CUGBP 和 ELAV 家族,成员 6; CELF6
- BRUNO-LIKE 6; BRUNOL6
- CUGBP 和 ETR3 样因子 6
HGNC 批准的基因符号:CELF6
细胞遗传学定位:15q23 基因组坐标(GRCh38):15:72,284,727-72,320,157(来自 NCBI)
▼ 说明
CELF 家族的成员,例如 CELF6,在共转录和转录后 RNA 加工中发挥各种作用。 所有 CELF 蛋白似乎都会影响前 mRNA 剪接,但各个 CELF 在调节 mRNA 稳定性和翻译方面具有不同的作用(Wagnon 等人总结,2012)。
▼ 克隆与表达
通过在数据库中搜索与 Xenopus Brunol1(TNRC4; 612678) 相似的人类序列,Good 等人(2000) 确定了 BRUNOL6。 推导的蛋白质包含 2 个 N 端结构域 RNA 识别基序(RRM)、一个长接头区域和一个 C 端 RRM。
Ladd 等人通过从 CELF 样蛋白中搜索基因组序列,然后对人脑 cDNA 文库进行 PCR(2004) 克隆了全长 BRUNOL6,他们将其称为 CELF6。 推导的 481 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 50.4 kD。 CELF6 具有 3 个 RRM,其中有 268 个氨基酸的不同结构域分隔 RRM2 和 RRM3。 它还具有许多潜在的磷酸化位点、C 末端的潜在核定位信号以及分歧结构域内的富含丙氨酸的区域。 拉德等人(2004) 还鉴定了 CELF6 的 3 个剪接变体,与全长 CELF6(isoform-1)相比,它们编码 C 端截短的蛋白质。 Isoform-2 包含 RRM1 和部分 RRM2,isoform-3(最短的异构体)仅包含 RRM1,isoform-4 包含 RRM1、RRM2 和部分分歧结构域。 Northern blot 分析检测到 7.5 kb 和 4.0 kb 的转录物分别在肾脏和大脑中大量表达。 这两种变体在其他几个组织中均检测到低水平。 RNA点印迹分析显示,CELF6在成人肾脏、大脑和睾丸中表达最高,而在大多数其他组织中表达较低。 CELF6在胎儿大脑中检测到,但在胎儿肾脏中仅检测到低表达。 Western blot分析显示,全长CELF6、isoform-2和isoform-4在转染的鹌鹑成纤维细胞中表达,但未检测到isoform-3,显然是由于蛋白质不稳定。
▼ 基因功能
CELF 蛋白(例如 TNRC4;612678)通过肌肉特异性剪接增强子(MSE)序列促进体内心肌肌钙蛋白 T(TNNT2;191045)小基因的活性外显子包含。 拉德等人(2004) 表明全长 CELF6、isoform-2 和 isoform-4 以剂量和异构体依赖性方式促进这些小基因的外显子包含。 全长 CELF6 还以剂量依赖性方式促进胰岛素受体(INSR; 147670) 外显子 11 跳跃,与 CUGBP(601074) 类似,而 CELF6 isoform-4 显示较弱的外显子跳跃潜力,isoform-2 无影响。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Good 等人(2000) 将 BRUNOL6 基因对应到染色体 15q24。