复制蛋白 A2,32-KD; RPA2
- RPA32
- REPA2
HGNC 批准的基因符号:RPA2
细胞遗传学定位:1p35.3 基因组坐标(GRCh38):1:27,891,524-27,914,797(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
复制蛋白 A(参见 RPA1;179835)是一种 3 亚基单链 DNA(ssDNA) 结合蛋白,已从人类细胞中分离出来,并被发现对于乳多空病毒 SV40 的体外复制至关重要。埃尔迪勒等人(1990) 从 HeLa 细胞 DNA 文库中克隆了 RPA 的 32 kD 亚基。开放解读码组预测蛋白质含有 270 个氨基酸,包括 N 末端蛋氨酸残基。N 末端区域尤其富含甘氨酸和丝氨酸。
▼ 生化特征
为了研究 RPA32 在多种 DNA 修复途径中的功能,Mer 等人(2000) 确定了人 RPA32 C 端区域(氨基酸 172 至 270)的 3 维溶液结构,包括游离的和与包含 UNG2(607752) RPA 结合区域(氨基酸 73 至 88)的 16 氨基酸肽片段复合的。高分辨率核磁共振成像表明 UNG2、XPA(191525) 和 RAD52(600392) 与 RPA32 的相互作用界面相似。作者提出了一种基于竞争的蛋白质开关机制,用于在 DNA 损伤位点组装必需的蛋白质。
▼ 基因功能
ATR(601215)-ATRIP(606605) 蛋白激酶复合物的功能对于细胞对复制应激和 DNA 损伤的反应至关重要。Zou 和 Elledge(2003) 证明,与单链 DNA(ssDNA) 结合的 RPA 复合物是 ATR 募集到 DNA 损伤位点以及人类细胞中 ATR 介导的 CHK1(603078) 激活所必需的。在体外,RPA 刺激 ATRIP 与单链 DNA 的结合。ATRIP 与 RPA 包被的单链 DNA 的结合使 ATR-ATRIP 复合物能够与 DNA 结合,并刺激与 DNA 结合的 RAD17(603139) 蛋白的磷酸化。此外,Ddc2(ATRIP 的芽殖酵母同源物)以 RPA 依赖性方式被特异性招募至双链 DNA 断裂。RPA 检查点缺陷突变体 rfa1-t11,在体内和体外将 Ddc2 募集至单链 DNA 方面都有缺陷。Zou 和 Elledge(2003) 得出结论,RPA 包被的单链 DNA 是 DNA 损伤位点的关键结构,它招募 ATR-ATRIP 复合物并促进其识别磷酸化底物和启动检查点信号传导。
激活诱导胞苷脱氨酶(AID; 605257) 是一种 ssDNA 脱氨酶,是免疫球蛋白基因体细胞超突变和类别转换重组所需的。类别转换重组涉及通过转换区域进行转录,从而在 R 环内生成 ssDNA。乔杜里等人(2004) 描述了 AID 靶向含有体细胞超突变基序的体外转录底物的机制。他们表明,AID 的靶向活性是由于 RPA,一种参与复制、重组和修复的 ssDNA 结合异嵌合蛋白。RPA 的 32-kD 亚基与来自活化 B 细胞的 AID 特异性相互作用,其方式似乎依赖于翻译后 AID 修饰。乔杜里等人(2004) 得出结论认为 RPA 是参与免疫球蛋白多样化的新因素,
李等人(2010) 发现含有 PPP4C(602035) 和 PPP4R2(613822) 的二聚体蛋白磷酸酶 4(PPP4) 复合物可使 RPA2 去磷酸化,调节其在 DNA 双链断裂反应中的作用。PPP4C 在体外有效地使磷酸-RPA2 去磷酸化。在人类细胞系中沉默 PPP4R2,或引入无法与 PPP4C 相互作用的 PPP4R2 突变体,会改变 RPA2 磷酸化的动力学和模式。PPP4R2 的耗尽通过必需因子 RAD51 的低效加载阻碍同源重组,导致 G2-M 检查点延长和对 DNA 损伤的超敏反应。表达拟磷酸化 RPA2 突变体的细胞具有相似的表型,表明 PPP4 介导的 RPA2 去磷酸化对于有效的 DNA 损伤反应是必要的。
▼ 测绘
Umbricht 等人使用来自啮齿动物-人类杂交细胞系的基因组 DNA 进行 PCR 扩增。Umbricht 等人(1993) 将 REPA2 基因定位到 1 号染色体。通过 PCR 扩增 1 号染色体的体细胞杂交体并通过荧光原位杂交,Umbricht 等人(1994) 将 RPA2 对应到 1p35。