SCHLAFEN 家族,成员 5; SLFN5

HGNC 批准的基因符号:SLFN5

细胞遗传学位置:17q12 基因组坐标(GRCh38):17:35,243,072-35,273,655(来自 NCBI)

▼ 说明

Schlafen(SLFN) 家族包含 9 个小鼠基因和 6 个人类基因,这些基因编码具有保守 N 末端的蛋白质,其中包含推定的 AAA ATP 酶结构域。较长的 SLFN 蛋白,例如 SLFN5,具有类似于 DNA/RNA 解旋酶结构域的 C 端基序。小鼠研究表明 SLFN 蛋白参与细胞生长和 T 细胞发育的调节(Geserick 等人(2004) 和 Li 等人(2012) 总结)。

▼ 克隆与表达

通过数据库分析,Schwarz 等人(1998) 鉴定了人类 SLFN5 的部分序列。

格塞里克等人(2004) 鉴定了小鼠 Slfn5。推导的 884 个氨基酸的小鼠 Slfn5 蛋白包含与 DNA/RNA 解旋酶同源的 C 端基序。

Li 等人使用定量 RT-PCR(2012) 表明 SLFN5 和 SLFN11(614953) 是几种人类细胞系中表达最显着的 SLFN 家族成员。

▼ 基因功能

Geserick 等人使用 Northern blot 分析(2004) 在单核细胞增多性李斯特菌感染的小鼠脾细胞中检测到大多数 SLFN 基因的表达,包括 Slfn5,而在未感染的小鼠细胞中很少或没有表达。Slfn5、Slfn8、Slfn9 和 Slfn10 上调需要 Ifngr(107470)。进一步分析表明,小鼠 SLFN 在胸腺细胞发育过程中、在活化的外周 T 细胞中、在脂多糖(LPS) 或干扰素 γ(IFNG;147570) 活化的巨噬细胞中或在 M1 白血病细胞的终末骨髓分化过程中受到差异性调节。小鼠中的转基因表达表明,Slfn8 的表达失调会对胸腺细胞发育产生负面影响,并损害外周 T 细胞对 T 细胞受体(参见 186880)介导的刺激的反应。格塞里克等人。

李等人(2012) 指出,感染布鲁氏菌或李斯特菌后,小鼠 SLFN 蛋白水平升高。他们使用定量 RT-PCR 表明,LPS、poly-IC 或干扰素(IFN)-α(147660)/β(147640) 处理小鼠巨噬细胞可诱导多个 SLFN 基因的产生。用 IFN-β、poly-IC 或 poly-dAdT 处理人包皮成纤维细胞显示出类似的 SLFN 基因诱导作用,包括 SLFN5 和 SLFN11。

▼ 测绘

Gross(2012) 根据 SLFN5 序列(GenBank BC021238) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 SLFN5 基因定位到染色体 17q12。

布斯托斯等人(2009) 发现,在所检查的所有哺乳动物基因组中,SLFN 基因聚集在同一直系同源区域内,两侧是 UNC45(UNC45B; 611220) 和 PEX12(601758) 基因。人类和小鼠的 SLFN 簇分别位于 17 号和 11 号染色体上。

▼ 进化

布斯托斯等人(2009) 使用基因组和系统发育研究来研究 SLFN 基因家族的进化和作用。他们发现SLFN家族广泛分布在哺乳动物中,有4个主要分支,它们以不同的目的经历了谱系特异性的扩张或收缩,包括灵长类动物和啮齿类动物。布斯托斯等人(2009) 还鉴定了软骨鱼和两栖动物中的 SLFN 家族成员。他们发现证据表明正选择作用于许多 SLFN 基因。SLFN 家族的一个成员从小鼠水平转移到正痘病毒,作者假设它在使病毒能够存活于宿主防御机制中发挥着作用。病毒 SLFN 序列在纯化选择下不断进化,表明它们的功能相关性。

范·祖伦等人(2011) 指出,只有 2 个 SLFN 家族成员 SLFN5 和 SLFN14 在小鼠和人类中具有直接直系同源物,这与 SLFN 家族在哺乳动物物种中的快速进化一致。人 SLFN12 和 SLFN12L 在小鼠中具有 4 个直向同源物(Slfn1、Slfn2、Slfn3 和 Slfn4),人 SLFN11 和 SLFN13 在小鼠中具有 3 个直向同源物(Slfn8、Slfn9 和 Slfn10)。