受体表达增强蛋白 6; REEP6
- 在息肉病 1-LIKE 1 中删除;DP1L1
- TB2-LIKE 1;TB2L1
- 19 号染色体开放解读码组 32;C19ORF32
HGNC 批准的基因符号:REEP6
细胞遗传学定位:19p13.3 基因组坐标(GRCh38):19:1,491,181-1,497,927(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
G 蛋白偶联受体(GPCR) 向细胞表面膜的转运对于受体-配体识别至关重要。然而,哺乳动物 GPCR 气味受体(OR) 在细胞中异源表达时,在细胞表面的表达较差。通过筛选诱导人胚胎肾细胞中表达的 OR 的细胞表面表达的基因,Saito 等人(2004) 鉴定了小鼠和人类 REEP1(609139)。他们在数据库中搜索了 REEP1 的同源物,并鉴定了其他几个 REEP 基因,包括 REEP6。小鼠嗅上皮的原位杂交显示 Reep6 在支持细胞中表达,但在嗅觉神经元中不表达。
Sato 等人通过消减杂交来鉴定视网膜中表达的新小鼠基因(2005)克隆了Dp1l1。推导的 201 个氨基酸蛋白与小鼠和人类 DP1(DP1; 125265) 具有 57% 的同一性。Northern blot分析检测到Dp1l1在小鼠视网膜和肝脏中高表达,在肾脏和睾丸中表达较低,RT-PCR显示在脾和肺中低表达。大脑中未检测到表达。原位杂交和免疫组织化学分析表明,Dp1l1 mRNA 和蛋白大量存在于视网膜神经节细胞(RGC) 中。Dp1l1 以点状形式存在于细胞质中。佐藤等人(2005) 得出结论,Dp1l1 是一种膜蛋白,可能在 RGC 的细胞内膜转移中发挥作用。
郝等人(2014) 发现了小鼠 Reep6 的剪接变体,他们将其称为 Reep6.1,该变体在发育和成熟的视杆光感受器中特异性表达,但在肝脏中不表达。Reep6.1 包含外显子 5,它编码额外的 27 个残基线圈和环结构。Reep6.2 亚型缺乏外显子 5,在视网膜发育的早期阶段和肝脏中表达。这两种变体均未在大脑中表达。
Arno 等人通过 RT-PCR 在人类诱导多能干细胞衍生的 3D 类器官视杯中进行了研究(2016) 观察到 REEP6.1 同工型的表达与光感受器发育的时间进程相关,并且 REEP6.1 是成熟视杯中存在的主要同工型(75%)。REEP6免疫反应性仅限于发育中的人视杆细胞感光细胞的细胞体和内节,并且在视杆外节或视锥细胞感光细胞中未检测到。
▼ 测绘
Hartz(2017) 根据 REEP6 序列(GenBank AK058112) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 REEP6 基因对应到染色体 19p13.3。
通过辐射混合分析,Sato 等人(2005) 将小鼠 Dp1l1 基因定位到 10 号染色体上的一个区域,该区域显示出与人类染色体 19p13.3 同线性的同源性。
▼ 基因功能
缺乏 Nrl 基因(162080) 的小鼠视网膜杆发育不完整或缺失,并且 S 锥光感受器显着增强。郝等人(2014) 发现发育中和成年 Nrl -/- 小鼠缺乏 Reep6.1 的视网膜表达,而 Reep6.2 在早期视网膜和肝脏中表达完整。郝等人(2014) 表明 Nrl 结合 Reep6 内含子 1 中的增强子元件,并与 Nono(300084) 一起促进外显子 5 包含在 Reep6.1 转录本中。Nrl 对 Reep6.2 转录物的表达没有影响。
▼ 分子遗传学
Arno 等人在来自 5 个无关家族的 7 名患有常染色体隐性遗传色素性视网膜炎(RP77; 617304) 的患者中(2016)鉴定了REEP6基因突变的纯合性或复合杂合性(参见例如609346.0001-609346.0004)。
▼ 动物模型
