 指出 GDF3 基因包含 2 个外显子。
▼ 测绘
通过辐射混合分析,Caricasole 等人(1998) 将 GDF3 基因定位到染色体 12p13.1。
▼ 分子遗传学
叶等人(2010) 在眼部异常(MCOPCB6, 613703; MCOP7, 613704) 和/或骨骼异常(Klippel-Feil 综合征-3; 613702) 患者中鉴定出 GDF3 基因杂合错义突变(606522.0001-606522.0004),其中包括 1 名 GDF 杂合突变个体3 和 GDF6(601147)。作者认为,BMP 变体的多等位遗传可能在其他发育障碍中发挥作用。
▼ 动物模型
安德森等人(2008) 指出,三分之一的 Gdf3 -/- 小鼠胚胎因原肠胚形成前畸形而死亡,但那些存活到成年的胚胎没有表现出明显的异常。安德森等人(2008) 发现 Gdf3 -/- 小鼠比野生型小鼠积累的脂肪组织更少,并且尽管食物摄入量相似,但对高脂肪饮食引起的肥胖表现出部分抵抗力。Gdf3 信号传导涉及 Alk7(ACVR1C; 608981) 和辅助受体 Cripto(TDGF1; 187395),两者均在脂肪组织中表达。与 Alk7 在 Gdf3 信号传导中的作用一致,Alk7 -/- 小鼠还表现出脂肪积累减少和对饮食引起的肥胖的部分抵抗力。安德森等人(2008) 得出的结论是,GDF3 在营养过剩的情况下部分地通过 ALK7 信号传导来调节脂肪组织稳态和能量平衡。
Ye 等人通过吗啡啉敲低 dvr1(GDF3/GDF1(602880) 斑马鱼同源物)(2010) 概括了在人类中看到的眼睛和骨骼表型。斑马鱼受精后 48 小时的明显眼部特征包括缺损和眼部尺寸缩小。组织学检查显示眼睛、晶状体和视网膜尺寸一致减小,这与活胚胎早期阶段观察到的小眼球一致。骨骼缺陷范围从轻度到重度尾部弯曲和尾部长度缩短。
▼ 等位基因变异体(4 个选定示例):
.0001 KLIPPEL-FEIL 综合征 3,常染色体显性小眼
症,孤立,伴有 COLOBOMA 6,包括
GDF3、ARG266CYS
在一个患有 Klippel-Feil 综合征(KFS3; 613702) 以及先证者单侧虹膜和视网膜缺损的 3 代北美家庭中,Ye 等人(2010) 在 GDF3 基因中发现了一个杂合的 796C-T 转变,导致高度保守残基处的 arg266 到 cys(R266C) 取代,从而增加了成熟 TGF-β 结构域中半胱氨酸残基的数量。在 480 个对照 DNA 样本中未发现 R266C 突变。对转染的 COS-7 细胞裂解物进行蛋白质印迹分析,检测到胞浆中成熟 R266C 突变蛋白的量减少,且培养基中成熟 R266C 蛋白的量显着减少。作者还报告了一名欧洲男性,由近亲结婚生,患有孤立性小眼球和双侧缺损(MCOPCB6;613703),其 R266C 突变为杂合子。该人唯一的骨缺陷是右颞骨异常。叶等人(2010) 还描述了一对患有 MCOPCB6 的欧洲母女。母亲显示出 R266C 突变的杂合性,而她的女儿则显示出 GDF6 基因中 R266C 突变和 A199T 突变(601147.0007) 的双重杂合性。女儿表现出更严重的表型,包括眼球震颤、双侧虹膜缺损、严重缺损性小眼畸形和双侧中心凹发育不全。视力为20/200。MRI 显示视盘异常小,视神经直径减小,ERG 显示 a 和 b 波振幅减小。她的女儿在 GDF6 基因中表现出 R266C 突变和 A199T 突变(601147.0007) 的双重杂合性。女儿表现出更严重的表型,包括眼球震颤、双侧虹膜缺损、严重缺损性小眼畸形和双侧中心凹发育不全。视力为20/200。MRI 显示视盘异常小,视神经直径减小,ERG 显示 a 和 b 波振幅减小。她的女儿在 GDF6 基因中表现出 R266C 突变和 A199T 突变(601147.0007) 的双重杂合性。女儿表现出更严重的表型,包括眼球震颤、双侧虹膜缺损、严重缺损性小眼畸形和双侧中心凹发育不全。视力为20/200。MRI 显示视盘异常小,视神经直径减小,ERG 显示 a 和 b 波振幅减小。
.0002 小眼症,孤立 7
GDF3,LEU305PRO
叶等人(2010) 描述了一名亚洲男性,由近亲父母出生,患有单侧小眼症(MCOP7; 613704)。他的父亲没有眼睛异常。父子俩的 GDF3 基因中的 914T-C 转变都是杂合子,导致成熟结构域中由 leu305 变为 pro(L305P)。作者将表型的变异归因于不完全外显率,尽管不能排除双基因遗传。在 480 个对照 DNA 样本中未发现 L305P 突变。对转染的 COS-7 细胞裂解物进行蛋白质印迹分析,检测到胞浆中全长 L305P 突变蛋白的量略有减少,而培养基中成熟 L305P 蛋白的量显着减少。
.0003 小眼症,孤立的 7
GDF3,ARG195GLN
在一名患有单侧小眼症的欧洲女性(MCOP7; 613704) 中,Ye 等人(2010) 鉴定了 GDF3 基因中 584G-A 转变的杂合性,导致前原结构域中的 arg195 到 gln(R195Q) 取代,预计会导致电荷改变。在 480 个对照 DNA 样本中未发现 R195Q 突变。对转染的 COS-7 细胞裂解物进行蛋白质印迹分析,检测到全长 R195Q 突变蛋白的量略有减少,成熟 R195Q 蛋白的量明显减少。
.0004 小眼症,孤立,有 COLOBOMA 6
GDF3、ARG274TRP
Ye 等人发现,在一名近亲结婚的亚洲男性中,患有孤立性小眼畸形伴缺损(MCOPCB6; 613703)(2010) 鉴定了 GDF3 基因中的杂合 820C-T 转变,导致成熟结构域中的 arg274 到 trp(R274W) 取代。R274W突变将保守的亲水残基改变为疏水残基,并且在480个对照DNA样本中未发现该突变。