微小RNA 10A; MIR10A

  • miRNA10A
  • MIRN10A

HGNC 批准的基因符号:MIR10A

细胞遗传学位置:17q21.32 基因组坐标(GRCh38):17:48,579,838-48,579,947(来自 NCBI)

▼ 说明

MicroRNA(miRNA),例如 MIRN10A,是 19 至 25 核苷酸的非编码 RNA,通过以序列特异性方式靶向 mRNA 来调节基因表达。 根据 miRNA 与其靶标之间的互补程度,它们可以诱导翻译抑制或 mRNA 降解(Garzon 等,2006)。

▼ 克隆与表达

Garzon 等人使用差异 miRNA 芯片分析(2006) 鉴定出 MIRN10A 是人类 CD34(142230) 阳性造血祖细胞分化为巨核细胞期间下调的 miRNA。 成熟的 MIRN10A 转录物包含 23 个核苷酸。

▼ 基因功能

通过 Northern blot 分析和实时 PCR,Garzon 等人(2006)证实了分化的巨核细胞中 MIRN10A 的下调。 他们发现 HOX1A(HOXA7; 142950) 蛋白和 mRNA 在巨核细胞分化过程中上调。 用 MIRN10A 前体转染人巨核细胞或骨髓性白血病细胞系,会降低含有 HOXA1 3-prime UTR 的报告基因的表达,并降低 HOXA1 蛋白水平。 MIRN10A 和 HOXA1 3-prime UTR 之间的互补性并不完美,表明 HOXA1 mRNA 是降解的目标。 加尔松等人(2006) 发现 MIRN10A 在 5 种白血病细胞系中表达上调。 MIRN10A 的表达与其 5 引物侧翼基因和 3 引物侧翼基因 HOXB4(142965) 和 HOXB5(142960) 的表达平行,分别表明存在共同的调控机制。

Garzon 等人通过 miRNA 表达谱分析(2008) 与没有 NPM1 突变的 AML 患者相比,在有 NPM1 突变(164040) 的急性髓系白血病(AML; 601626) 患者中鉴定出了 36 个上调和 21 个下调的 miRNA。 miR10A 和 miR10B(MIRN10B; 611576) 显示出最大的上调,分别增加了 20 倍和 16.67 倍。

Orom 等人使用基于亲和力的方法(2008) 从小鼠胚胎干细胞中分离出结合 miR10a 的 mRNA。 超过一半最富集的 mRNA 编码参与蛋白质合成的蛋白质,特别是核糖体蛋白质。 miR10a 结合编码非核糖体蛋白的 Pebp1(604591) 和 Ran(601179) 的 3 素 UTR,并抑制翻译。 相反,miR10a 结合编码核糖体蛋白的 Rpl13a(619225)、Rps16(603675) 和 Rps20(603682) 的 5-prime UTR,并减轻翻译抑制。 在这些转录本中,miR10a 特异性结合紧邻 5-prime TOP 基序下游的区域,该基序参与调节翻译。 小鼠成纤维细胞中 miR10a 的过度表达增加了蛋白质合成,并增加了集落形成测定中的集落数量,而内源性 miR10a 的抑制则减少了蛋白质合成并减少了集落形成单位的数量。 奥罗姆等人(2008) 得出结论,miR10A 通过模拟核糖体蛋白 mRNA 翻译来控制整体蛋白质合成。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Garzon 等人(2006) 将 MIRN10A 基因对应到 HOXB 基因簇内的染色体 17q21。 它位于 HOXB4 基因的 3 引物处和 HOXB5 基因的 5 引物处。