郝等人(2014) 发现通过反义吗啉在斑马鱼中敲低 Reep6 表达会损害眼睛发育并导致异常的视网膜分层。通过短发夹 RNA 的电穿孔在新生小鼠视网膜中敲低 Reep6 似乎会导致感光细胞死亡。
阿诺等人(2016) 建立了 Reep6 L135P 的小鼠敲入模型(见 609346.0001),并观察到纯合敲入小鼠具有存活力和生育能力,并且没有表现出明显的形态异常。纯合突变体视网膜的组织学分析显示,在 4 个月大时,厚度和形态发生了微妙的变化,到 6 个月大时,与杂合同窝出生的杂合突变体相比,纯合突变体的外核层显着变薄,核排数减少。SD-OCT 视网膜实时成像证实了这些发现。透射电子显微镜显示,出生后 20 天时,纯合子的视网膜层组织呈现正常外观,但与杂合子相比,纯合子在 6 个月大时,内层和外层的严重改变变得明显。4 个月大的纯合 L135P 敲入小鼠的电生理分析显示,与杂合子同窝对照小鼠相比,全视野暗视视网膜电图(ERG) 上的视锥细胞活动正常,但 a 波和 b 波减少;6 个月大时,纯合子的 ERG 反应进一步降低。阿诺等人(2016) 指出这些发现与视杆细胞感光功能障碍一致。
▼ 等位基因变异体(4 个选定示例):
.0001 色素性视网膜炎 77
REEP6、LEU135PRO
在一名患有色素性视网膜炎(RP77; 617304) 的 35 岁亚洲男性(EG76 家族)中,Arno 等人(2016) 鉴定了 REEP6 基因中的复合杂合突变:外显子 4 中的 c.404T-C 转变(c.404T-C, NM_138393.1),导致 leu135 到 pro(L135P) 取代,以及外显子 4 中的 1 bp 缺失(c.448delG;609346.0002),导致预计会导致的移码提前终止密码子(Ala150ProfsTer2)。在内部对照或公共变异数据库(包括 ExAC)中均未发现这两种突变。对人 SK-N-SH 神经母细胞瘤细胞稳态表达的分析显示,与野生型相比,L135P 突变体的蛋白质水平较低。阿诺等人(2016) 建立了 Reep6 L135P 的小鼠敲入模型,并观察到与杂合子同窝对照相比,纯合子中视杆光感受器功能和存活率逐渐丧失。
.0002 色素性视网膜炎 77
REEP6,1-BP DEL,448G
讨论 REEP6 基因外显子 4 中的 1-bp 缺失(c.448delG, NM_138393.1),导致移码,预计会导致提前终止密码子(Ala150ProfsTer2),Arno 等人在色素性视网膜炎患者(RP77; 617304) 的复合杂合状态中发现了这种情况(2016),参见 609346.0001。
.0003 色素性视网膜炎 77
REEP6,1-BP DUP,557C
Arno 等人对一名来自苏丹近亲家庭(GC18419 家族)的 54 岁男性患有色素性视网膜炎(RP77;617304)进行了研究(2016) 在视网膜特异性 REEP6.1 转录物的外显子 5 中鉴定出 1 bp 重复(c.577dupC, NM_001329556.1) 的纯合性,导致预计会导致过早终止密码子(Val187GlyfsTer131) 的移码(该变体是规范 REEP6 转录本 REEP6.2 中的内含子(c.517+177dup)。)该突变以纯合性形式存在于受影响的兄弟中,但在约 1,000 名个体的内部对照数据集中或外显子组测序计划或 1000 基因组计划(第 1 阶段)数据库中未发现。
.0004 色素性视网膜炎 77
REEP6, PRO128LEU
在一名来自伊朗近亲家庭(GC20277 家族)的 32 岁男性中,患有色素性视网膜炎(RP77;617304),Arno 等人(2016) 鉴定了 REEP6 基因外显子 4 中 c.383C-T 转换(c.383C-T, NM_138393.1) 的杂合性,导致保守残基处 pro128 到 leu(P128L) 取代。ExAC 数据库中未发现该突变。对人 SK-N-SH 神经母细胞瘤细胞稳态表达的分析显示,与野生型相比,P128L 突变体的蛋白质水平较低。